Professor | 张勇 | 数字化转型顾问

Name	张勇
Contact Information	yzhang@tongji.edu.cn
Language ability	英语, 汉语
Province	上海

Name

张勇

Contact Information

yzhang@tongji.edu.cn

Language ability

英语, 汉语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	同济大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	2001 - 学士学位：北京大学 2006 - 博士学位：中国科学院生物物理研究所国家杰出青年科学基金获得者
Work Experience	2006-2009 - 哈佛大学Dana-Farber癌症研究所：博士后研究员 2009至今 - 同济大学生命科学与技术学院：教授 2019至今 - 生物信息学系：系主任
Awards	2013年：国家基金委优青 2015年：中组部青年拔尖人才 2017年：上海市优秀学术带头人 2018年：教育部青年长江学者 2019年：教育部自然科学奖一等奖 2020年：国家自然科学奖二等奖 2022年：上海市自然科学奖一等奖 2023年：国家杰出青年科学基金

University/Lab Affiliation and Title

同济大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

2001 - 学士学位：北京大学
2006 - 博士学位：中国科学院生物物理研究所
国家杰出青年科学基金获得者

Work Experience

2006-2009 - 哈佛大学Dana-Farber癌症研究所：博士后研究员
2009至今 - 同济大学生命科学与技术学院：教授
2019至今 - 生物信息学系：系主任

Awards

2013年：国家基金委优青
2015年：中组部青年拔尖人才
2017年：上海市优秀学术带头人
2018年：教育部青年长江学者
2019年：教育部自然科学奖一等奖
2020年：国家自然科学奖二等奖
2022年：上海市自然科学奖一等奖
2023年：国家杰出青年科学基金

Areas of Focus	生物信息学
Publications	Mechanical strain treatment improves nuclear transfer reprogramming efficiency by enhancing chromatin accessibility, Chen Y, Xu R, Zhou S, Zhao C, Hu Z, Hua Y, Xiong Y, Liu X, Lv J, Sun Y, Li C, Gao S, Zhang Y, 2023 Allele-specific H3K9me3 and DNA methylation co-marked CpG-rich regions serve as potential imprinting control regions in pre-implantation embryo, Yang H, Bai D, Li Y, Yu Z, Wang C, Sheng Y, Liu W, Gao S, Zhang Y, 2022 Antibody-free profiling of transcription factor occupancy during early embryogenesis by FitCUT&RUN, Wang X, Wang W, Wang Y, Chen J, Liu G, Zhang Y, 2022 CpG island reconfiguration for the establishment and synchronization of polycomb functions upon exit from naive pluripotency, Huo D, Yu Z, Li R, Gong M, Sidoli S, Lu X, Hou Y, Dai Z, Kong Y, Liu G, Jensen O, Xie W, Helin K, Xiong C, Li G, Zhang Y, Wu X, 2022 Dynamic nucleosome organization after fertilization reveals regulatory factors for mouse zygotic genome activation, Wang C, Chen C, Liu X, Li C, Wu Q, Chen X, Yang L, Kou X, Zhao Y, Wang H, Gao Y, Zhang Y, Gao S, 2022 CStreet: a computed Cell State trajectory inference method for time-series single-cell RNA sequencing data, Zhao C, Xiu W, Hua Y, Zhang N, Zhang Y, Tuersunjiang N, Gao S, Liu W, 2021 Smarca5 mediated epigenetic programming facilitates fetal HSPC development in vertebrates, Ding Y, Wang W, Ma D, Liang G, Kang Z, Xue Y, Zhang Y, Wang L, Heng J, Zhang Y, Liu F, 2021 ncHMR detector: a computational framework to systematically reveal non-classical functions of histone modification regulators, Hu S, Huo D, Yu Z, Chen Y, Liu J, Liu L,

Areas of Focus

生物信息学

Publications

Mechanical strain treatment improves nuclear transfer reprogramming efficiency by enhancing chromatin accessibility, Chen Y, Xu R, Zhou S, Zhao C, Hu Z, Hua Y, Xiong Y, Liu X, Lv J, Sun Y, Li C, Gao S, Zhang Y, 2023
Allele-specific H3K9me3 and DNA methylation co-marked CpG-rich regions serve as potential imprinting control regions in pre-implantation embryo, Yang H, Bai D, Li Y, Yu Z, Wang C, Sheng Y, Liu W, Gao S, Zhang Y, 2022
Antibody-free profiling of transcription factor occupancy during early embryogenesis by FitCUT&RUN, Wang X, Wang W, Wang Y, Chen J, Liu G, Zhang Y, 2022
CpG island reconfiguration for the establishment and synchronization of polycomb functions upon exit from naive pluripotency, Huo D, Yu Z, Li R, Gong M, Sidoli S, Lu X, Hou Y, Dai Z, Kong Y, Liu G, Jensen O, Xie W, Helin K, Xiong C, Li G, Zhang Y, Wu X, 2022
Dynamic nucleosome organization after fertilization reveals regulatory factors for mouse zygotic genome activation, Wang C, Chen C, Liu X, Li C, Wu Q, Chen X, Yang L, Kou X, Zhao Y, Wang H, Gao Y, Zhang Y, Gao S, 2022
CStreet: a computed Cell State trajectory inference method for time-series single-cell RNA sequencing data, Zhao C, Xiu W, Hua Y, Zhang N, Zhang Y, Tuersunjiang N, Gao S, Liu W, 2021
Smarca5 mediated epigenetic programming facilitates fetal HSPC development in vertebrates, Ding Y, Wang W, Ma D, Liang G, Kang Z, Xue Y, Zhang Y, Wang L, Heng J, Zhang Y, Liu F, 2021
ncHMR detector: a computational framework to systematically reveal non-classical functions of histone modification regulators, Hu S, Huo D, Yu Z, Chen Y, Liu J, Liu L,

基因组学转录调控表观遗传学细胞命运人工智能算法开发数据分析胚胎发展染色质可及性基因表达

刘琦 - 同济大学

啜国晖 - 同济大学

王晓雷 - 上海交通大学

Area of Focus
模拟 | 生物分子 | 蛋白质 | 分子相互作用 | 计算 | 酶 | 催化 | 生化 | 机制 | 人工智能 | 基因组学 | 大数据 | 结构生物学

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