Professor | 蒋太交 | 数字化转型顾问

Name	蒋太交
Contact Information	taijiao@ibms.pumc.edu.cn
Language ability	中文, 英语
Province	北京

Name

蒋太交

Contact Information

taijiao@ibms.pumc.edu.cn

Language ability

中文, 英语

Province

北京

University/Lab Affiliation and Title	北京协和医学院
Faculty	Basic Medical Sciences
Academic Background & Achievements	1990-1994: 湖南师范大学学士学位 1994-1999: 中国科学院上海生物化学研究所生物化学和分子生物学博士学位 2001-2002: 耶鲁大学计算机科学硕士学位国家“杰出青年基金”获得者中科院“百人计划”获得者北京协和医学院“协和学者”获得者
Work Experience	1999-2002: 在耶鲁大学Sidney Altman教授实验室从事RNA结构和功能研究 2003-2004: 在麻省理工学院Amy Keating教授实验室进行计算结构生物学和系统生物学研究 2004-2015: 中国科学院生物物理研究所研究员 2015至今: 中国医学科学院基础医学研究所系统医学研究中心、苏州系统医学研究所研究员
Awards	国家“杰出青年基金” 中科院“百人计划” 北京协和医学院“协和学者”

University/Lab Affiliation and Title

北京协和医学院

Faculty

Basic Medical Sciences

Academic Background & Achievements

1990-1994: 湖南师范大学学士学位
1994-1999: 中国科学院上海生物化学研究所生物化学和分子生物学博士学位
2001-2002: 耶鲁大学计算机科学硕士学位
国家“杰出青年基金”获得者
中科院“百人计划”获得者
北京协和医学院“协和学者”获得者

Work Experience

1999-2002: 在耶鲁大学Sidney Altman教授实验室从事RNA结构和功能研究
2003-2004: 在麻省理工学院Amy Keating教授实验室进行计算结构生物学和系统生物学研究
2004-2015: 中国科学院生物物理研究所研究员
2015至今: 中国医学科学院基础医学研究所系统医学研究中心、苏州系统医学研究所研究员

Awards

国家“杰出青年基金”
中科院“百人计划”
北京协和医学院“协和学者”

