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张一婧
Life Science
复旦大学
上海
Language: 英语, 中文
植物生物信息学
合成生物学
转座子
多倍体进化
表观基因组学
染色质结构
基因挖掘
莱茵衣藻
人类营养
蛋白质合成
Areas of Focus
- 植物生物信息与合成生物学
Work Experience
- 2008-2013 - 博士后研究员: 中国农业大学, 波士顿大学, 哈佛医学院
- 2013-2021 - 课题组长: 中国科学院上海植物生理生态研究所
- 2021-至今 - 课题组长: 复旦大学生命科学学院
Academic Background & Achievements
- 2003 - 学士: 中国海洋大学
- 2008 - 博士: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
- 作为通讯作者在国际学术期刊如Nature Communications, Genome Research, Plant Cell, Genome Biology和Nucleic Acids Research上发表了20余篇论文
Publications
- 转座子在普通小麦亚基因组趋同和发散转录中的作用, 张一婧#, 李志#, 刘杰#, 张一婧#, 叶磊#, 彭宇, 王浩, 刁红, 马玉, 王明, 谢勇, 唐涛, 庄毅, 滕伟, 童玉, 张伟, 郎志*, 薛勇*, 张一婧*, 2022
- Wheat-RegNet: 普通小麦分层调控网络百科全书, 唐涛#, 田世#, 王浩#, 吕晓#, 谢勇, 刘杰, 王明, 赵飞, 张伟*, 李华*, 张一婧*, 2022
- 通过系特异性转座子进化重组小麦转录调控网络, 张一婧#, 李志#, 张一婧#, 林凯#, 彭宇, 叶磊, 庄毅, 王明, 谢勇, 郭军, 滕伟, 童玉, 张伟*, 薛勇*, 郎志*, 张一婧*, 2021
- 小麦表观遗传调控元件图谱揭示了亚基因组在发育和应激反应调控中的分化, 王明#, 李志#, 张一婧#, 张一婧#, 谢勇, 叶磊, 庄毅, 林凯, 赵飞, 郭军, 滕伟, 张伟, 童玉, 薛勇*, 张一婧*, 2021
- 六倍体小麦中的同源介导的染色体间相互作用导致多倍化和引入后的特定亚基因组领地, 贾杰#, 谢勇#, 程杰#, 孔超#, 王明, 高磊, 赵飞, 郭军, 王凯, 李刚, 崔东, 胡涛, 赵刚*, 王东*, 茹志*, 张一婧*, 2021
- Plant Regulomics: 一个从植物多组学数据中检索上游调控因子的基于数据驱动的界面, 冉晓#, 赵飞#, 王宇#, 刘杰, 庄毅, 叶磊, 齐明, 程杰, 张一婧*, 2020
- 面包小麦表观基因组图谱揭示了功能基因元件的独特染色质结构和进化特征, 李志#, 王明#, 林凯#, 谢勇#, 郭军, 叶磊, 庄毅, 滕伟, 冉晓, 童玉, 薛勇, 张伟*, 张一婧*, 2019
- Polycomb抑制复合体2减弱ABA诱导的拟南芥衰老, 刘成#, 程杰#, 庄毅, 叶磊, 李志, 王宇, 齐明, 徐磊, 张一婧*, 2019
- Telobox基序通过TRB因子在拟南芥中招募CLF/SWN-PRC2进行H3K27me3沉积, 周悦, 王悦君, 克里斯汀·克劳斯, 杨婷婷, 乔拉姆·A·东古斯, 张一婧和弗朗齐斯卡·图尔克*, 2018
- CGT-seq: 表观基因组指导的核心基因组从大基因组的不同种群中去新组装, 齐明#, 李志#, 刘成#, 胡伟, 叶磊, 谢勇, 庄毅, 赵飞, 滕伟, 郑强, 范志, 徐磊, 郎志, 童玉*, 张一婧*, 2018
- 拟南芥花和胚胎发育基因在幼苗中被不同组合的Polycomb组蛋白与不同的顺式调控元件组合抑制, 王浩#, 刘成#, 程杰#, 刘杰, 张磊, 何超, 沈伟, 金浩*, 徐磊*, 张一婧*, 2016
- CARMO: 一个全面的注释平台，用于水稻多组学数据的功能探索, 王杰#, 齐明#, 刘杰#, 张一婧*, 2015
- MAnorm: 一个用于ChIP-Seq数据集定量比较的稳健模型, 邵志#, 张一婧#, 袁刚, 奥金S*, 瓦克斯曼D*, 2012
Awards
- 2021 - 国家自然科学基金委/优秀青年基金项目资助
- 2015 - 上海市科技人才计划项目/浦江人才计划
- 2014 - 中国科学院上海生命科学院特殊（S类）人才计划
