Professor | 何子文 | 数字化转型顾问

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Name	何子文
Contact Information	heziwen@mail.sysu.edu.cn
Language ability	中文, 英语
Province	广东

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何子文

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heziwen@mail.sysu.edu.cn

Language ability

中文, 英语

Province

广东

University/Lab Affiliation and Title	中山大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	2004.09 — 2008.06 理学学士学位: 中山大学 2008.09 — 2013.06 理学博士学位: 中山大学在物种形成理论和基因组适应性进化研究领域产出了一系列重要成果在国际一流期刊发表研究论文40余篇主持省杰出青年项目和国家级项目多个入选国家重大人才工程
Work Experience	2013.08 — 2015.12 博士后: 中山大学生命科学学院 2016.01 — 2018.12 特聘研究员: 中山大学生命科学学院 2019.01 — 2024.03 副教授: 中山大学生命科学学院 2024.04 — 至今教授: 中山大学生命科学学院
Awards	教育部博士研究生学术新人奖

University/Lab Affiliation and Title

中山大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

2004.09 — 2008.06 理学学士学位: 中山大学
2008.09 — 2013.06 理学博士学位: 中山大学
在物种形成理论和基因组适应性进化研究领域产出了一系列重要成果
在国际一流期刊发表研究论文40余篇
主持省杰出青年项目和国家级项目多个
入选国家重大人才工程

Work Experience

2013.08 — 2015.12 博士后: 中山大学生命科学学院
2016.01 — 2018.12 特聘研究员: 中山大学生命科学学院
2019.01 — 2024.03 副教授: 中山大学生命科学学院
2024.04 — 至今教授: 中山大学生命科学学院

