Professor | 涂晓雨 | 数字化转型顾问

Name	涂晓雨
Contact Information	xiaoyutu@sjtu.edu.cn
Language ability	中文, 英语
Province	上海

Name

涂晓雨

Contact Information

xiaoyutu@sjtu.edu.cn

Language ability

中文, 英语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	上海交通大学
Faculty	Agriculture and Biotechnology
Academic Background & Achievements	2015.11-2019.10 博士: 香港中文大学康奈尔大学Boyce Thompson研究所访问学者
Work Experience	2021.09 - 至今 - 上海交通大学，长聘教轨副教授，课题组长、博导 2019.11-2021.08 - 香港中文大学 / 中国科学院华南植物园，博士后 2018.05-2019.07 - 康奈尔大学Boyce Thompson研究所，访问学者
Awards	2024.01-2027.12 国家自然科学基金面上项目（32370247） 2023 入选上海交通大学“2030计划”C类项目 2022 入选上海市“海外高层次人才引进计划” 2022.01-2024.12 国家自然科学基金青年项目（32100438） 2021.09-2024.12 上海交通大学双一流建设项目 2021 入选广东省“珠江人才计划”（博士后资助项目） 2021.07-2021.08 中国博士后科学基金会特别资助（站中） 2020.07-2021.08 中国博士后科学基金会面上资助

University/Lab Affiliation and Title

上海交通大学

Faculty

Agriculture and Biotechnology

Academic Background & Achievements

2015.11-2019.10 博士: 香港中文大学
康奈尔大学Boyce Thompson研究所访问学者

Work Experience

2021.09 - 至今 - 上海交通大学，长聘教轨副教授，课题组长、博导
2019.11-2021.08 - 香港中文大学 / 中国科学院华南植物园，博士后
2018.05-2019.07 - 康奈尔大学Boyce Thompson研究所，访问学者

Awards

2024.01-2027.12 国家自然科学基金面上项目（32370247）
2023 入选上海交通大学“2030计划”C类项目
2022 入选上海市“海外高层次人才引进计划”
2022.01-2024.12 国家自然科学基金青年项目（32100438）
2021.09-2024.12 上海交通大学双一流建设项目
2021 入选广东省“珠江人才计划”（博士后资助项目）
2021.07-2021.08 中国博士后科学基金会特别资助（站中）
2020.07-2021.08 中国博士后科学基金会面上资助

Areas of Focus	植物功能基因组学表观遗传调控（染色质开放性及三维结构、组蛋白翻译后修饰、DNA甲基化等）遗传调控（转录因子的调控网络构建、共结合、结合足迹等）
Publications	Limited conservation in cross-species comparison of GLK transcription factor binding suggested wide-spread cistrome divergence, 涂晓雨, 任思远, 沈文, 李佳, 李云, 李晨, 李云, 宗哲, 谢伟, Grierson, D., 费志, Giovannoni, J., 李平, 钟森, 2022 Reconstructing the maize leaf regulatory network using ChIP-seq data of 104 transcription factors, 涂晓雨, Mejía-Guerra, M.K., Valdes Franco, J.A., Tzeng, D., Chu, P., 沈文, 魏阳, 戴晓, 李平, Buckler, E.S., 钟森, 2020 A combinatorial indexing strategy for low-cost epigenomic profiling of plant single cells, 涂晓雨, Marand, A.P., Schmitz, R.J., 钟森, 2022 Histone H2A monoubiquitination marks are targeted to specific sites by cohesin subunits in Arabidopsis, 张毅, 马明, 刘明, 孙爱, 郑晓, 刘坤, 尹春, 李晨, 姜晨, 涂晓雨, 方勇, 2023 3D chromatin architecture of large plant genomes determined by local A/B compartments, 董鹏, 涂晓雨, Chu, P., 吕鹏, 朱宁, Grierson, D., 杜波, 李平, 钟森, 2017 Tissue-specific Hi-C analyses of rice, foxtail millet and maize suggest non-canonical function of plant chromatin domains, 董鹏, 涂晓雨, 李红, 张建, Grierson, D., 李平, 钟森, 2020 Chromatin and regulatory differentiation between bundle sheath and mesophyll cells in maize, 戴晓, 涂晓雨, 杜波, 董鹏, 孙松, 王旭, 孙建, Gang, L., Lu, T., 钟森, 李平, 2022

Areas of Focus

植物功能基因组学
表观遗传调控（染色质开放性及三维结构、组蛋白翻译后修饰、DNA甲基化等）
遗传调控（转录因子的调控网络构建、共结合、结合足迹等）

Publications

Limited conservation in cross-species comparison of GLK transcription factor binding suggested wide-spread cistrome divergence, 涂晓雨, 任思远, 沈文, 李佳, 李云, 李晨, 李云, 宗哲, 谢伟, Grierson, D., 费志, Giovannoni, J., 李平, 钟森, 2022
Reconstructing the maize leaf regulatory network using ChIP-seq data of 104 transcription factors, 涂晓雨, Mejía-Guerra, M.K., Valdes Franco, J.A., Tzeng, D., Chu, P., 沈文, 魏阳, 戴晓, 李平, Buckler, E.S., 钟森, 2020
A combinatorial indexing strategy for low-cost epigenomic profiling of plant single cells, 涂晓雨, Marand, A.P., Schmitz, R.J., 钟森, 2022
Histone H2A monoubiquitination marks are targeted to specific sites by cohesin subunits in Arabidopsis, 张毅, 马明, 刘明, 孙爱, 郑晓, 刘坤, 尹春, 李晨, 姜晨, 涂晓雨, 方勇, 2023
3D chromatin architecture of large plant genomes determined by local A/B compartments, 董鹏, 涂晓雨, Chu, P., 吕鹏, 朱宁, Grierson, D., 杜波, 李平, 钟森, 2017
Tissue-specific Hi-C analyses of rice, foxtail millet and maize suggest non-canonical function of plant chromatin domains, 董鹏, 涂晓雨, 李红, 张建, Grierson, D., 李平, 钟森, 2020
Chromatin and regulatory differentiation between bundle sheath and mesophyll cells in maize, 戴晓, 涂晓雨, 杜波, 董鹏, 孙松, 王旭, 孙建, Gang, L., Lu, T., 钟森, 李平, 2022

植物基因组学功能基因组学表观遗传学染色质结构组蛋白修饰 Dna甲基化遗传调控转录因子共结合结合足迹

高洪波 - 上海交通大学

孙镇菲 - 上海交通大学

曹晓风 - 中国科学院大学

Area of Focus
表观遗传学 | 遗传学 | 植物 | 基因调控 | Dna甲基化 | 组蛋白修饰 | 染色质 | 转录 | Rna | 发育

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