Areas of Focus	开发新的计算生物学方法复杂疾病的分子机制疾病关键分子标志物的识别
Publications	中国的持续抗原多样化导致全球禽流感H5N1病毒的抗原复杂性, 彭有松, 李晓丹, 周红波, 吴爱萍, 董立波, 张烨, 高荣宝, 洪波, 杨磊, 王大燕, 林贤, 金美琳, 舒跃龙, 蒋太交, 2017 cooccurNet: 用于共现网络构建和分析的R包, 邹元强, 吴志强, 邓立宗, 吴爱萍, 吴凡, 李克利, 蒋太交, 彭有松, 2017 基于保守抗原结构预测流感A病毒抗原变体的通用计算模型, 彭有松, 王大燕, 王建宏, 李克利, 谭中阳, 舒跃龙, 蒋太交, 2017 通过双分子发光互补报告系统筛选针对流感病毒聚合酶复合物组装的新型小分子抑制剂, 李春风, 王子宁, 曹阳, 王璐兰, 解静云, 陈志高, 邓涛, 蒋太交, 程根宏, 秦小峰, 2017 PREDAC-H3: 基于血凝素序列的人流感A (H3N2)病毒抗原监测的用户友好平台, 彭有松, 杨磊, 李红磊, 邹元强, 邓立宗, 吴爱萍, 杜向军, 王大燕, 舒跃龙, 蒋太交, 2016 从蚊子到人类：寨卡病毒的遗传进化, 王璐兰, Stephanie G. Valderramos, 吴爱萍, 欧阳松英, 李春风, Patricia Brasil, Myrna Bonaldo, Thomas Coates, Karin Nielsen-Saines, 蒋太交, Saba Aliyari, 程根宏, 2016 功能基因组学揭示了对流感聚合酶至关重要的连接子, 王璐兰, 吴爱萍, 王耀, Natalie Quanquin, 李春风, 王景峰, 陈向文, 刘素阳, 刘平, 张红, 秦小峰, 蒋太交, 程根宏, 2016 人类流感A (H1N1)病毒的抗原模式和进化, 刘米, 赵翔, 华莎, 杜向军, 彭有松, 李希言, 兰宇, 王大燕, 吴爱萍, 舒跃龙, 蒋太交, 2015 埃博拉病毒基因组中的共突变网络预测疾病的致命性, 邓立宗, 刘米, 华莎, 彭有松, 吴爱萍, 秦小峰, 程根宏, 蒋太交, 2015 整合计算建模和功能测定以解码流感病毒PB1蛋白的结构功能关系, 李春风, 吴爱萍, 彭有松, 王景峰, 郭阳, 陈志高, 张红, 王永强, 董久红, 王璐兰, 秦小峰, 程根宏, 邓涛, 蒋太交, 2014 通过识别二级结构包装界面探索蛋白质结构域组织, 邓立宗, 吴爱萍, 戴文涛, 宋廷瑞, 崔亚, 蒋太交, 2014 连续重配导致中国多样的流感H7N9基因型, 吴爱萍, 苏春虎, 王大燕, 彭有松, 刘米, 华莎, 李天贤, 高福, 唐洪, 陈建柱, 刘秀凡, 舒跃龙, 彭大新, 蒋太交, 2013 从PB1 C端衍生的肽通过干扰病毒聚合酶组装抑制流感病毒复制, 李春风, 巴琦, 吴爱萍, 张红, 邓涛, 蒋太交, 2013 卷曲螺旋网络塑造细胞分子机器, 王永强, 张新磊, 张红, 陆毅, 黄浩龙, 董晓曦, 陈济南, 董久红, 杨晓, 杭海英, 蒋太交, 2012 中国H3N2流感抗原进化的映射揭示了疫苗株推荐的策略, 杜向军, 董立波, 兰宇, 彭有松, 吴爱萍, 张烨, 黄伟娟, 王大燕, 王敏, 郭元基, 舒跃龙, 蒋太交, 2012 RASP: 快速建模蛋白质侧链构象, 苗志超, 曹阳, 蒋太交, 2011 NCACO-score: 一种有效的主链依赖评分函数用于结构建模, 田丽清, 吴爱萍, 曹阳, 董晓曦, 胡云, 蒋太交, 2011 通过结合冲突检测引导的迭代搜索与旋转体松弛改进侧链建模, 曹阳, 宋林, 苗志超, 胡云, 田丽清, 蒋太交, 2011 合成电路、设备和模块, 张红, 蒋太交, 2010 流感病毒超额死亡率与抗原变异的相关性：应用于快速估算流感死亡负担, 吴爱萍, 彭有松, 杜向军, 舒跃龙, 蒋太交, 2010 计算指导的蛋白质筛选揭示了涉及囊泡运输的卷曲螺旋相互作用, 张红, 陈济南, 王永强, 彭林, 董晓曦, 陆毅, Amy E. Keating, 蒋太交, 2009 基因组共现网络捕捉人类流感A (H3N2)进化的特征, 杜向军, 王卓, 吴爱萍, 宋林, 曹阳, 杭海英, 蒋太交, 2008

