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田卫东
Life Science
复旦大学
上海
Language: 中文, 英语
生物信息学
疾病编码变异
非编码调控序列
临床表型数据
算法开发
单细胞数据
Rna编辑
基因转录调控
生物通路
生物网络
Areas of Focus
- 生物信息学方法开发和应用
- 疾病编码变异和非编码调控序列变异的筛选
- 临床表型数据分析的算法开发和应用
- 单细胞数据的分析方法开发和临床应用
- RNA编辑和基因转录调控
- 生物通路和生物网络的分析方法开发和应用
Work Experience
- 2008 - 现在 - 复旦大学 - 教授
- 2008 - 现在 - 复旦大学遗传工程国家重点实验室 - PI
- 2009 - 现在 - 复旦大学附属儿科医院 - 兼职PI
- 2018 - 现在 - 山东大学齐鲁儿童医院 - 兼职PI
Academic Background & Achievements
- 1995 - 学士学位: 上海交通大学
- 1998 - 硕士学位: 清华大学
- 2004 - 博士学位: 美国华盛顿大学（圣路易斯）
- 2005-2008 - 博士后研究: 美国哈佛大学医学院
- 2008 - 教授: 复旦大学
- 2008 - PI: 复旦大学遗传工程国家重点实验室
- 2009 - 兼职PI: 复旦大学附属儿科医院
- 2018 - 兼职PI: 山东大学齐鲁儿童医院
- 上海浦江人才
- 上海曙光学者
Publications
- Unsupervised Inference of Developmental Directions for Single Cells Using VECTOR, Zhang, F., Li, X., Tian, W#., 2020
- A novel approach to remove the batch effect of single-cell data, Zhang, F., Wu, Y., Tian, W#., 2019
- PhenoPro: A novel toolkit for assisting in the diagnosis of Mendelian diseases, Li, Z*., Zhang, F*., Wang, Y., Qiu, Y., Wu, Y., Lu, Y., Yang, L., Qu, W.J., Wang, H., Zhou, W.#, and Tian W#., 2019
- SPRINT: an SNP-free toolkit for identifying RNA editing sites, Zhang, F., Lu, Y., Yan, S., Xing, Q., Tian W#., 2017
- Explaining the disease phenotype of intergenic SNP through predicted long range regulation, Chen, J. and Tian, W.#, 2016
- Genome-Wide Identification of Regulatory Sequences Undergoing Accelerated Evolution in the Human Genome, Dong, X., Wang, X., Zhang, F. and Tian, W#., 2016
- GoFDR: A sequence alignment based method for predicting protein functions, Gong, Q., Ning, W. and Tian, W#., 2016
- GSA-Lightning: ultra-fast permutation-based gene set analysis, Chang, B.H. and Tian, W.#, 2016
- 《生物信息学与功能基因组学》, 田卫东，赵兴明, 2020
Awards
- 上海浦江人才
- 上海曙光学者