Awards

教育部博士研究生学术新人奖

Areas of Focus	进化生物学与生态基因组学
Publications	不稳定环境中的适应和全球基因损失：通过May-Wigner理论的小而稳定的基因网络。, 徐少华, 邵邵, 冯晓, 李森, 张灵杰, 吴伟红, 刘敏, Miles E. Tracy, 钟才荣, 郭子潇, 吴仲义, 施苏华, 何子文, 2024 全基因组三倍化后的再二倍化和适应性进化的基因组证据。, 冯晓, 陈启平, 吴伟红, 王杰新, 李国宏, 徐少华, 邵邵, 刘敏, 钟才荣, 吴仲义, 施苏华, 何子文, 2024 Nypa fruticans的基因组分析阐明了其潮间带适应和早期棕榈进化。, 吴伟红, 冯晓, 王楠, 邵邵, 刘敏, 司法, 陈林浩, 金传峰, 徐少华, 郭子潇, 钟才荣, 施苏华, 何子文, 2024 使用新工具Allo4D分析的异源四倍体红树树种的进化历史。, 王源, 李玉龙, 吴伟红, 邵邵, 方琦, 徐少华, 郭子潇, 施苏华, 何子文, 2023 Avicennia红树树中的WRKY转录因子家族的扩展和适应性进化。, 冯晓, 李国宏, 吴伟红, 吕浩敏, 王杰新, 刘聪, 钟才荣, 施苏华, 何子文, 2023 全基因组重复最有利的地方：红树适应陆地和海洋之间的广泛盐度范围。, 徐少华, 郭子潇, 冯晓, 邵邵, 杨宇晨, 李建芳, 钟才荣, 何子文, 施苏华, 2023 异域物种形成后次生同域的广泛基因流。, 王新峰, 何子文, 郭子潇, 杨明, 徐少华, 陈启平, 邵邵, 李森, 钟才荣, Norman C Duke, 施苏华, 2022 冰川湖中的同域或微异域物种形成？基因组岛屿不支持。, 孙宁, 杨连东, 田飞, 曾宏辉, 何子文, 赵凯, 王成, 孟明辉, 冯成光, 方成池, 吕文琦, 薄静, 唐永涛, 甘晓妮, 彭作刚, 陈宜瑜, 何舜平, 2022 基于完整的红树林基因组集的沿海森林进化。, 何子文, 冯晓, 陈启平, 李良伟, 李森, 韩凯, 郭子潇, 王佳言, 刘敏, 施成成, 徐少华, 邵邵, 刘鑫, 毛晓萌, 谢伟, 王新峰, 张如凡, 李国宏, 吴伟红, 郑铮, 钟才荣, Norman C. Duke, David E. Boufford, 范广义, 吴仲义, Robert E. Ricklefs, 施苏华, 2022 适应性分子进化的可疑证据二十年——负选择混淆正选择信号。, 陈启平, 杨浩, 冯晓, 陈庆建, 施苏华, 吴仲义, 何子文, 2022 红树Aegiceras corniculatum在潮间带环境中的分子适应的基因组见解。, 冯晓, 李国宏, 徐少华, 吴伟红, 陈启平, 邵邵, 刘敏, 王楠, 钟才荣, 何子文, 施苏华, 2021 极端环境适应的基因组趋同。, 徐少华, 王佳言, 郭子潇, 何子文, 施苏华, 2020 基因与物种形成：是时候放弃生物物种概念了吗？, 王新峰, 何子文, 施苏华, 吴仲义, 2020 木本植物在陆海交界处的基因组趋同适应。, 何子文, 徐少华, 张张, 郭武侠, 吕浩敏, 钟才荣, David E Boufford, Norman C Duke, 国际红树林联盟, 施苏华, 2020 基因组水平的适应性趋同——普遍、不常见还是非常罕见？, 何子文, 徐少华, 施苏华, 2020 热带潮间带环境中红树Sonneratia alba对盐度波动的分子适应。, 冯晓, 徐少华, 李建芳, 杨宇晨, 陈启平, 吕浩敏, 钟才荣, 何子文, 施苏华, 2020 大步分子进化——正选择下的密码子替换。, 陈庆建, 何子文, 蓝奥, 沈旭, 温海军, 吴仲义, 2019 通过隔离和迁移循环的基因流物种形成：来自多个红树类群的见解。, 何子文, 李新年, 杨明, 王新峰, 钟才荣, Norman C Duke, 吴仲义, 施苏华, 2019 红树类群的极低遗传多样性反映了过去的海平面变化，并暗示了未来的糟糕反应。, 郭子潇, 李新年, 何子文, 杨宇晨, 王文清, 钟才荣, Anthony J. Greenberg, 吴仲义, Norman C. Duke, 施苏华, 2018 Avicennia officinalis L.转录组的去新组装和注释。, 吕浩敏, 李新年, 郭子潇, 何子文, 施苏华, 2018 边缘环境中的趋同适应进化：卸载转座子是红树基因组的共同策略。, 吕浩敏, 何子文, 吴仲义, 施苏华, 2018 红树从木本植物进化过程中基因组的趋同。, 徐少华, 何子文, 郭子潇, 张张, Gerald J. Wyckoff, Anthony Greenberg, 吴仲义, 施苏华, 2017 通过全基因组测序揭示的主要红树类群（Rhizophoreae）的起源、多样化和适应。, 徐少华, 何子文, 张张, 郭子潇, 郭武侠, 吕浩敏, 李建芳, 杨明, 杜正林, 黄业林, 周仁超, 钟才荣, David E. Boufford, Manuel Lerdau, 吴仲义, Norman C. Duke, 国际红树林联盟, 施苏华, 2017 通过种群转录组学推断的杂交和创始事件导致的超级入侵藤本植物Mikania micrantha（菊科）的出现。, 杨明, 何子文, 黄业林, 卢璐, 严玉斌, 洪兰, 沈浩, 刘颖, 郭强, 姜璐, 张燕武, Anthony J. Greenberg, 周仁超, 葛学军, 吴仲义, 施苏华, 2017 仅凭基因组数据能否告诉我们物种形成是否伴随基因流？, 杨明, 何子文, 施苏华, 吴仲义, 2017 转录组分析为红树蕨类植物属Acrostichum的系统发育和适应性进化提供了见解。, 张张, 何子文, 徐少华, 李新年, 郭武侠, 杨宇晨, 钟才荣, 周仁超, 施苏华, 2016 使用RNA-seq对红树棕榈（Nypa fruticans）的编码序列进行去新组装，并发现棕榈祖先的全基因组重复。, 何子文, 张张, 郭武侠, 张颖, 周仁超, 施苏华, 2015 通过双重测序应用从高错误率的下一代测序数据中估计DNA多态性。, 何子文, 李新年, 凌少平, 傅云信, Eric Hungate, 施苏华, 吴仲义, 2013 水稻基因组中的两个进化历史：驯化基因的作用。, 何子文, 翟伟伟, 温海军, 唐天, 王宇, 陆雪梅, Anthony J. Greenberg, Richard R. Hudson, 吴仲义, 施苏华, 2011

