Professor | 杨焕明 | 数字化转型顾问

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Name	杨焕明
Contact Information	yanghm@genomics.org.cn
Language ability	中文, 英语
Province	广东

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Name

杨焕明

Contact Information

yanghm@genomics.org.cn

Language ability

中文, 英语

Province

广东

University/Lab Affiliation and Title	中国科学院大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	1984-06--1988-09 博士: 丹麦哥本哈根大学医学遗传研究所 1979-09--1982-06 硕士: 中国南京铁道医学院生物系
Work Experience	2012-04~2013-05 - 深圳华大基因研究院华大基因学院 - 院长 2007-09~2012-06 - 深圳华大基因研究院 - 理事长兼董事 1998-09~2003-06 - 中国科学院遗传与发育生物学研究所人类基因组中心 - 主任、博导 1992-05~1994-05 - 美国洛杉矶加州大学（UCLA）医学院 - 博士后 1990-04~1992-04 - 美国波士顿哈佛医学院 - 博士后 1988-04~1990-04 - 法国INSERM-CNRS马赛免疫中心人类分子遗传学实验室 - 博士后 1982-09~1984-09 - 中国南京铁道医学院生物系 - 讲师
Awards	2012 年度广东省科学技术奖自然科学类二等奖：第一个亚洲人基因组, 省级, 2013 2012年度深圳市科学技术奖自然科学奖二等奖：人体内脏元基因组研究, 市地级, 2013 2013年全国优秀科普作品, 国家级, 2013 国家科学技术进步奖, 二等奖, 国家级, 2012 杨焕明院士编著的《“天”生与“人”生：生殖与克隆》, 国家级, 2011 深圳经济特区30年30位杰出人物之“杰出创新人物”, 市地级, 2010 2008年深圳市科技创新奖-炎黄Ⅰ号-第一个亚洲人基因组, 市地级, 2009

University/Lab Affiliation and Title

中国科学院大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

1984-06--1988-09 博士: 丹麦哥本哈根大学医学遗传研究所
1979-09--1982-06 硕士: 中国南京铁道医学院生物系

Work Experience

2012-04~2013-05 - 深圳华大基因研究院华大基因学院 - 院长
2007-09~2012-06 - 深圳华大基因研究院 - 理事长兼董事
1998-09~2003-06 - 中国科学院遗传与发育生物学研究所人类基因组中心 - 主任、博导
1992-05~1994-05 - 美国洛杉矶加州大学（UCLA）医学院 - 博士后
1990-04~1992-04 - 美国波士顿哈佛医学院 - 博士后
1988-04~1990-04 - 法国INSERM-CNRS马赛免疫中心人类分子遗传学实验室 - 博士后
1982-09~1984-09 - 中国南京铁道医学院生物系 - 讲师

Awards

2012 年度广东省科学技术奖自然科学类二等奖：第一个亚洲人基因组, 省级, 2013
2012年度深圳市科学技术奖自然科学奖二等奖：人体内脏元基因组研究, 市地级, 2013
2013年全国优秀科普作品, 国家级, 2013
国家科学技术进步奖, 二等奖, 国家级, 2012
杨焕明院士编著的《“天”生与“人”生：生殖与克隆》, 国家级, 2011
深圳经济特区30年30位杰出人物之“杰出创新人物”, 市地级, 2010
2008年深圳市科技创新奖-炎黄Ⅰ号-第一个亚洲人基因组, 市地级, 2009

