Professor | 韦朝春 | 数字化转型顾问

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Name	韦朝春
Contact Information	ccwei@sjtu.edu.cn
Language ability	英语, 汉语
Province	上海

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Name

韦朝春

Contact Information

ccwei@sjtu.edu.cn

Language ability

英语, 汉语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	上海交通大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	1991-1996 北京大学数学学士 1996-1999 北京大学信号与信息处理硕士 2000-2006 美国华盛顿大学计算机科学博士（计算生物学）在Nature等期刊发表论文近50篇，引用超过5500次
Work Experience	2015- 上海交通大学生命科学技术学院生物信息学与生物统计学系教授 2008-2015 上海交通大学生命科学技术学院生物信息学与生物统计学系副教授 2006-2007 美国微软公司软件工程师
Awards	2019年度中国生物信息学十大算法和工具 (2020) 上海交通大学校长奖 (2019) 上海交通大学教书育人奖 (2018) 上海交通大学优秀教师 (2015) 上海交通大学晨星计划 (2014) 教育部新世纪优秀人才 (2013) 上海市浦江人才计划 (2009) 合成生物学iGEM国际大赛金奖 (2009, 2014, 2015, 2016, 2019, 2020, 2021)

University/Lab Affiliation and Title

上海交通大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

1991-1996 北京大学数学学士
1996-1999 北京大学信号与信息处理硕士
2000-2006 美国华盛顿大学计算机科学博士（计算生物学）
在Nature等期刊发表论文近50篇，引用超过5500次

Work Experience

2015- 上海交通大学生命科学技术学院生物信息学与生物统计学系教授
2008-2015 上海交通大学生命科学技术学院生物信息学与生物统计学系副教授
2006-2007 美国微软公司软件工程师

Awards

2019年度中国生物信息学十大算法和工具 (2020)
上海交通大学校长奖 (2019)
上海交通大学教书育人奖 (2018)
上海交通大学优秀教师 (2015)
上海交通大学晨星计划 (2014)
教育部新世纪优秀人才 (2013)
上海市浦江人才计划 (2009)
合成生物学iGEM国际大赛金奖 (2009, 2014, 2015, 2016, 2019, 2020, 2021)

Areas of Focus	基因组学元基因组学和泛基因组学生物信息学中的高性能计算及应用研究可变剪切转录本预测、调控因子识别、基因的起源及进化分析、重复序列对基因组结构和功能的影响等
Publications	中国胃癌的泛基因组分析, 于洋, 张志强, 董晓, 杨荣, 段志远, 向中, 李建, 李国庆, 严飞, 薛红, 焦都, 陆建, 陆华, 张伟, 魏远, 范森, 李建, 贾建, 张建, 季建, 刘平, 陆华, 赵红, 陈松, 魏朝春, 陈华, 朱志强, 2022 真核生物中广泛的水平基因转移区域, 李坤, 严飞, 段志远, Adelson, D., 魏朝春, 2022 111个水稻基因组的长读序列揭示了显著更大的泛基因组, 张飞, 薛红, 董晓, 李明, 郑晓, 李志, 徐建, 王伟, 魏朝春, 2022 HUPAN: 人类基因组的泛基因组分析管道, 段志远, 乔阳, 陆建, 陆华, 张伟, 严飞, 孙晨, 胡志远, 张志强, 李国庆, 陈华, 向中, 朱志强, 赵红, 于洋, 魏朝春, 2019 亚洲栽培稻的3,010个不同品种的基因组变异, 王伟等, 2018 EUPAN使大量真核生物基因组的泛基因组研究成为可能, 胡志远, 孙晨, 陆凯, 褚晓, 赵勇, 陆建, 石建, 魏朝春, 2017 RPAN: 约3,000个水稻基因组的泛基因组浏览器, 孙晨, 胡志远, 陆凯, 赵勇, 陆建, 郑涛, 王伟, 石建, 张东, 李志, 魏朝春, 2017 基于ab initio预测、RNA-sesq和蛋白质组学揭示缺失的人类蛋白质亚型, 胡志远, Scott, H., 秦刚, 郑刚, 褚晓, 谢立, Adelson, D., Oftedal, B., Venugopal, P., Babic, M., Hahn, C., 张斌, 王晓, 李宁, 魏朝春, 2015 通过克隆TWINSCAN预测接近C.elegans ORFeome, 魏朝春, Lamesch, P., Arumugam M., Rosenberg, J., Hu, P., Vidal, M., and Brent, M. R., 2005 人体肠道细菌群落中超过9,000,000个独特基因：估计人体内的基因数量, 杨晓, 谢立, 李勇, 魏朝春, 2009

Areas of Focus

基因组学
元基因组学和泛基因组学
生物信息学中的高性能计算及应用研究
可变剪切转录本预测、调控因子识别、基因的起源及进化分析、重复序列对基因组结构和功能的影响等

Publications

中国胃癌的泛基因组分析, 于洋*, 张志强, 董晓, 杨荣, 段志远, 向中, 李建, 李国庆, 严飞, 薛红, 焦都, 陆建, 陆华, 张伟, 魏远, 范森, 李建, 贾建, 张建, 季建, 刘平, 陆华, 赵红, 陈松, 魏朝春*, 陈华*, 朱志强*, 2022
真核生物中广泛的水平基因转移区域, 李坤, 严飞, 段志远, Adelson, D., 魏朝春*, 2022
111个水稻基因组的长读序列揭示了显著更大的泛基因组, 张飞, 薛红, 董晓, 李明, 郑晓, 李志, 徐建, 王伟, 魏朝春*, 2022
HUPAN: 人类基因组的泛基因组分析管道, 段志远, 乔阳, 陆建, 陆华, 张伟, 严飞, 孙晨, 胡志远, 张志强, 李国庆, 陈华, 向中, 朱志强, 赵红, 于洋*, 魏朝春*, 2019
亚洲栽培稻的3,010个不同品种的基因组变异, 王伟等, 2018
EUPAN使大量真核生物基因组的泛基因组研究成为可能, 胡志远, 孙晨, 陆凯, 褚晓, 赵勇, 陆建, 石建*, 魏朝春*, 2017
RPAN: 约3,000个水稻基因组的泛基因组浏览器, 孙晨, 胡志远, 陆凯, 赵勇, 陆建, 郑涛, 王伟, 石建, 张东, 李志*, 魏朝春*, 2017
基于ab initio预测、RNA-sesq和蛋白质组学揭示缺失的人类蛋白质亚型, 胡志远, Scott, H., 秦刚, 郑刚, 褚晓, 谢立, Adelson, D., Oftedal, B., Venugopal, P., Babic, M., Hahn, C., 张斌, 王晓, 李宁, 魏朝春*, 2015
通过克隆TWINSCAN预测接近C.elegans ORFeome, 魏朝春, Lamesch, P., Arumugam M., Rosenberg, J., Hu, P., Vidal, M., and Brent, M. R., 2005
人体肠道细菌群落中超过9,000,000个独特基因：估计人体内的基因数量, 杨晓, 谢立, 李勇, 魏朝春*, 2009

基因组学元基因组学泛基因组学生物信息学高性能计算转录组调控因子基因进化重复序列基因组结构

刘琦 - 同济大学

刘桂芬 - 同济大学

Area of Focus
高通量 | 生物技术 | 基因组 | 转录 | 调控 | 斑马鱼 | 基因组学 | 生物信息学 | 发展 | 激活

唐凯临 - 同济大学

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