Areas of Focus
- 生物信息学
- 计算转录组学
- 重复序列调控基因表达
- 非编码RNA转录加工及功能
- 多组学高通量数据整合及计算生物学算法开发
Work Experience
- 2016-2020 - 美国麻省大学医学院博士后研究员
- 2020至今 - 同济大学生命科学与技术学院教授
Academic Background & Achievements
- 2011年 - 华中农业大学生物工程学士学位
- 2011年 - 华中科技大学计算机科学与技术学士学位
- 2016年 - 中国科学院上海生命科学研究院计算生物学博士学位
- 入选国家海外高层次人才引进计划青年项目
Publications
- TE-TSS: 人类和小鼠转座元素(TE)衍生的转录起始位点(TSS)的综合数据资源, 顾X, 王M, 张晓鸥†, 2024
- BCL2是维持小鼠胚胎干细胞单倍体的主要调节因子, 孙S*, 赵Q*, 赵Y, 耿M, 王Q, 高Q, 张晓鸥†, 张W†, 隋L†, 2023
- 探讨SINEs在人类基因组中的潜在作用, 张晓鸥, 普拉特HE, 翁Z†, 2021
- 全面识别人类组织转录组中的替代性回环剪接, 张P*, 张晓鸥*, 蒋T, 蔡L, 黄X, 刘Q, 李D, 陆A, 刘Y, 薛W, 张P†, 翁Z†, 2020
- 聚合酶III转录的Alu元素的全基因组分析表明其具有细胞类型特异性增强子功能, 张晓鸥, Gingeras TR, 翁Z†, 2019
- 人类细胞中Pol II转录延伸期间递归剪接的时间景观, 张晓鸥, 付Y, 牟H, 薛W, 翁Z†, 2018
- 环状RNA的多样化替代性回环剪接和替代性剪接景观, 张晓鸥*, 董R*, 张Y, 张JL, 罗Z, 张J, 陈LL†, 杨L†, 2016
- 互补序列介导的外显子环化, 张晓鸥*, 王HB*, 张Y, 卢X, 陈LL†, 杨L†, 2014
- 物种特异性替代性剪接导致sno-lncRNAs的独特表达, 张晓鸥*, 尹QF*, 王HB, 张Y, 陈T, 郑P, 卢X, 陈LL†, 杨L†, 2014
- 环状内含子长非编码RNA, 张Y*, 张晓鸥*, 陈T, 向JF, 尹QF, 邢YH, 朱S, 杨L†, 陈LL†, 2013
Awards
- 吴瑞奖学金
- 中国科学院院长特别奖
- 中国科学院优秀博士论文奖
- 必和必拓奖学金
- 邹承鲁杰出研究论文奖