Areas of Focus	人类基因组计划人类单体型图计划国际癌症基因组计划亚洲人基因组人类泛基因组肠道Meta基因组植物基因组动物基因组微生物基因组
Publications	蛋白质-蛋白质相互作用的分层图学习, 高子琪, 江晨然, 张家文, 江晓森, 李兰青, 赵佩琳, 杨焕明, 黄勇, 李佳, 2023 结合卷积和自注意力改进人类基因组语言模型以解释碱基分辨率的非编码区域, 杨萌, 黄立超, 黄海平, 唐辉, 张楠, 杨焕明, 吴继红, 穆峰, 2022 基于3,366个基因组测序的鹰嘴豆遗传变异图谱, Varshney, Rajeev K, Roorkiwal, Manish, Sun, Shuai, Bajaj, Prasad, Chitikineni, Annapurna, Thudi, Mahendar, Singh, Narendra P, Du, Xiao, Upadhyaya, Hari D, Khan, Aamir W, Wang, Yue, Garg, Vanika, Fan, Guangyi, Cowling, Wallace A, Crossa, Jose, Gentzbittel, Laurent, VossFels, Kai Peter, Valluri, Vinod Kumar, Sinha, Pallavi, Singh, Vikas K, Ben, Cecile, Rathore, Abhishek, Punna, Ramu, Singh, Muneendra K, Taran, Bunyamin, Bharadwaj, Chellapilla, Yasin, Mohammad, Pithia, Motisagar S, Singh, Servejeet, Soren, Khela Ram, Kudapa, Himabindu, Jarquin, Diego, Cubry, Philippe, Hickey, Lee T, Dixit, Girish Prasad, Thuillet, AnneCeline, Hamwieh, Aladdin, Kumar, Shiv, Deokar, Amit A, Chaturvedi, Sushil K, Francis, Aleena, Howard, Reka, Chattopadhyay, Debasis, Edwards, David, Lyons, Eric, Vigouroux, Yves, Hayes, Ben J, von Wettberg, Eric, Datta, Swapan K, Yang, Huanming, Nguyen, Henry T, Wang, Jian, Siddique, Kadambot H M, Mohapatra, Trilochan, Bennetzen, Jeffrey L, Xu, Xun, Liu, Xin, 2021 stLFRsv：使用共条码读取的生殖系结构变异分析管道, 郭俊夫, 施畅, 陈曦, 王欧, 刘平, 杨焕明, 徐讯, 张文伟, 朱红梅, 2021 人类皮肤耐药组的特征及两种微生物群型的鉴定, 李志明, 夏晶晶, 江柳依, 谭一梅, 安一泰, 朱星宇, 阮杰, 陈志华, 甄和福, 马艳云, 解竹叶, 肖亮, 杨焕明, 王建, Kristiansen, Karsten, 徐讯, 金力, 聂超, Krutmann, Jean, 刘晓, 王久存, 2021

Areas of Focus

人类基因组计划
人类单体型图计划
国际癌症基因组计划
亚洲人基因组
人类泛基因组
肠道Meta基因组
植物基因组
动物基因组
微生物基因组

Publications

蛋白质-蛋白质相互作用的分层图学习, 高子琪, 江晨然, 张家文, 江晓森, 李兰青, 赵佩琳, 杨焕明, 黄勇, 李佳, 2023
结合卷积和自注意力改进人类基因组语言模型以解释碱基分辨率的非编码区域, 杨萌, 黄立超, 黄海平, 唐辉, 张楠, 杨焕明, 吴继红, 穆峰, 2022
基于3,366个基因组测序的鹰嘴豆遗传变异图谱, Varshney, Rajeev K, Roorkiwal, Manish, Sun, Shuai, Bajaj, Prasad, Chitikineni, Annapurna, Thudi, Mahendar, Singh, Narendra P, Du, Xiao, Upadhyaya, Hari D, Khan, Aamir W, Wang, Yue, Garg, Vanika, Fan, Guangyi, Cowling, Wallace A, Crossa, Jose, Gentzbittel, Laurent, VossFels, Kai Peter, Valluri, Vinod Kumar, Sinha, Pallavi, Singh, Vikas K, Ben, Cecile, Rathore, Abhishek, Punna, Ramu, Singh, Muneendra K, Taran, Bunyamin, Bharadwaj, Chellapilla, Yasin, Mohammad, Pithia, Motisagar S, Singh, Servejeet, Soren, Khela Ram, Kudapa, Himabindu, Jarquin, Diego, Cubry, Philippe, Hickey, Lee T, Dixit, Girish Prasad, Thuillet, AnneCeline, Hamwieh, Aladdin, Kumar, Shiv, Deokar, Amit A, Chaturvedi, Sushil K, Francis, Aleena, Howard, Reka, Chattopadhyay, Debasis, Edwards, David, Lyons, Eric, Vigouroux, Yves, Hayes, Ben J, von Wettberg, Eric, Datta, Swapan K, Yang, Huanming, Nguyen, Henry T, Wang, Jian, Siddique, Kadambot H M, Mohapatra, Trilochan, Bennetzen, Jeffrey L, Xu, Xun, Liu, Xin, 2021
stLFRsv：使用共条码读取的生殖系结构变异分析管道, 郭俊夫, 施畅, 陈曦, 王欧, 刘平, 杨焕明, 徐讯, 张文伟, 朱红梅, 2021
人类皮肤耐药组的特征及两种微生物群型的鉴定, 李志明, 夏晶晶, 江柳依, 谭一梅, 安一泰, 朱星宇, 阮杰, 陈志华, 甄和福, 马艳云, 解竹叶, 肖亮, 杨焕明, 王建, Kristiansen, Karsten, 徐讯, 金力, 聂超, Krutmann, Jean, 刘晓, 王久存, 2021

基因组学人类基因组癌症基因组单体型图泛基因组 Meta基因组植物基因组学动物基因组学微生物基因组学基因组测序

王一 - 复旦大学

张锋 - 复旦大学

张泽民 - 北京大学

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