Professor | 石乐明 | 数字化转型顾问

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Name

石乐明

Contact Information

lemingshi@fudan.edu.cn

Language ability

英语, 中文

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	复旦大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	1985 - 学士学位（分析化学）：湖南大学 1988 - 硕士学位（计算化学）：中国科学技术大学 1991 - 博士学位（计算化学）：中国科学院过程工程研究所发表论文200余篇，包括15篇《Nature Biotechnology》 h指数为55，引用次数超过13,000次合著《大数据与精准医学》一书（2017）共同创立国际MAQC学会并担任首任主席（2017-2018）
Work Experience	1991-1993 - 助理研究员：中国科学院过程工程研究所 1993-1994 - 副研究员：中国科学院过程工程研究所 1994-1997 - 博士后研究员：凯斯西储大学和NIH/NCI 1997-2001 - 不同职位：美国FDA、Wyeth和BASF 2001 - 共同创办：深圳微芯生物 2003 - 重新加入FDA：发起MAQC/SEQC 2011 - 加入复旦大学：生命科学学院、人类表型组研究院和附属肿瘤医院教授
Awards	2017 - 中国专利金奖（第4完成人） 2019 - 国家重点研发计划“战略性国际科技创新合作”重点专项项目首席科学家

University/Lab Affiliation and Title

复旦大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

Work Experience

Awards

Areas of Focus	化学基因组学药物基因组学精准医学医学大数据生物信息学化学信息学
Publications	癌症突变检测的最佳实践：全基因组和全外显子组测序, Xiao W, Ren L, Wang C, Shi L, 2021 建立社区参考样本、数据和呼叫集，以基准测试使用全基因组测序的癌症突变检测, Fang LT, Zhu B, Zhao Y, Hong H, Shi L, Wang C, Xiao W, 2021 三阴性乳腺癌的基因组和转录组景观：亚型和治疗策略, Jiang YZ, Ma D, Suo C, Shi J, Xue M, Hu X, Wang P, Shi L, Huang W, Shao ZM, 2019 国际MAQC学会启动以提高高通量技术的可重复性, Shi L, Tong W, 2017 高风险神经母细胞瘤中通过基因组重排激活端粒酶, Peifer M, Hertwig F, Roels F, Dreidax D, Gartlgruber M, Shi L, Westermann F, Thomas RK, Fischer M, 2015 通过序列质量控制联盟对RNA-seq准确性、可重复性和信息内容的全面评估, Su Z, Łabaj PP, Li S, Kreil DP, Mason CE, Shi L, 2014 MicroArray质量控制（MAQC）-II研究常见实践，用于开发和验证基于微阵列的预测模型, Shi L, Wolfinger RD, 2010 评估外部RNA对微阵列性能的控制, Tong W, Shi L, 2006 大鼠毒理基因组学研究揭示了跨微阵列平台的分析一致性, Guo L, Shi L, 2006 MicroArray质量控制（MAQC）项目显示基因表达测量的跨平台和平台内可重复性, Shi L, Slikker W Jr, 2006

Areas of Focus

化学基因组学
药物基因组学
精准医学
医学大数据
生物信息学
化学信息学

Publications

癌症突变检测的最佳实践：全基因组和全外显子组测序, Xiao W, Ren L, Wang C, Shi L, 2021
建立社区参考样本、数据和呼叫集，以基准测试使用全基因组测序的癌症突变检测, Fang LT, Zhu B, Zhao Y, Hong H, Shi L, Wang C, Xiao W, 2021
三阴性乳腺癌的基因组和转录组景观：亚型和治疗策略, Jiang YZ, Ma D, Suo C, Shi J, Xue M, Hu X, Wang P, Shi L, Huang W, Shao ZM, 2019
国际MAQC学会启动以提高高通量技术的可重复性, Shi L, Tong W, 2017
高风险神经母细胞瘤中通过基因组重排激活端粒酶, Peifer M, Hertwig F, Roels F, Dreidax D, Gartlgruber M, Shi L, Westermann F, Thomas RK, Fischer M, 2015
通过序列质量控制联盟对RNA-seq准确性、可重复性和信息内容的全面评估, Su Z, Łabaj PP, Li S, Kreil DP, Mason CE, Shi L, 2014
MicroArray质量控制（MAQC）-II研究常见实践，用于开发和验证基于微阵列的预测模型, Shi L, Wolfinger RD, 2010
评估外部RNA对微阵列性能的控制, Tong W, Shi L, 2006
大鼠毒理基因组学研究揭示了跨微阵列平台的分析一致性, Guo L, Shi L, 2006
MicroArray质量控制（MAQC）项目显示基因表达测量的跨平台和平台内可重复性, Shi L, Slikker W Jr, 2006

化学基因组学药物基因组学精准医学医学大数据生物信息学化学信息学生物标志物疾病预防诊断治疗

唐凯临 - 同济大学

李功华 - 中国科学院大学

袁曙光 - 中国科学院大学

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