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陈禹
Life Science
中国科学院大学
广东
Language: 中文, 英语
合成生物学: 基因电路
代谢途径
生物工程
基因合成
蛋白质设计
细胞系统
代谢网络
生物传感器
生物制造
基因组编辑
系统生物学: 计算建模
生物网络
数据整合
组学技术
动态系统
调控网络
途径分析
细胞行为
系统动力学
生物信息学
代谢工程: 代谢途径
酶工程
流量分析
生物生产
代谢流
途径优化
合成途径
代谢控制
生物催化
Areas of Focus
- 合成生物学
- 系统生物学
- 代谢工程
Work Experience
- 2024-01至今 - 中国科学院深圳先进技术研究院 - 研究员
- 2023-02至2024-01 - 中国科学院深圳先进技术研究院 - 副研究员
- 2018-02至2022-12 - 查尔姆斯理工大学 - 博士后
Academic Background & Achievements
- 2012-09至2018-06 博士学位: 华东理工大学
- 2008-09至2012-06 学士学位: 华中农业大学
Publications
- 单细胞组学分析与基因组规模代谢建模, 陈禹, 2024
- 肌醇焦磷酸盐在酵母糖酵解和呼吸调控中的平衡作用, 陈禹, 2023
- 酵母线粒体代谢工程用于3-羟基丙酸生产, 陈禹, 2023
- 酵母工程用于高水平生产二萜类化合物, 陈禹, 2023
- 基于深度学习的k(cat)预测实现了改进的酶约束模型重建, 陈禹, 2022
- 通过工程化辅因子供应和回收驱动酵母中的酚酸生物合成（第18卷，第520页，2022年）, 陈禹, 2022
- 酵母进化以最小化合成氨基酸的蛋白质资源成本, 陈禹, 2022
- 通过使用蛋白质组约束的基因组规模建模提高酵母重组蛋白生产, 陈禹, 2022
- 酵母代谢的基因组规模建模：回顾与展望, 陈禹, 2022
- GotEnzymes：一个广泛的酶参数预测数据库, 陈禹, 2022
- 在葡萄糖限制下，酵母的蛋白质组分配随特定生长速率线性变化, 陈禹, 2022
- 蛋白质组约束揭示了在营养丰富环境中提高微生物适应性的目标, 陈禹, 2021
- 代谢中的蛋白质组约束的数学建模, 陈禹, 2021
- 酵母基于代谢网络和酶动力学优化金属利用, 陈禹, 2021
- 酵母代谢创新通过扩展的代谢网络和基因正选择出现, 陈禹, 2021
- 酵母代谢工程用于发现和生产多胺及多胺类似物, 陈禹, 2021
- 体外周转数不反映酵母酶的体内活性, 陈禹, 2021
- 基因组规模建模用于了解凝结芽孢杆菌的代谢特性, 陈禹, 2020
- 结合机械和机器学习模型预测工程和优化色氨酸代谢, 陈禹, 2020
- 通过重新布线酵母中的碳代谢实现芳香化学品的高水平生产, 陈禹, 2019
- 能量代谢通过蛋白质效率和分配控制表型, 陈禹, 2019
- 系统推断酵母代谢中的功能性磷酸化事件, 陈禹, 2017
- 通过蛋白质磷酸化控制酵母中的流量, 陈禹, 2016
- pH、葡萄糖淀粉酶、普鲁兰酶和转化酶添加对玉米粉水解物中凝结芽孢杆菌HL-5乳酸发酵残糖降解的影响, 陈禹, 2016
- 系统开发和优化化学定义的培养基支持凝结芽孢杆菌的高细胞密度生长, 陈禹, 2016
