Professor | 熊旭深 | 数字化转型顾问

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Name	熊旭深
Contact Information	xiongxs@zju.edu.cn
Language ability	英语, 中文
Province	浙江

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Name

熊旭深

Contact Information

xiongxs@zju.edu.cn

Language ability

英语, 中文

Province

浙江

University/Lab Affiliation and Title	浙江大学
Faculty	Medical
Academic Background & Achievements	2014-2019 表观遗传学博士: 北京大学 2010-2014 生物信息学学士: 华中科技大学在《Nature Genetics》、《Molecular Cell》、《Nature Chemical Biology》等期刊上发表多篇高水平文章 Google Scholar引用超过1500次，H指数=11 2019年吴瑞奖学金
Work Experience	2022至今 - 浙江大学医学中心 - 百人计划研究员 2022至今 - 浙江大学医学院附属第二医院 - 研究员 2022年9月-2022年10月 - 麻省理工计算机与人工智能系 - 研究科学家 2019-2022 - 麻省理工计算机与人工智能系（Manolis Kellis课题组） - 博士后 2019-2022 - 哈佛医学院/波士顿儿童医院（Richard Gregory课题组） - 联培博士后
Awards	吴瑞奖学金 (2019): 因杰出学术成就获奖

University/Lab Affiliation and Title

浙江大学

Faculty

Medical

Academic Background & Achievements

2014-2019 表观遗传学博士: 北京大学
2010-2014 生物信息学学士: 华中科技大学
在《Nature Genetics》、《Molecular Cell》、《Nature Chemical Biology》等期刊上发表多篇高水平文章
Google Scholar引用超过1500次，H指数=11
2019年吴瑞奖学金

Work Experience

2022至今 - 浙江大学医学中心 - 百人计划研究员
2022至今 - 浙江大学医学院附属第二医院 - 研究员
2022年9月-2022年10月 - 麻省理工计算机与人工智能系 - 研究科学家
2019-2022 - 麻省理工计算机与人工智能系（Manolis Kellis课题组） - 博士后
2019-2022 - 哈佛医学院/波士顿儿童医院（Richard Gregory课题组） - 联培博士后

Awards

吴瑞奖学金 (2019): 因杰出学术成就获奖

Areas of Focus	生物信息学和疾病遗传学表观遗传学人工智能与深度学习
Publications	阿尔茨海默病的单细胞表观基因组剖析揭示了因果遗传变异和表观基因组侵蚀, 熊旭深, Benjamin T. James, Carles A. Boix, Yongjin Park, Kyriaki Galani, Na Sun, Lei Hou, Li-Lun Ho, Julio Mantero, Hansruedi Mathys, David A. Bennett, Li-Huei Tsai, Manolis Kellis, 2023 跨越387个GTEx样本的多组织表观基因组变异图谱解释了大脑、心脏、肌肉和肺部的疾病遗传学, Lei Hou, 熊旭深, Yongjin Park, Carles Boix, Benjamin James, Na Sun, Liang He, Aman Patel, Zhizhuo Zhang, Benoit Molinie, Nicholas Van Wittenberghe, Scott Steelman, Chad Nusbaum, François Aguet, Kristin G. Ardlie, Manolis Kellis, 2023 人类大脑、肺、心脏和肌肉中m6A甲基化的遗传驱动因素, 熊旭深, Lei Hou, Yongjin Park, Benoit Molinie, GTEx Consortium, Richard I. Gregory, Manolis Kellis, 2021 tRNA中的N1-甲基腺苷甲基化通过调节胆固醇代谢驱动肝脏肿瘤发生, Yanying Wang, Jing Wang, Xiaoyu Li, 熊旭深, Jianyi Wang, Ziheng Zhou, Xiaoxiao Zhu, Dan Dominissini, Yang Gu, Lei He, Yong Tian, Chengqi Yi, Zusen Fan, 2021 单核苷酸分辨率下人类m1A甲基组的拓扑学视角, 熊旭深, Li X, Wang K, Yi C, 2018 基底分辨率映射揭示了核和线粒体编码转录本中不同的m1A甲基组, Li X, 熊旭深, Zhang M, Wang K, Chen Y, Zhou J, Mao Y, Lv J, Yi D, Chen X, Wang C, Qian SB, Yi C, 2017 转录组范围的映射揭示了可逆和动态的N1-甲基腺苷甲基组, Li X, 熊旭深, Wang K, Wang L, Shu X, Ma S, Yi C, 2016 顺铂-DNA加合物在基因组尺度上的基底分辨率分析, Shu X, 熊旭深, Song J, He C, Yi C, 2016

Areas of Focus

生物信息学和疾病遗传学
表观遗传学
人工智能与深度学习

Publications

阿尔茨海默病的单细胞表观基因组剖析揭示了因果遗传变异和表观基因组侵蚀, 熊旭深, Benjamin T. James, Carles A. Boix, Yongjin Park, Kyriaki Galani, Na Sun, Lei Hou, Li-Lun Ho, Julio Mantero, Hansruedi Mathys, David A. Bennett, Li-Huei Tsai, Manolis Kellis, 2023
跨越387个GTEx样本的多组织表观基因组变异图谱解释了大脑、心脏、肌肉和肺部的疾病遗传学, Lei Hou, 熊旭深, Yongjin Park, Carles Boix, Benjamin James, Na Sun, Liang He, Aman Patel, Zhizhuo Zhang, Benoit Molinie, Nicholas Van Wittenberghe, Scott Steelman, Chad Nusbaum, François Aguet, Kristin G. Ardlie, Manolis Kellis, 2023
人类大脑、肺、心脏和肌肉中m6A甲基化的遗传驱动因素, 熊旭深, Lei Hou, Yongjin Park, Benoit Molinie, GTEx Consortium, Richard I. Gregory, Manolis Kellis, 2021
tRNA中的N1-甲基腺苷甲基化通过调节胆固醇代谢驱动肝脏肿瘤发生, Yanying Wang, Jing Wang, Xiaoyu Li, 熊旭深, Jianyi Wang, Ziheng Zhou, Xiaoxiao Zhu, Dan Dominissini, Yang Gu, Lei He, Yong Tian, Chengqi Yi, Zusen Fan, 2021
单核苷酸分辨率下人类m1A甲基组的拓扑学视角, 熊旭深, Li X, Wang K, Yi C, 2018
基底分辨率映射揭示了核和线粒体编码转录本中不同的m1A甲基组, Li X, 熊旭深, Zhang M, Wang K, Chen Y, Zhou J, Mao Y, Lv J, Yi D, Chen X, Wang C, Qian SB, Yi C, 2017
转录组范围的映射揭示了可逆和动态的N1-甲基腺苷甲基组, Li X, 熊旭深, Wang K, Wang L, Shu X, Ma S, Yi C, 2016
顺铂-DNA加合物在基因组尺度上的基底分辨率分析, Shu X, 熊旭深, Song J, He C, Yi C, 2016

生物信息学疾病遗传学表观遗传学人工智能深度学习基因组学转录组学 Rna修饰机器学习计算生物学

蒋晞 - 浙江大学

吴健 - 浙江大学

郭国骥 - 浙江大学

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干细胞 | 再生医学 | 单细胞 | 分析 | 技术 | 人工智能 | Ai | 生物技术 | 遗传学 | 生物信息学

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