Professor | 陈加余 | 数字化转型顾问

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Name	陈加余
Contact Information	jiayuchen@nju.edu.cn
Language ability	中文, 英语
Province	江苏

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Name

陈加余

Contact Information

jiayuchen@nju.edu.cn

Language ability

中文, 英语

Province

江苏

University/Lab Affiliation and Title	南京大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	2006-2010 学士学位: 山东大学生命科学学院 2010-2015 博士学位: 北京大学分子医学研究所
Work Experience	2016-2021 - 加州大学圣地亚哥分校 - 博士后 2021- - 南京大学 - 特任研究员 2021- - 南京大学化学与生物医药创新研究院 - 特任研究员

University/Lab Affiliation and Title

南京大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

2006-2010 学士学位: 山东大学生命科学学院
2010-2015 博士学位: 北京大学分子医学研究所

Work Experience

2016-2021 - 加州大学圣地亚哥分校 - 博士后
2021- - 南京大学 - 特任研究员
2021- - 南京大学化学与生物医药创新研究院 - 特任研究员

Areas of Focus	非经典核酸结构调控RNA
Publications	化学蛋白质组学分析揭示与内源性三链DNA相互作用的内源性蛋白的结合和功能多样性, Xu, H., Ye, J., Zhang, K.X., Hu, Q., Cui, T., Tong, C., Wang, M., Geng, H., Shui, K.M., Sun, Y., Wang, J., Hou, X., Zhang, K., Xie, R., Yin, Y., Chen, N. and Chen, J.Y.#, 2024 深度学习增强的R-loop预测为重复扩展疾病提供机制性启示, Hu, J., Xing, Z., Yang, H., Zhou, Y., Guo, L., Zhang, X., Xu, L., Liu, Q., Ye, J., Zhong, X., Wang, J., Lin, R., Long, E., Jiang, J., Chen, L., Pan, Y., He, L.# and Chen, J.Y.#, 2024 nASAP: 新生RNA分析平台, Wang, Z., Ge, P., Zhou, X.L., Shui, K.M., Geng, H., Yang, J.#, Chen, J.Y.# and Wang, J.#, 2023 在精子发生过程中由寡核小体片段形成的微同源介导的环状DNA, Hu, J., Zhang, Z., Xiao, S., Cao, Y., Chen, Y., Weng, J., Jiang, H.#, Li, W.#, Chen, J.Y.# and Liu, C.#, 2023 R-loopBase: 一个用于全基因组R-loop形成和调控的知识库, Lin, R., Zhong, X.#, Zhou, Y., Geng, H., Hu, Q., Huang, Z., Hu, J., Fu, X.D., Chen, L.# and Chen, J.Y.#, 2021 RNA结合蛋白在染色质水平上调控基因表达的机制解析, Chen, J.Y., Lim, D.H. and Fu, X.D., 2019 广泛的染色质-RNA结合蛋白相互作用使RNA调控转录成为可能, Xiao, R., Chen, J.Y. et al., 2019 使用催化失活的RNASEH1进行全基因组R-loop映射的R-ChIP, Chen, J.Y. et al., 2019 进化上重要的A-to-I RNA编辑事件通过灵长类动物中的G-to-A突变起源, An, N.A., Ding, W. , Yang, X.Z., …, Chen, J.Y.#and Li, C.Y.#, 2019 增强的R-loop是由高风险剪接因子突变引起的骨髓增生异常综合征的统一机制, Chen, L., Chen, J.Y.* et al., 2018 使用失活的RNase H的R-ChIP揭示了R-loop与基因启动子处转录暂停的动态耦合, Chen, L., Chen, J.Y., Zhang, X., Gu, Y., Xiao, R., Shao, C., …, Fu, X.D. et al., 2017 功能性De Novo蛋白从灵长类动物祖先LncRNA起源的三部曲：出现、保留和选择, Chen, J.Y.* et al., 2015 选择性约束的RNA编辑调控与灵长类动物中的piRNA生物发生相互作用, Yang, X.Z., Chen, J.Y. et al., 2015 由净化选择塑造的猕猴RNA编辑组, Chen, J.Y.* et al., 2014 人科特有的从长非编码RNA起源的De Novo蛋白编码基因, Xie, C., Zhang, Y.E., Chen, J.Y.* et al., 2012

