Professor | 徐莹莹 | 数字化转型顾问

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Name	徐莹莹
Contact Information	yyxu@smu.edu.cn
Language ability	英语, 中文
Province	广东

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Name

徐莹莹

Contact Information

yyxu@smu.edu.cn

Language ability

英语, 中文

Province

广东

University/Lab Affiliation and Title	南方医科大学
Faculty	Biomedical Engineering
Academic Background & Achievements	2011.09-2017.06 博士: 上海交通大学，模式识别与智能系统 2015.09-2016.09 联合培养博士生: 美国卡内基梅隆大学，计算生物学
Work Experience	2017.07至今 - 南方医科大学 - 副教授

University/Lab Affiliation and Title

南方医科大学

Faculty

Biomedical Engineering

Academic Background & Achievements

2011.09-2017.06 博士: 上海交通大学，模式识别与智能系统
2015.09-2016.09 联合培养博士生: 美国卡内基梅隆大学，计算生物学

Work Experience

2017.07至今 - 南方医科大学 - 副教授

Areas of Focus	生物图像信息学与模式识别
Publications	基于深度学习的单细胞免疫荧光图像中蛋白质亚细胞位置模式的自动识别, 朱锡良, 包林霞, 薛敏琪, 徐莹莹, 2022 自动分类免疫组化图像中的蛋白质表达水平以提高癌症生物标志物的检测, 薛珍珍, 李成, 罗卓明, 王珊珊, 徐莹莹, 2022 GraphLoc: 一种基于图神经网络的免疫组化图像蛋白质亚细胞定位预测模型, 胡金贤, 杨阳, 徐莹莹, 沈红斌, 2022 利用卷积神经网络的迁移学习提高小样本3D CT图像中肾肿瘤的分割和分类, 朱锡良, 沈红斌, 孙海涛, 段丽霞, 徐莹莹, 2022 从异构数据中学习蛋白质亚细胞定位多视图模式, 王戈, 薛敏琪, 沈红斌, 徐莹莹, 2022 DULoc: 基于深度学习特征的免疫荧光图像中蛋白质亚细胞位置模式的定量分离, 薛敏琪, 朱锡良, 王戈, 徐莹莹, 2022 将标签相关性纳入深度神经网络以分类免疫组化图像中的蛋白质亚细胞位置模式, 胡金贤, 杨阳, 徐莹莹, 沈红斌, 2022 通过结合三维结构信息提高蛋白质亚细胞位置分类, 王戈, 翟宇佳, 薛珍珍, 徐莹莹, 2021 蛋白质亚细胞位置注释的一致性和变化, 徐莹莹, 周航, Robert F. Murphy, 沈红斌, 2021 自动分类免疫组化图像中的蛋白质亚细胞定位以揭示结肠癌中的生物标志物, 薛珍珍, 吴艳霞, 高庆祖, 赵亮, 徐莹莹, 2020 通过分析免疫组化图像学习蛋白质的复杂亚细胞分布模式, 徐莹莹, 沈红斌, Robert F. Murphy, 2020 基于生物图像的蛋白质亚细胞位置预测：全面综述, 徐莹莹, 姚丽秀, 沈红斌, 2018 一种基于细胞器相关性引导的特征选择方法用于多标签亚细胞生物图像分类, 邵伟, 刘明霞, 徐莹莹, 沈红斌, 张道强, 2018 将细胞器相关性纳入半监督学习以预测蛋白质亚细胞定位, 徐莹莹, 杨帆, 沈红斌, 2016 通过链学习和特征稀疏表示增强跨膜β-桶段的预测, 殷希, 徐莹莹, 沈红斌, 2016 基于生物成像的半监督学习检测人类癌症中的蛋白质错误定位, 徐莹莹, 杨帆, 张扬, 沈红斌, 2015 通过集成学习全局和局部特征对人类生殖组织中蛋白质亚细胞位置模式的图像分类, 杨帆, 徐莹莹, 王世通, 沈红斌, 2014 一种基于图像的多标签人类蛋白质亚细胞定位预测器（iLocator）揭示癌症组织中的蛋白质错误定位, 徐莹莹, 杨帆, 张扬, 沈红斌, 2013

Areas of Focus

生物图像信息学与模式识别

Publications

基于深度学习的单细胞免疫荧光图像中蛋白质亚细胞位置模式的自动识别, 朱锡良, 包林霞, 薛敏琪, 徐莹莹, 2022
自动分类免疫组化图像中的蛋白质表达水平以提高癌症生物标志物的检测, 薛珍珍, 李成, 罗卓明, 王珊珊, 徐莹莹, 2022
GraphLoc: 一种基于图神经网络的免疫组化图像蛋白质亚细胞定位预测模型, 胡金贤, 杨阳, 徐莹莹, 沈红斌, 2022
利用卷积神经网络的迁移学习提高小样本3D CT图像中肾肿瘤的分割和分类, 朱锡良, 沈红斌, 孙海涛, 段丽霞, 徐莹莹, 2022
从异构数据中学习蛋白质亚细胞定位多视图模式, 王戈, 薛敏琪, 沈红斌, 徐莹莹, 2022
DULoc: 基于深度学习特征的免疫荧光图像中蛋白质亚细胞位置模式的定量分离, 薛敏琪, 朱锡良, 王戈, 徐莹莹, 2022
将标签相关性纳入深度神经网络以分类免疫组化图像中的蛋白质亚细胞位置模式, 胡金贤, 杨阳, 徐莹莹, 沈红斌, 2022
通过结合三维结构信息提高蛋白质亚细胞位置分类, 王戈, 翟宇佳, 薛珍珍, 徐莹莹, 2021
蛋白质亚细胞位置注释的一致性和变化, 徐莹莹, 周航, Robert F. Murphy, 沈红斌, 2021
自动分类免疫组化图像中的蛋白质亚细胞定位以揭示结肠癌中的生物标志物, 薛珍珍, 吴艳霞, 高庆祖, 赵亮, 徐莹莹, 2020
通过分析免疫组化图像学习蛋白质的复杂亚细胞分布模式, 徐莹莹, 沈红斌, Robert F. Murphy, 2020
基于生物图像的蛋白质亚细胞位置预测：全面综述, 徐莹莹, 姚丽秀, 沈红斌, 2018
一种基于细胞器相关性引导的特征选择方法用于多标签亚细胞生物图像分类, 邵伟, 刘明霞, 徐莹莹, 沈红斌, 张道强, 2018
将细胞器相关性纳入半监督学习以预测蛋白质亚细胞定位, 徐莹莹, 杨帆, 沈红斌, 2016
通过链学习和特征稀疏表示增强跨膜β-桶段的预测, 殷希, 徐莹莹, 沈红斌, 2016
基于生物成像的半监督学习检测人类癌症中的蛋白质错误定位, 徐莹莹, 杨帆, 张扬, 沈红斌, 2015
通过集成学习全局和局部特征对人类生殖组织中蛋白质亚细胞位置模式的图像分类, 杨帆, 徐莹莹, 王世通, 沈红斌, 2014
一种基于图像的多标签人类蛋白质亚细胞定位预测器（iLocator）揭示癌症组织中的蛋白质错误定位, 徐莹莹, 杨帆, 张扬, 沈红斌, 2013

生物图像信息学模式识别深度学习蛋白质定位免疫荧光亚细胞定量分析计算生物学机器学习

郭遥 - 上海交通大学

钱晓华 - 上海交通大学

向孙程 - 上海交通大学

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