Areas of Focus

进化生物学与生态基因组学

Publications

不稳定环境中的适应和全球基因损失：通过May-Wigner理论的小而稳定的基因网络。, 徐少华, 邵邵, 冯晓, 李森, 张灵杰, 吴伟红, 刘敏, Miles E. Tracy, 钟才荣, 郭子潇, 吴仲义, 施苏华, 何子文, 2024
全基因组三倍化后的再二倍化和适应性进化的基因组证据。, 冯晓, 陈启平, 吴伟红, 王杰新, 李国宏, 徐少华, 邵邵, 刘敏, 钟才荣, 吴仲义, 施苏华, 何子文, 2024
Nypa fruticans的基因组分析阐明了其潮间带适应和早期棕榈进化。, 吴伟红, 冯晓, 王楠, 邵邵, 刘敏, 司法, 陈林浩, 金传峰, 徐少华, 郭子潇, 钟才荣, 施苏华, 何子文, 2024
使用新工具Allo4D分析的异源四倍体红树树种的进化历史。, 王源, 李玉龙, 吴伟红, 邵邵, 方琦, 徐少华, 郭子潇, 施苏华, 何子文, 2023
Avicennia红树树中的WRKY转录因子家族的扩展和适应性进化。, 冯晓, 李国宏, 吴伟红, 吕浩敏, 王杰新, 刘聪, 钟才荣, 施苏华, 何子文, 2023
全基因组重复最有利的地方：红树适应陆地和海洋之间的广泛盐度范围。, 徐少华, 郭子潇, 冯晓, 邵邵, 杨宇晨, 李建芳, 钟才荣, 何子文, 施苏华, 2023
异域物种形成后次生同域的广泛基因流。, 王新峰, 何子文, 郭子潇, 杨明, 徐少华, 陈启平, 邵邵, 李森, 钟才荣, Norman C Duke, 施苏华, 2022
冰川湖中的同域或微异域物种形成？基因组岛屿不支持。, 孙宁, 杨连东, 田飞, 曾宏辉, 何子文, 赵凯, 王成, 孟明辉, 冯成光, 方成池, 吕文琦, 薄静, 唐永涛, 甘晓妮, 彭作刚, 陈宜瑜, 何舜平, 2022
基于完整的红树林基因组集的沿海森林进化。, 何子文, 冯晓, 陈启平, 李良伟, 李森, 韩凯, 郭子潇, 王佳言, 刘敏, 施成成, 徐少华, 邵邵, 刘鑫, 毛晓萌, 谢伟, 王新峰, 张如凡, 李国宏, 吴伟红, 郑铮, 钟才荣, Norman C. Duke, David E. Boufford, 范广义, 吴仲义, Robert E. Ricklefs, 施苏华, 2022
适应性分子进化的可疑证据二十年——负选择混淆正选择信号。, 陈启平, 杨浩, 冯晓, 陈庆建, 施苏华, 吴仲义, 何子文, 2022
红树Aegiceras corniculatum在潮间带环境中的分子适应的基因组见解。, 冯晓, 李国宏, 徐少华, 吴伟红, 陈启平, 邵邵, 刘敏, 王楠, 钟才荣, 何子文, 施苏华, 2021
极端环境适应的基因组趋同。, 徐少华, 王佳言, 郭子潇, 何子文, 施苏华, 2020
基因与物种形成：是时候放弃生物物种概念了吗？, 王新峰, 何子文, 施苏华, 吴仲义, 2020
木本植物在陆海交界处的基因组趋同适应。, 何子文, 徐少华, 张张, 郭武侠, 吕浩敏, 钟才荣, David E Boufford, Norman C Duke, 国际红树林联盟, 施苏华, 2020
基因组水平的适应性趋同——普遍、不常见还是非常罕见？, 何子文, 徐少华, 施苏华, 2020
