Professor | 李婧 | 数字化转型顾问

Name

李婧

Contact Information

jing.li@sjtu.edu.cn

Language ability

英语, 汉语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	上海交通大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	2007年至2010年博士后：美国范德堡大学生物医学信息学系
Work Experience	2010年至今 - 上海交通大学，从副教授到教授，生物信息学与生物统计学系

University/Lab Affiliation and Title

上海交通大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

Work Experience

Areas of Focus	蛋白质组学生物信息学组学数据统计生物信息软件与数据库开发
Publications	PTMint数据库：实验验证的PTM调控蛋白-蛋白相互作用, 洪X, 李N, 吕J, 张Y, 李J, 张J, 陈HF, 2023 通过多层网络中的贪婪算法全球传播用于癌症治疗的药物重定位, 程X, 赵W, 朱M, 王B, 王X, 杨X, 黄Y, 谭M, 李J, 2021 3D基因组结构的整合分析揭示CTCF维持小鼠雌性生殖干细胞的特性, 田GG, 赵X, 侯C, 谢W, 李X, 王Y, 王L, 李H, 赵X, 李J, 吴J, 2022 社区支持的宏蛋白质组学流程，用于改善热液喷口微生物群中的肽鉴定, 常Y, 范Q, 侯J, 张Y, 李J, 2021 SPA：患者来源异种移植模型中MS数据的定量策略, 程X, 钱L, 王B, 谭M, 李J, 2021 人类肺腺癌的整合蛋白质组学表征, 徐JY, 张C, 王X, 翟L, 马Y, ..., 钱X, 王Y, 李J, 何F, 肖T, 谭M, 2020 CanProVar 2.0：更新的人类癌症蛋白质组变异数据库, 张M, 王B, 徐J, 王X, 谢L, 张B, 李Y, 李J, 2017 用于鉴定散弹枪蛋白质组学中变异肽的生物信息学工作流程, 李J, 苏Z, 马ZQ, 斯莱博斯RJ, 哈尔维P, 塔布DL, 利布勒DC, 包W, 张B, 2011 网络辅助的蛋白质鉴定和散弹枪蛋白质组学数据解释, 李J, 齐默尔曼LJ, 朴BH, 塔布DL, 利布勒DC, 张B, 2009 小鼠大脑中基本/螺旋-环-螺旋转录因子的调控模块网络, 李J, 刘ZJ, 潘YC, 刘Q, 傅X, 库珀NG, 李Y, 邱M, 石T, 2007

Areas of Focus

蛋白质组学生物信息学
组学数据统计
生物信息软件与数据库开发

Publications

PTMint数据库：实验验证的PTM调控蛋白-蛋白相互作用, 洪X, 李N, 吕J, 张Y, 李J, 张J, 陈HF, 2023
通过多层网络中的贪婪算法全球传播用于癌症治疗的药物重定位, 程X, 赵W, 朱M, 王B, 王X, 杨X, 黄Y, 谭M, 李J, 2021
3D基因组结构的整合分析揭示CTCF维持小鼠雌性生殖干细胞的特性, 田GG, 赵X, 侯C, 谢W, 李X, 王Y, 王L, 李H, 赵X, 李J, 吴J, 2022
社区支持的宏蛋白质组学流程，用于改善热液喷口微生物群中的肽鉴定, 常Y, 范Q, 侯J, 张Y, 李J, 2021
SPA：患者来源异种移植模型中MS数据的定量策略, 程X, 钱L, 王B, 谭M, 李J, 2021
人类肺腺癌的整合蛋白质组学表征, 徐JY, 张C, 王X, 翟L, 马Y, ..., 钱X, 王Y, 李J, 何F, 肖T, 谭M, 2020
CanProVar 2.0：更新的人类癌症蛋白质组变异数据库, 张M, 王B, 徐J, 王X, 谢L, 张B, 李Y, 李J, 2017
用于鉴定散弹枪蛋白质组学中变异肽的生物信息学工作流程, 李J, 苏Z, 马ZQ, 斯莱博斯RJ, 哈尔维P, 塔布DL, 利布勒DC, 包W, 张B, 2011
网络辅助的蛋白质鉴定和散弹枪蛋白质组学数据解释, 李J, 齐默尔曼LJ, 朴BH, 塔布DL, 利布勒DC, 张B, 2009
小鼠大脑中基本/螺旋-环-螺旋转录因子的调控模块网络, 李J, 刘ZJ, 潘YC, 刘Q, 傅X, 库珀NG, 李Y, 邱M, 石T, 2007

蛋白质组学生物信息学数据分析软件开发数据库统计计算生物学基因组学数据整合算法开发

刘琦 - 同济大学

张勇 - 同济大学

张晓艳 - 同济大学

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