Professor | 刘山林 | 数字化转型顾问

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Name	刘山林
Contact Information	shanlin.liu@ioz.ac.cn
Language ability	中文, 英文
Province	北京

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Name

刘山林

Contact Information

shanlin.liu@ioz.ac.cn

Language ability

中文, 英文

Province

北京

University/Lab Affiliation and Title	中国科学院
Faculty	Institute of Zoology
Academic Background & Achievements	2007 - 动物学学士学位：湖南师范大学 2010 - 动物学硕士学位：湖南师范大学 2018 - 进化基因组学博士学位：哥本哈根大学入选中国科学院引才计划谷歌学术引用超过1万次，H指数为41 被科睿唯安列为全球高被引科学家之一
Work Experience	2019-2023 - 博士后和副教授：中国农业大学现任 - 组长：中国科学院动物研究所适应进化与生态互作研究组

University/Lab Affiliation and Title

中国科学院

Faculty

Institute of Zoology

Academic Background & Achievements

2007 - 动物学学士学位：湖南师范大学
2010 - 动物学硕士学位：湖南师范大学
2018 - 进化基因组学博士学位：哥本哈根大学
入选中国科学院引才计划
谷歌学术引用超过1万次，H指数为41
被科睿唯安列为全球高被引科学家之一

Work Experience

2019-2023 - 博士后和副教授：中国农业大学
现任 - 组长：中国科学院动物研究所适应进化与生态互作研究组

Areas of Focus	动物分子分类保护基因组学古基因组学蜜蜂学
Publications	在进化背景下定义蜜蜂亚种以保证有策略的保护, Qiu L, Dong J, Li X, Parey SH, Tan K, Orr M, Majeed A, Zhang X, Luo S, Zhou X, Zhu C, Ji T, Niu Q, Liu S, Zhou X, 2023 古代和现代基因组揭示犀牛家族的进化历史, Liu S, Westbury MV, Dussex N, Mitchell KJ, Sinding MS, Heintzman PD, Duchêne DA, Kapp JD, von Seth J, Heiniger H, Sánchez-Barreiro F, Margaryan A, André-Olsen R, De Cahsan B, Meng G, Yang C, et al., 2021 百万年DNA揭示猛犸象的基因组历史, van der Valk T, Pečnerová P, Díez-Del-Molino D, Bergström A, Oppenheimer J, Hartmann S, Xenikoudakis G, Thomas JA, Dehasque M, Sağlıcan E, Fidan FR, Barnes I, Liu S, Somel M, et al., 2021 系统基因组学解决昆虫进化的时间和模式, Misof B#, Liu S#, Meusemann K#, Peters RS#, Donath A#, Mayer C#, Frandsen PB#, Ware J#, Flouri T#, Beutel RG#, Niehuis O#, Petersen M#, Izquierdo-Carrasco F#, Wappler T#, Rust J#, Aberer AJ, Aspöck U, Aspöck H, Bartel D, et al., 2014 使用高通量单端400 bp测序的高效COI条形码, Yang C, Zheng Y, Tan S, Meng G, Rao W, Yang C, Bourne DG, O'Brien PA, Xu J, Liao S, Chen A, Chen X, Jia X, Zhang AB, Liu S, 2020 两种最新测序技术的基因组组装比较：Pacific Biosciences Sequel II系统的HiFi读取和Oxford Nanopore的超长读取, Lang D, Zhang S, Ren P, Liang F, Sun Z, Meng G, Tan Y, Li X, Lai Q, Han L, Wang D, Hu F, Wang W, Liu S, 2020 NextPolish：一种快速高效的长读组装基因组抛光工具, Hu J, Fan J, Sun Z, Liu S, 2020 MitoZ：用于动物线粒体基因组组装、注释和可视化的工具包, Meng G, Li Y, Yang C, Liu S*, 2019 通过高通量测序组装DNA条形码填补参考空白-迈向世界条形码, Liu S, Yang C, Zhou C, Zhou X, 2017 SOAPBarcode：通过组装Illumina PCR扩增子枪法序列揭示节肢动物的生物多样性, Liu S, Li Y, Lu J, Su X, Tang M, Zhang R, Zhou L, et al., 2013

Areas of Focus

动物分子分类
保护基因组学
古基因组学
蜜蜂学

Publications

在进化背景下定义蜜蜂亚种以保证有策略的保护, Qiu L, Dong J, Li X, Parey SH, Tan K, Orr M, Majeed A, Zhang X, Luo S, Zhou X, Zhu C, Ji T, Niu Q, Liu S*, Zhou X, 2023
古代和现代基因组揭示犀牛家族的进化历史, Liu S*, Westbury MV, Dussex N, Mitchell KJ, Sinding MS, Heintzman PD, Duchêne DA, Kapp JD, von Seth J, Heiniger H, Sánchez-Barreiro F, Margaryan A, André-Olsen R, De Cahsan B, Meng G, Yang C, et al., 2021
百万年DNA揭示猛犸象的基因组历史, van der Valk T, Pečnerová P, Díez-Del-Molino D, Bergström A, Oppenheimer J, Hartmann S, Xenikoudakis G, Thomas JA, Dehasque M, Sağlıcan E, Fidan FR, Barnes I, Liu S, Somel M, et al., 2021
系统基因组学解决昆虫进化的时间和模式, Misof B*#, Liu S#, Meusemann K#, Peters RS#, Donath A#, Mayer C#, Frandsen PB#, Ware J#, Flouri T#, Beutel RG#, Niehuis O#, Petersen M#, Izquierdo-Carrasco F#, Wappler T#, Rust J#, Aberer AJ, Aspöck U, Aspöck H, Bartel D, et al., 2014
使用高通量单端400 bp测序的高效COI条形码, Yang C, Zheng Y, Tan S, Meng G, Rao W, Yang C, Bourne DG, O'Brien PA, Xu J, Liao S, Chen A, Chen X, Jia X, Zhang AB, Liu S*, 2020
两种最新测序技术的基因组组装比较：Pacific Biosciences Sequel II系统的HiFi读取和Oxford Nanopore的超长读取, Lang D, Zhang S, Ren P, Liang F, Sun Z, Meng G, Tan Y, Li X, Lai Q, Han L, Wang D, Hu F, Wang W, Liu S*, 2020
NextPolish：一种快速高效的长读组装基因组抛光工具, Hu J, Fan J, Sun Z, Liu S*, 2020
MitoZ：用于动物线粒体基因组组装、注释和可视化的工具包, Meng G, Li Y, Yang C, Liu S*, 2019
通过高通量测序组装DNA条形码填补参考空白-迈向世界条形码, Liu S, Yang C, Zhou C, Zhou X, 2017
SOAPBarcode：通过组装Illumina PCR扩增子枪法序列揭示节肢动物的生物多样性, Liu S, Li Y, Lu J, Su X, Tang M, Zhang R, Zhou L, et al., 2013

生物多样性进化基因组学保护分类学传粉者 Dna条形码系统发育适应生态学

朱朝东 - 中国科学院

罗阿蓉 - 中国科学院

肖治术 - 中国科学院

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