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李虹
Life Science
中国科学院大学
上海
Language: 中文, 英语
计算生物学
生物信息学
肿瘤系统生物学
基因组学
转录组学
药物基因组学
肝细胞癌
深度学习
药物反应预测
单细胞分析
Areas of Focus
- 计算生物学 - 生物信息学
- 肿瘤系统生物学
Work Experience
- 2019-12到2023-05 - 中国科学院上海营养与健康研究所 - 研究员
- 2014-12到2019-11 - 中国科学院上海生命科学研究院 - 副研究员
- 2013-10到2014-11 - 中国科学院上海生命科学研究院 - 助理研究员
- 2010-09到2013-08 - 美国系统生物学研究所 - 博士后
Academic Background & Achievements
- 2005-09到2010-06 理学博士: 中国科学院上海生命科学研究院
- 2001-09到2005-06 理学学士: 中南大学
Publications
- Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology., Hepatology, 2023
- Kupffer-cell-derived IL-6 is repurposed for hepatocyte dedifferentiation via activating progenitor genes from injury-specific enhancers, CELL STEM CELL, 2023
- A systematic assessment of deep learning methods for drug response prediction: from in vitro to clinical applications, BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022
- Large-scale pharmacogenomic studies and drug response prediction for personalized cancer medicine, JOURNAL OF GENETICS AND GENOMICS, 2021
- Integrated genomic and transcriptomic analysis reveals unique characteristics of hepatic metastases and pro-metastatic role of complement C1q in pancreatic ductal adenocarcinoma, GENOME BIOLOGY, 2020
- Integrative analysis reveals novel driver genes and molecular subclasses of hepatocellular carcinoma, AGING (ALBANY NY), 2020
- A Pharmacogenomic Landscape in Human Liver Cancers, CANCER CELL, 2019
- A Homeostatic Arid1a-Dependent Permissive Chromatin State Licenses Hepatocyte Responsiveness to Liver-Injury-Associated YAP Signaling, CELL STEM CELL, 2019
- Integrative analysis of DNA methylation and gene expression reveals hepatocellular carcinoma-specific diagnostic biomarkers, GENOME MEDICINE, 2018
Awards
- 中国细胞生物学学会生命科学青年女科学家职业发展基金（B类）(2023): 其他
- 上海市科技系统“三八红旗手”(2023): 市地级
- 上海市科技系统“青年五四奖章”(2021): 市地级
- 赛诺菲－中国科学院上海生命科学研究院优秀青年人才奖(2019): 研究所（学校）
- 上海市自然科学奖一等奖(2014): 市地级
