Professor | 王卓 | 数字化转型顾问

Name	王卓
Contact Information	zhuowang@sjtu.edu.cn
Language ability	中文, 英语
Province	上海

Name

王卓

Contact Information

zhuowang@sjtu.edu.cn

Language ability

中文, 英语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	上海交通大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	2003-2006 博士，生物医学工程/生物信息学，上海交通大学生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员人工智能学会生物信息与人工生命专委会委员
Work Experience	2022/12-至今 - 上海交通大学 Bio-X研究院，研究员 2017/1-2022/12 - 上海交通大学 Bio-X研究院，副教授 2011/1-2016/12 - 上海交通大学，生命科学技术学院，副教授 2013/1-2014/7 - 系统生物学研究所，博士后 2006/10-2010/12 - 上海交通大学，生命科学技术学院，讲师
Awards	2008年获交大“晨星”优秀青年教师奖 2011年获生命学院“优秀共产党员”称号 2012年获交大“晨星”优秀青年学者B类奖励 2015年获交大“烛光优秀教师”二等奖 2015年获交大“教学新秀”提名奖 2017年获生命学院“青年教师教学竞赛”三等奖

University/Lab Affiliation and Title

上海交通大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

2003-2006 博士，生物医学工程/生物信息学，上海交通大学
生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员
人工智能学会生物信息与人工生命专委会委员

Work Experience

2022/12-至今 - 上海交通大学 Bio-X研究院，研究员
2017/1-2022/12 - 上海交通大学 Bio-X研究院，副教授
2011/1-2016/12 - 上海交通大学，生命科学技术学院，副教授
2013/1-2014/7 - 系统生物学研究所，博士后
2006/10-2010/12 - 上海交通大学，生命科学技术学院，讲师

Awards

2008年获交大“晨星”优秀青年教师奖
2011年获生命学院“优秀共产党员”称号
2012年获交大“晨星”优秀青年学者B类奖励
2015年获交大“烛光优秀教师”二等奖
2015年获交大“教学新秀”提名奖
2017年获生命学院“青年教师教学竞赛”三等奖

Areas of Focus	多组学大数据与复杂生物网络整合的方法学研究建立基因组-转录组-代谢组等组学大数据分析解读方法，结合网络建模在肝癌、精神分裂症等疾病中发现新的分子分型、新的潜在治疗靶点基于调控与代谢网络整合模型指导合成生物学理性设计
Publications	DROEG: a method for cancer drug response prediction based on omics and essential genes integration, 王卓, 2023 Multiomics Analyses Reveal Microbiome–Gut–Brain Crosstalk Centered on Aberrant GABA and Tryptophan Metabolism in Drug-naïve Patients with First-episode Schizophrenia, 王卓, 2023 Integrative omics analysis reveals effective stratification and potential prognosis markers of pan-gastrointestinal cancers, 王卓, 2021 Multi-omics characterization reveals the pathogenesis of liver focal nodular hyperplasia, 王卓, 2022 OptRAM: In-silico strain design via integrative regulatory-metabolic network modeling, 王卓, 2019 Mechanistic Modeling of Gene Regulation and Metabolism Identifies Potential Targets for Hepatocellular Carcinoma, 王卓, 2020 Systematic comparative study of computational methods for HLA typing from next-generation sequencing, 王卓, 2021 Genome-Scale Metabolic Model of Actinosynnema pretiosum ATCC 31280 and Its Application for Ansamitocin P-3 Production Improvement, 王卓, 2018 Combining Inferred regulatory and mechanistic metabolic networks enhances phenotype prediction in yeast, 王卓, 2017 Multi-scale analysis of Arabidopsis response to different CO2 conditions: from gene expression to metabolic flux, 王卓, 2015

Areas of Focus

多组学大数据与复杂生物网络整合的方法学研究
建立基因组-转录组-代谢组等组学大数据分析解读方法，结合网络建模
在肝癌、精神分裂症等疾病中发现新的分子分型、新的潜在治疗靶点
基于调控与代谢网络整合模型指导合成生物学理性设计

Publications

DROEG: a method for cancer drug response prediction based on omics and essential genes integration, 王卓*, 2023
Multiomics Analyses Reveal Microbiome–Gut–Brain Crosstalk Centered on Aberrant GABA and Tryptophan Metabolism in Drug-naïve Patients with First-episode Schizophrenia, 王卓*, 2023
Integrative omics analysis reveals effective stratification and potential prognosis markers of pan-gastrointestinal cancers, 王卓*, 2021
Multi-omics characterization reveals the pathogenesis of liver focal nodular hyperplasia, 王卓*, 2022
OptRAM: In-silico strain design via integrative regulatory-metabolic network modeling, 王卓*, 2019
Mechanistic Modeling of Gene Regulation and Metabolism Identifies Potential Targets for Hepatocellular Carcinoma, 王卓*, 2020
Systematic comparative study of computational methods for HLA typing from next-generation sequencing, 王卓*, 2021
Genome-Scale Metabolic Model of Actinosynnema pretiosum ATCC 31280 and Its Application for Ansamitocin P-3 Production Improvement, 王卓*, 2018
Combining Inferred regulatory and mechanistic metabolic networks enhances phenotype prediction in yeast, 王卓*, 2017
Multi-scale analysis of Arabidopsis response to different CO2 conditions: from gene expression to metabolic flux, 王卓*, 2015

多组学生物网络方法学研究基因组学转录组学代谢组学网络建模肝癌精神分裂症合成生物学

许杰 - 上海交通大学

张岳 - 上海交通大学

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