Areas of Focus

非经典核酸结构
调控RNA

Publications

化学蛋白质组学分析揭示与内源性三链DNA相互作用的内源性蛋白的结合和功能多样性, Xu, H.*, Ye, J.*, Zhang, K.X.*, Hu, Q., Cui, T., Tong, C., Wang, M., Geng, H., Shui, K.M., Sun, Y., Wang, J., Hou, X., Zhang, K., Xie, R., Yin, Y., Chen, N. and Chen, J.Y.#, 2024
深度学习增强的R-loop预测为重复扩展疾病提供机制性启示, Hu, J.*, Xing, Z.*, Yang, H.*, Zhou, Y.*, Guo, L., Zhang, X., Xu, L., Liu, Q., Ye, J., Zhong, X., Wang, J., Lin, R., Long, E., Jiang, J., Chen, L., Pan, Y., He, L.# and Chen, J.Y.#, 2024
nASAP: 新生RNA分析平台, Wang, Z., Ge, P., Zhou, X.L., Shui, K.M., Geng, H., Yang, J.#, Chen, J.Y.# and Wang, J.#, 2023
在精子发生过程中由寡核小体片段形成的微同源介导的环状DNA, Hu, J.*, Zhang, Z.*, Xiao, S., Cao, Y., Chen, Y., Weng, J., Jiang, H.#, Li, W.#, Chen, J.Y.# and Liu, C.#, 2023
R-loopBase: 一个用于全基因组R-loop形成和调控的知识库, Lin, R.*, Zhong, X.*#, Zhou, Y.*, Geng, H., Hu, Q., Huang, Z., Hu, J., Fu, X.D., Chen, L.# and Chen, J.Y.#, 2021
RNA结合蛋白在染色质水平上调控基因表达的机制解析, Chen, J.Y., Lim, D.H. and Fu, X.D., 2019
广泛的染色质-RNA结合蛋白相互作用使RNA调控转录成为可能, Xiao, R.*, Chen, J.Y.* et al., 2019
使用催化失活的RNASEH1进行全基因组R-loop映射的R-ChIP, Chen, J.Y. et al., 2019
进化上重要的A-to-I RNA编辑事件通过灵长类动物中的G-to-A突变起源, An, N.A.*, Ding, W. *, Yang, X.Z.*, …, Chen, J.Y.#and Li, C.Y.#, 2019
增强的R-loop是由高风险剪接因子突变引起的骨髓增生异常综合征的统一机制, Chen, L.*, Chen, J.Y.* et al., 2018
使用失活的RNase H的R-ChIP揭示了R-loop与基因启动子处转录暂停的动态耦合, Chen, L.*, Chen, J.Y.*, Zhang, X., Gu, Y., Xiao, R., Shao, C., …, Fu, X.D. et al., 2017
功能性De Novo蛋白从灵长类动物祖先LncRNA起源的三部曲：出现、保留和选择, Chen, J.Y.* et al., 2015
选择性约束的RNA编辑调控与灵长类动物中的piRNA生物发生相互作用, Yang, X.Z.*, Chen, J.Y.* et al., 2015
由净化选择塑造的猕猴RNA编辑组, Chen, J.Y.* et al., 2014
人科特有的从长非编码RNA起源的De Novo蛋白编码基因, Xie, C.*, Zhang, Y.E.*, Chen, J.Y.* et al., 2012

基因组学生物信息学分子生物学化学生物学核酸药物靶标生物标志物治疗学 Rna Dna

周晓艺 - 上海师范大学

冯畅 - 上海大学

Area of Focus
生物标志物 | 癌症 | 检测 | 诊断 | Dna | Rna | 放大 | 分子生物学 | 生物化学 | 临床研究

刘念 - 清华大学

Area of Focus
转座子 | Dna | 基因组学 | 暗物质 | 整合 | 移动 | 生物机制 | 胚胎发育 | 神经发育 | 疾病

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