王卓
Life Science
上海交通大学
上海
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多组学 生物网络 方法学研究 基因组学 转录组学 代谢组学 网络建模 肝癌 精神分裂症 合成生物学
Areas of Focus
  • 多组学大数据与复杂生物网络整合的方法学研究
  • 建立基因组-转录组-代谢组等组学大数据分析解读方法,结合网络建模
  • 在肝癌、精神分裂症等疾病中发现新的分子分型、新的潜在治疗靶点
  • 基于调控与代谢网络整合模型指导合成生物学理性设计
Work Experience
  • 2022/12-至今 - 上海交通大学 Bio-X研究院,研究员
  • 2017/1-2022/12 - 上海交通大学 Bio-X研究院,副教授
  • 2011/1-2016/12 - 上海交通大学,生命科学技术学院,副教授
  • 2013/1-2014/7 - 系统生物学研究所,博士后
  • 2006/10-2010/12 - 上海交通大学,生命科学技术学院,讲师
Academic Background & Achievements
  • 2003-2006 博士,生物医学工程/生物信息学,上海交通大学
  • 生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员
  • 人工智能学会生物信息与人工生命专委会委员
Publications
  • DROEG: a method for cancer drug response prediction based on omics and essential genes integration, 王卓*, 2023
  • Multiomics Analyses Reveal Microbiome–Gut–Brain Crosstalk Centered on Aberrant GABA and Tryptophan Metabolism in Drug-naïve Patients with First-episode Schizophrenia, 王卓*, 2023
  • Integrative omics analysis reveals effective stratification and potential prognosis markers of pan-gastrointestinal cancers, 王卓*, 2021
  • Multi-omics characterization reveals the pathogenesis of liver focal nodular hyperplasia, 王卓*, 2022
  • OptRAM: In-silico strain design via integrative regulatory-metabolic network modeling, 王卓*, 2019
  • Mechanistic Modeling of Gene Regulation and Metabolism Identifies Potential Targets for Hepatocellular Carcinoma, 王卓*, 2020
  • Systematic comparative study of computational methods for HLA typing from next-generation sequencing, 王卓*, 2021
  • Genome-Scale Metabolic Model of Actinosynnema pretiosum ATCC 31280 and Its Application for Ansamitocin P-3 Production Improvement, 王卓*, 2018
  • Combining Inferred regulatory and mechanistic metabolic networks enhances phenotype prediction in yeast, 王卓*, 2017
  • Multi-scale analysis of Arabidopsis response to different CO2 conditions: from gene expression to metabolic flux, 王卓*, 2015
Awards
  • 2008年获交大“晨星”优秀青年教师奖
  • 2011年获生命学院“优秀共产党员”称号
  • 2012年获交大“晨星”优秀青年学者B类奖励
  • 2015年获交大“烛光优秀教师”二等奖
  • 2015年获交大“教学新秀”提名奖
  • 2017年获生命学院“青年教师教学竞赛”三等奖
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