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曹志伟
Life Sciences
复旦大学
上海
Language: 中文, 英语
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生物信息学 计算生物学 创新药物智能设计 计算机辅助疫苗设计 抗体设计 多组分药物协同作用 抗原表位预测 免疫交叉反应 虚拟筛选 中药
Areas of Focus
  • 生物信息学
  • 计算生物学
  • 创新药物智能设计
  • 计算机辅助疫苗设计
Work Experience
  • 上海生物信息技术研究中心 - 职位未提及
  • 同济大学生命科学与技术学院 - 职位未提及
  • 中华中医药学会中医药信息分会副主委
  • 世中联中药系统科学与工程专委会副会长
  • 上海中西医结合学会系统医学专业委员会副主任
  • 上海生物信息学会理事
  • 2020-至今: Journal of Cellular Biochemistry 副主编
  • 科技部2021-2025 科技部“BT-IT融合”重点专项指南编制专家
  • 2021-2035国家中长期科技发展规划生物信息子领域执笔人
Academic Background & Achievements
  • 本科毕业于南开大学
  • 硕士毕业于南京大学
  • 博士毕业于新加坡国立大学
  • 上海浦江人才
  • 曙光学者
  • 教育部新世纪优秀人才
Publications
  • HIT 2.0: an enhanced platform for Herbal Ingredients' Targets, Deyu Yan, Genhui Zheng, Caicui Wang, Zikun Chen, Tiantian Mao, Jian Gao, Yu Yan, Xiangyi Chen, Xuejie Ji, Jinyu Yu, Saifeng Mo, Haonan Wen, Wenhao Han, Mengdi Zhou, Yuan Wang, Jun Wang, Kailin Tang, Zhiwei Cao, 2022
  • Rank-in: Enabling integrative analysis across microarray and RNA-seq for cancer, KaiLin Tang, XueJie Ji, MengDi Zhou, ZeLiang Deng, YuWei Huang, GenHui Zheng, Zhiwei Cao, 2021
  • The evolution pathway of ammonia-oxidizing archaea shaped by major geological events, Yiyan Yang, Chuanlun Zhang, Timothy M. Lenton, Xinmiao Yan, Maoyan Zhu, Mengdi Zhou, Jianchang Tao, Tommy J. Phelps, Zhiwei Cao, 2021
  • SEPPA 3.0-enhanced spatial epitope prediction enabling glycoprotein antigens, Chen Zhou, Zikun Chen, Lu Zhang, DeYu Yan, Tian Mao, Kailin Tang, Tianyi Qiu, Zhiwei Cao, 2019
  • CE-BLAST: Making it possible to compute antigenic similarity for newly emerging pathogens, Tianyi Qiu, Yiyan Yang, Jingxuan Qiu, Yang Huang, Tianlei Xu, Han Xiao, Dingfeng Wu, Qingchen Zhang, Chen Zhou, Xiaoyan Zhang, Kailin Tang, Jianqing Xu, Zhiwei Cao, 2018
  • Combining genomic and network characteristics for extended capability in predicting synergistic drugs for cancer, Y. Sun, Z. Sheng, C. Ma, K. Tang, R. Zhu, Z. Wu, R. Shen, J. Feng, D. Wu, D. Huang, D. Huang, J. Fei, Q. Liu, ZW Cao, 2015
  • HIT: linking herbal active ingredients to targets, Hao Ye, Li Ye, Hong Kang, Duanfeng Zhang, Lin Tao, Kailin Tang, Xueping Liu, Ruixin Zhu, Qi Liu, Y. Z. Chen, Yixue Li, Zhiwei Cao, 2011
  • SEPPA 2.0--more refined server to predict spatial epitope considering species of immune host and subcellular localization of protein antigen, Qi Tao, T Qiu, Q Zhang, K Tang, Y Fan, J Qiu, D Wu, W Zhang, Y Chen, J Gao, R Zhu, ZW Cao, 2014
  • SEPPA: a computational server for spatial epitope prediction of protein antigens, J Sun, D Wu, T Xu, X Wang, X Xu, L Tao, YX Li, ZW Cao, 2009
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