Areas of Focus

开发新的计算生物学方法
复杂疾病的分子机制
疾病关键分子标志物的识别

Publications

中国的持续抗原多样化导致全球禽流感H5N1病毒的抗原复杂性, 彭有松, 李晓丹, 周红波, 吴爱萍, 董立波, 张烨, 高荣宝, 洪波, 杨磊, 王大燕, 林贤, 金美琳, 舒跃龙, 蒋太交, 2017
cooccurNet: 用于共现网络构建和分析的R包, 邹元强, 吴志强, 邓立宗, 吴爱萍, 吴凡, 李克利, 蒋太交, 彭有松, 2017
基于保守抗原结构预测流感A病毒抗原变体的通用计算模型, 彭有松, 王大燕, 王建宏, 李克利, 谭中阳, 舒跃龙, 蒋太交, 2017
通过双分子发光互补报告系统筛选针对流感病毒聚合酶复合物组装的新型小分子抑制剂, 李春风, 王子宁, 曹阳, 王璐兰, 解静云, 陈志高, 邓涛, 蒋太交, 程根宏, 秦小峰, 2017
PREDAC-H3: 基于血凝素序列的人流感A (H3N2)病毒抗原监测的用户友好平台, 彭有松, 杨磊, 李红磊, 邹元强, 邓立宗, 吴爱萍, 杜向军, 王大燕, 舒跃龙, 蒋太交, 2016
从蚊子到人类：寨卡病毒的遗传进化, 王璐兰, Stephanie G. Valderramos, 吴爱萍, 欧阳松英, 李春风, Patricia Brasil, Myrna Bonaldo, Thomas Coates, Karin Nielsen-Saines, 蒋太交, Saba Aliyari, 程根宏, 2016
功能基因组学揭示了对流感聚合酶至关重要的连接子, 王璐兰, 吴爱萍, 王耀, Natalie Quanquin, 李春风, 王景峰, 陈向文, 刘素阳, 刘平, 张红, 秦小峰, 蒋太交, 程根宏, 2016
人类流感A (H1N1)病毒的抗原模式和进化, 刘米, 赵翔, 华莎, 杜向军, 彭有松, 李希言, 兰宇, 王大燕, 吴爱萍, 舒跃龙, 蒋太交, 2015
埃博拉病毒基因组中的共突变网络预测疾病的致命性, 邓立宗, 刘米, 华莎, 彭有松, 吴爱萍, 秦小峰, 程根宏, 蒋太交, 2015
整合计算建模和功能测定以解码流感病毒PB1蛋白的结构功能关系, 李春风, 吴爱萍, 彭有松, 王景峰, 郭阳, 陈志高, 张红, 王永强, 董久红, 王璐兰, 秦小峰, 程根宏, 邓涛, 蒋太交, 2014
通过识别二级结构包装界面探索蛋白质结构域组织, 邓立宗, 吴爱萍, 戴文涛, 宋廷瑞, 崔亚, 蒋太交, 2014
连续重配导致中国多样的流感H7N9基因型, 吴爱萍, 苏春虎, 王大燕, 彭有松, 刘米, 华莎, 李天贤, 高福, 唐洪, 陈建柱, 刘秀凡, 舒跃龙, 彭大新, 蒋太交, 2013
从PB1 C端衍生的肽通过干扰病毒聚合酶组装抑制流感病毒复制, 李春风, 巴琦, 吴爱萍, 张红, 邓涛, 蒋太交, 2013
卷曲螺旋网络塑造细胞分子机器, 王永强, 张新磊, 张红, 陆毅, 黄浩龙, 董晓曦, 陈济南, 董久红, 杨晓, 杭海英, 蒋太交, 2012
中国H3N2流感抗原进化的映射揭示了疫苗株推荐的策略, 杜向军, 董立波, 兰宇, 彭有松, 吴爱萍, 张烨, 黄伟娟, 王大燕, 王敏, 郭元基, 舒跃龙, 蒋太交, 2012
RASP: 快速建模蛋白质侧链构象, 苗志超, 曹阳, 蒋太交, 2011
NCACO-score: 一种有效的主链依赖评分函数用于结构建模, 田丽清, 吴爱萍, 曹阳, 董晓曦, 胡云, 蒋太交, 2011
通过结合冲突检测引导的迭代搜索与旋转体松弛改进侧链建模, 曹阳, 宋林, 苗志超, 胡云, 田丽清, 蒋太交, 2011
合成电路、设备和模块, 张红, 蒋太交, 2010
流感病毒超额死亡率与抗原变异的相关性：应用于快速估算流感死亡负担, 吴爱萍, 彭有松, 杜向军, 舒跃龙, 蒋太交, 2010
计算指导的蛋白质筛选揭示了涉及囊泡运输的卷曲螺旋相互作用, 张红, 陈济南, 王永强, 彭林, 董晓曦, 陆毅, Amy E. Keating, 蒋太交, 2009
基因组共现网络捕捉人类流感A (H3N2)进化的特征, 杜向军, 王卓, 吴爱萍, 宋林, 曹阳, 杭海英, 蒋太交, 2008

蛋白质结构预测基因共进化分析生物医学数据挖掘生物分子网络建模高通量实验传染病分子机制系统生物学疾病分类早期诊断

魏国超 - 北京大学

丁世萍 - 浙江大学

王菲菲 - 复旦大学

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