热带潮间带环境中红树Sonneratia alba对盐度波动的分子适应。, 冯晓, 徐少华, 李建芳, 杨宇晨, 陈启平, 吕浩敏, 钟才荣, 何子文, 施苏华, 2020
大步分子进化——正选择下的密码子替换。, 陈庆建, 何子文, 蓝奥, 沈旭, 温海军, 吴仲义, 2019
通过隔离和迁移循环的基因流物种形成：来自多个红树类群的见解。, 何子文, 李新年, 杨明, 王新峰, 钟才荣, Norman C Duke, 吴仲义, 施苏华, 2019
红树类群的极低遗传多样性反映了过去的海平面变化，并暗示了未来的糟糕反应。, 郭子潇, 李新年, 何子文, 杨宇晨, 王文清, 钟才荣, Anthony J. Greenberg, 吴仲义, Norman C. Duke, 施苏华, 2018
Avicennia officinalis L.转录组的去新组装和注释。, 吕浩敏, 李新年, 郭子潇, 何子文, 施苏华, 2018
边缘环境中的趋同适应进化：卸载转座子是红树基因组的共同策略。, 吕浩敏, 何子文, 吴仲义, 施苏华, 2018
红树从木本植物进化过程中基因组的趋同。, 徐少华, 何子文, 郭子潇, 张张, Gerald J. Wyckoff, Anthony Greenberg, 吴仲义, 施苏华, 2017
通过全基因组测序揭示的主要红树类群（Rhizophoreae）的起源、多样化和适应。, 徐少华, 何子文, 张张, 郭子潇, 郭武侠, 吕浩敏, 李建芳, 杨明, 杜正林, 黄业林, 周仁超, 钟才荣, David E. Boufford, Manuel Lerdau, 吴仲义, Norman C. Duke, 国际红树林联盟, 施苏华, 2017
通过种群转录组学推断的杂交和创始事件导致的超级入侵藤本植物Mikania micrantha（菊科）的出现。, 杨明, 何子文, 黄业林, 卢璐, 严玉斌, 洪兰, 沈浩, 刘颖, 郭强, 姜璐, 张燕武, Anthony J. Greenberg, 周仁超, 葛学军, 吴仲义, 施苏华, 2017
仅凭基因组数据能否告诉我们物种形成是否伴随基因流？, 杨明, 何子文, 施苏华, 吴仲义, 2017
转录组分析为红树蕨类植物属Acrostichum的系统发育和适应性进化提供了见解。, 张张, 何子文, 徐少华, 李新年, 郭武侠, 杨宇晨, 钟才荣, 周仁超, 施苏华, 2016
使用RNA-seq对红树棕榈（Nypa fruticans）的编码序列进行去新组装，并发现棕榈祖先的全基因组重复。, 何子文, 张张, 郭武侠, 张颖, 周仁超, 施苏华, 2015
通过双重测序应用从高错误率的下一代测序数据中估计DNA多态性。, 何子文, 李新年, 凌少平, 傅云信, Eric Hungate, 施苏华, 吴仲义, 2013
水稻基因组中的两个进化历史：驯化基因的作用。, 何子文, 翟伟伟, 温海军, 唐天, 王宇, 陆雪梅, Anthony J. Greenberg, Richard R. Hudson, 吴仲义, 施苏华, 2011

进化基因组学生态学物种形成适应性生物多样性红树林遗传多样性气候变化基因流

蒋韦斌 - 上海师范大学

徐俊 - 上海交通大学

高海春 - 浙江大学

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