Professor | 张国庆 | 数字化转型顾问

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Name	张国庆
Contact Information	gqzhang@picb.ac.cn
Language ability	中文, 英语
Province	上海

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Name

张国庆

Contact Information

gqzhang@picb.ac.cn

Language ability

中文, 英语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	中国科学院大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	2003-09--2006-06 生物医学工程博士: 华中科技大学 2000-09--2003-06 生物医学工程硕士: 华中科技大学 1996-09--2000-06 生物化学学士: 华中师范大学
Work Experience	2017-01~现在 - 中国科学院上海营养与健康研究所 - 生物医学大数据中心副主任 2016-12~现在 - 中国科学院上海生命科学研究院 - 生物医学大数据中心副主任 2007-09~2016-12 - 上海生物信息技术研究中心 - 生命科学数据中心主管 2006-07~2007-08 - 上海生物信息技术研究中心 - 生命科学数据中心工程师

University/Lab Affiliation and Title

中国科学院大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

2003-09--2006-06 生物医学工程博士: 华中科技大学
2000-09--2003-06 生物医学工程硕士: 华中科技大学
1996-09--2000-06 生物化学学士: 华中师范大学

Work Experience

2017-01~现在 - 中国科学院上海营养与健康研究所 - 生物医学大数据中心副主任
2016-12~现在 - 中国科学院上海生命科学研究院 - 生物医学大数据中心副主任
2007-09~2016-12 - 上海生物信息技术研究中心 - 生命科学数据中心主管
2006-07~2007-08 - 上海生物信息技术研究中心 - 生命科学数据中心工程师

Areas of Focus	计算生物学 - 生物医学大数据
Publications	Systematic Microbiome Dysbiosis Is Associated with IgA Nephropathy, 第13作者, 2023 Multi-kingdom microbiota analyses identify bacterial-fungal interactions and biomarkers of colorectal cancer across cohorts, 第11作者, 2022 PGG.SV: a whole-genome-sequencing-based structural variant resource and data analysis platform, 第11作者, 2022 Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2022, 第11作者, 2022 Linking genomic and epidemiologic information to advance the study of COVID-19, 第11作者, 2022 Mining of novel secondary metabolite biosynthetic gene clusters from acid mine drainage, 第11作者, 2022 An interactive viral genome evolution network analysis system enabling rapid large-scale molecular tracing of SARS-CoV-2, 第11作者, 2022 dbDEMC 3.0:Functional Exploration of Differentially Expressed miRNAs in Cancers of Human and Model Organisms, 第11作者, 2022 Global cold-chain related SARS-CoV-2 transmission identified by pandemic-scale phylogenomics, 第11作者, 2022 Coronavirus GenBrowser for monitoring the transmission and evolution of SARS-CoV-2, 第11作者, 2022 TransCirc: an interactive database for translatable circular RNAs based on multi-omics evidence, 第11作者, 2021 Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021, 第11作者, 2021 Probiotics and fructo-oligosaccharide intervention modulate the microbiota-gut brain axis to improve autism spectrum reducing also the hyper-serotonergic state and the dopamine metabolism disorder, 第6作者, 2020 PGG.Han: the Han Chinese genome database and analysis platform, 第22作者, 2020 EpiDISH web server: Epigenetic Dissection of Intra-Sample-Heterogeneity with online GUI, 第8作者, 2020 GTDB: an integrated resource for glycosyltransferase sequences and annotations, 第11作者, 2020 数字植物：科学内涵、瓶颈及发展策略, 第6作者, 2020 Knowledge graph embedding by Bias Vectors, 第6作者, 2019 生物医学大数据发展的新挑战与趋势, 第1作者, 2018 专题：生物医疗大数据——宏基因组大数据分析的质量控制流程规范, 第6作者, 2018 SysFinder: A customized platform for search, comparison and assisted design of appropriate animal models based on systematic similarity, 第2作者, 2017 建设微生物组大数据中心发挥长期科学影响, 未提及, 2017 Web Resources for Pharmacogenomics, 第11作者, 2015 Characterization of Full-Length Genomes of Hepatitis B Virus Quasispecies in Sera of Patients at Different Phases of Infection, 第13作者, 2015 The optimization of running time for a maximum common substructure-based algorithm and its application in drug design, 第11作者, 2014

Areas of Focus

计算生物学 - 生物医学大数据

Publications

Systematic Microbiome Dysbiosis Is Associated with IgA Nephropathy, 第13作者, 2023
Multi-kingdom microbiota analyses identify bacterial-fungal interactions and biomarkers of colorectal cancer across cohorts, 第11作者, 2022
PGG.SV: a whole-genome-sequencing-based structural variant resource and data analysis platform, 第11作者, 2022
Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2022, 第11作者, 2022
Linking genomic and epidemiologic information to advance the study of COVID-19, 第11作者, 2022
Mining of novel secondary metabolite biosynthetic gene clusters from acid mine drainage, 第11作者, 2022
An interactive viral genome evolution network analysis system enabling rapid large-scale molecular tracing of SARS-CoV-2, 第11作者, 2022
dbDEMC 3.0:Functional Exploration of Differentially Expressed miRNAs in Cancers of Human and Model Organisms, 第11作者, 2022
Global cold-chain related SARS-CoV-2 transmission identified by pandemic-scale phylogenomics, 第11作者, 2022
Coronavirus GenBrowser for monitoring the transmission and evolution of SARS-CoV-2, 第11作者, 2022
TransCirc: an interactive database for translatable circular RNAs based on multi-omics evidence, 第11作者, 2021
Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021, 第11作者, 2021
Probiotics and fructo-oligosaccharide intervention modulate the microbiota-gut brain axis to improve autism spectrum reducing also the hyper-serotonergic state and the dopamine metabolism disorder, 第6作者, 2020
PGG.Han: the Han Chinese genome database and analysis platform, 第22作者, 2020
EpiDISH web server: Epigenetic Dissection of Intra-Sample-Heterogeneity with online GUI, 第8作者, 2020
GTDB: an integrated resource for glycosyltransferase sequences and annotations, 第11作者, 2020
数字植物：科学内涵、瓶颈及发展策略, 第6作者, 2020
Knowledge graph embedding by Bias Vectors, 第6作者, 2019
生物医学大数据发展的新挑战与趋势, 第1作者, 2018
专题：生物医疗大数据——宏基因组大数据分析的质量控制流程规范, 第6作者, 2018
SysFinder: A customized platform for search, comparison and assisted design of appropriate animal models based on systematic similarity, 第2作者, 2017
建设微生物组大数据中心发挥长期科学影响, 未提及, 2017
Web Resources for Pharmacogenomics, 第11作者, 2015
Characterization of Full-Length Genomes of Hepatitis B Virus Quasispecies in Sera of Patients at Different Phases of Infection, 第13作者, 2015
The optimization of running time for a maximum common substructure-based algorithm and its application in drug design, 第11作者, 2014

计算生物学生物医学大数据生物信息学基因组学数据分析微生物组 Sars-Cov-2 宏基因组学表观遗传学药物基因组学

郝沛 - 中国科学院大学

刘琦 - 同济大学

杨鹏 - 同济大学

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