Professor | 张晓鸥 | 数字化转型顾问

Name

张晓鸥

Contact Information

zhangxiaoou@tongji.edu.cn

Language ability

中文, 英语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	同济大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	2011年 - 华中农业大学生物工程学士学位 2011年 - 华中科技大学计算机科学与技术学士学位 2016年 - 中国科学院上海生命科学研究院计算生物学博士学位入选国家海外高层次人才引进计划青年项目
Work Experience	2016-2020 - 美国麻省大学医学院博士后研究员 2020至今 - 同济大学生命科学与技术学院教授
Awards	吴瑞奖学金中国科学院院长特别奖中国科学院优秀博士论文奖必和必拓奖学金邹承鲁杰出研究论文奖

University/Lab Affiliation and Title

同济大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

Work Experience

Awards

Areas of Focus	生物信息学计算转录组学重复序列调控基因表达非编码RNA转录加工及功能多组学高通量数据整合及计算生物学算法开发
Publications	TE-TSS: 人类和小鼠转座元素(TE)衍生的转录起始位点(TSS)的综合数据资源, 顾X, 王M, 张晓鸥†, 2024 BCL2是维持小鼠胚胎干细胞单倍体的主要调节因子, 孙S, 赵Q, 赵Y, 耿M, 王Q, 高Q, 张晓鸥†, 张W†, 隋L†, 2023 探讨SINEs在人类基因组中的潜在作用, 张晓鸥, 普拉特HE, 翁Z†, 2021 全面识别人类组织转录组中的替代性回环剪接, 张P, 张晓鸥, 蒋T, 蔡L, 黄X, 刘Q, 李D, 陆A, 刘Y, 薛W, 张P†, 翁Z†, 2020 聚合酶III转录的Alu元素的全基因组分析表明其具有细胞类型特异性增强子功能, 张晓鸥, Gingeras TR, 翁Z†, 2019 人类细胞中Pol II转录延伸期间递归剪接的时间景观, 张晓鸥, 付Y, 牟H, 薛W, 翁Z†, 2018 环状RNA的多样化替代性回环剪接和替代性剪接景观, 张晓鸥, 董R, 张Y, 张JL, 罗Z, 张J, 陈LL†, 杨L†, 2016 互补序列介导的外显子环化, 张晓鸥, 王HB, 张Y, 卢X, 陈LL†, 杨L†, 2014 物种特异性替代性剪接导致sno-lncRNAs的独特表达, 张晓鸥, 尹QF, 王HB, 张Y, 陈T, 郑P, 卢X, 陈LL†, 杨L†, 2014 环状内含子长非编码RNA, 张Y, 张晓鸥, 陈T, 向JF, 尹QF, 邢YH, 朱S, 杨L†, 陈LL†, 2013

Areas of Focus

生物信息学
计算转录组学
重复序列调控基因表达
非编码RNA转录加工及功能
多组学高通量数据整合及计算生物学算法开发

Publications

生物信息学转录组学基因调控重复序列非编码Rna 转录功能多组学高通量计算生物学

石婷 - 上海交通大学

Area of Focus
酶 | 催化 | 机制 | 计算 | 生物学 | 生物信息学 | 分析 | 结构 | 功能 | 药物设计

张晓鸥 - 同济大学

张晓明 - 中国科学院大学

Area of Focus
非编码Rna | 抗性 | 细胞器 | 互作 | 机制 | 植物 | 病原体 | 媒介 | 功能 | 反应

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