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张国庆
Life Science
中国科学院大学
上海
Language: 中文, 英语
计算生物学
生物医学大数据
生物信息学
基因组学
数据分析
微生物组
Sars-Cov-2
宏基因组学
表观遗传学
药物基因组学
Areas of Focus
- 计算生物学 - 生物医学大数据
Work Experience
- 2017-01~现在 - 中国科学院上海营养与健康研究所 - 生物医学大数据中心副主任
- 2016-12~现在 - 中国科学院上海生命科学研究院 - 生物医学大数据中心副主任
- 2007-09~2016-12 - 上海生物信息技术研究中心 - 生命科学数据中心主管
- 2006-07~2007-08 - 上海生物信息技术研究中心 - 生命科学数据中心工程师
Academic Background & Achievements
- 2003-09--2006-06 生物医学工程博士: 华中科技大学
- 2000-09--2003-06 生物医学工程硕士: 华中科技大学
- 1996-09--2000-06 生物化学学士: 华中师范大学
Publications
- Systematic Microbiome Dysbiosis Is Associated with IgA Nephropathy, 第13作者, 2023
- Multi-kingdom microbiota analyses identify bacterial-fungal interactions and biomarkers of colorectal cancer across cohorts, 第11作者, 2022
- PGG.SV: a whole-genome-sequencing-based structural variant resource and data analysis platform, 第11作者, 2022
- Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2022, 第11作者, 2022
- Linking genomic and epidemiologic information to advance the study of COVID-19, 第11作者, 2022
- Mining of novel secondary metabolite biosynthetic gene clusters from acid mine drainage, 第11作者, 2022
- An interactive viral genome evolution network analysis system enabling rapid large-scale molecular tracing of SARS-CoV-2, 第11作者, 2022
- dbDEMC 3.0:Functional Exploration of Differentially Expressed miRNAs in Cancers of Human and Model Organisms, 第11作者, 2022
- Global cold-chain related SARS-CoV-2 transmission identified by pandemic-scale phylogenomics, 第11作者, 2022
- Coronavirus GenBrowser for monitoring the transmission and evolution of SARS-CoV-2, 第11作者, 2022
- TransCirc: an interactive database for translatable circular RNAs based on multi-omics evidence, 第11作者, 2021
- Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021, 第11作者, 2021
- Probiotics and fructo-oligosaccharide intervention modulate the microbiota-gut brain axis to improve autism spectrum reducing also the hyper-serotonergic state and the dopamine metabolism disorder, 第6作者, 2020
- PGG.Han: the Han Chinese genome database and analysis platform, 第22作者, 2020
- EpiDISH web server: Epigenetic Dissection of Intra-Sample-Heterogeneity with online GUI, 第8作者, 2020
- GTDB: an integrated resource for glycosyltransferase sequences and annotations, 第11作者, 2020
- 数字植物：科学内涵、瓶颈及发展策略, 第6作者, 2020
- Knowledge graph embedding by Bias Vectors, 第6作者, 2019
- 生物医学大数据发展的新挑战与趋势, 第1作者, 2018
- 专题：生物医疗大数据——宏基因组大数据分析的质量控制流程规范, 第6作者, 2018
- SysFinder: A customized platform for search, comparison and assisted design of appropriate animal models based on systematic similarity, 第2作者, 2017
- 建设微生物组大数据中心发挥长期科学影响, 未提及, 2017
- Web Resources for Pharmacogenomics, 第11作者, 2015
- Characterization of Full-Length Genomes of Hepatitis B Virus Quasispecies in Sera of Patients at Different Phases of Infection, 第13作者, 2015
- The optimization of running time for a maximum common substructure-based algorithm and its application in drug design, 第11作者, 2014
