Professor | 瞿昆 | 数字化转型顾问

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Name	瞿昆
Contact Information	qukun@ustc.edu.cn
Language ability	英语, 中文
Province	安徽

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Name

瞿昆

Contact Information

qukun@ustc.edu.cn

Language ability

英语, 中文

Province

安徽

University/Lab Affiliation and Title	中国科学技术大学
Faculty	Basic Medical Sciences
Academic Background & Achievements	2004-2010 物理化学博士学位：美国印第安纳大学 1999-2004 化学物理学士学位：中国科学技术大学 2016 国家创新人才青年基金 2021 国家杰出青年基金
Work Experience	2021.06-至今 - 中国科学技术大学 - 港澳台办公室主任 2020.08-至今 - 中国科学技术大学 - 国际合作与交流部部长 2019.07-2020.07 - 中国科学技术大学 - 国际合作与交流部副部长 2018.12-至今 - 中国科学技术大学附属第一医院 - 教授，博士生导师 2018.03-至今 - 中国科学技术大学大数据学院 - 教授，博士生导师 2016.06-至今 - 中国科学技术大学生命科学与医学部 - 教授，博士生导师 2010-2016 - 美国斯坦福大学医学院 - 生物信息研究员、高级研究员、中心主任 2009-2010 - 美国希望之城，贝克曼癌症研究中心 - 生物信息学专家
Awards	2020: 中科院人才计划终期评估优秀 2020: 生命学院学术职业发展奖 2017: 中科院分子细胞科学卓越创新中心 2017: 生命学院学术成果奖 2017: 生命学院杰出论文研究奖 2016: 海外高层次人才引进青年项目 2007: ORISE Fellowship

University/Lab Affiliation and Title

中国科学技术大学

Faculty

Basic Medical Sciences

Academic Background & Achievements

2004-2010 物理化学博士学位：美国印第安纳大学
1999-2004 化学物理学士学位：中国科学技术大学
2016 国家创新人才青年基金
2021 国家杰出青年基金

Work Experience

2021.06-至今 - 中国科学技术大学 - 港澳台办公室主任
2020.08-至今 - 中国科学技术大学 - 国际合作与交流部部长
2019.07-2020.07 - 中国科学技术大学 - 国际合作与交流部副部长
2018.12-至今 - 中国科学技术大学附属第一医院 - 教授，博士生导师
2018.03-至今 - 中国科学技术大学大数据学院 - 教授，博士生导师
2016.06-至今 - 中国科学技术大学生命科学与医学部 - 教授，博士生导师
2010-2016 - 美国斯坦福大学医学院 - 生物信息研究员、高级研究员、中心主任
2009-2010 - 美国希望之城，贝克曼癌症研究中心 - 生物信息学专家

Awards

2020: 中科院人才计划终期评估优秀
2020: 生命学院学术职业发展奖
2017: 中科院分子细胞科学卓越创新中心
2017: 生命学院学术成果奖
2017: 生命学院杰出论文研究奖
2016: 海外高层次人才引进青年项目
2007: ORISE Fellowship

Areas of Focus	单细胞和空间组学测序技术与算法开发应用大数据与人工智能算法研究癌症和自身免疫疾病研究染色体外环状DNA对肿瘤发生发展的促进机制
Publications	检测染色体外环状DNA的方法比较分析, Xuyuan Gao, Ke Liu, Songwen Luo, et al, Chuang Guo#, Kun Qu#, 2024 单细胞多组学预测和整合算法的基准测试, Yinlei Hu, Siyuan Wan, Yuanhanyu Luo, et al, Falai Chen#, Bin Li#, Kun Qu#, 2024 SPACEL: 基于深度学习的空间转录组结构特征化, Hao Xu, Shuyan Wang, et al, Bin Li#, Jun Lin#, Kun Qu#, 2023 单细胞分辨率下有丝分裂染色质可及性书签的动态和调控, Qiaoni Yu, Xu Liu, Jingwen Fang, Huihui Wu, et al, Zhikai Wang#, Kun Qu#, 2023 空间和单细胞转录组整合方法的基准测试用于转录分布预测和细胞类型解卷积, Bin Li, Wen Zhang, Chuang Guo, et al, Kun Qu#, 2022 COVID-19、败血症和HIV感染的单细胞分析揭示了单核细胞中的高炎症和免疫抑制特征, Nianping Liu, Chen Jiang, Pengfei Cai, et al, Chuang Guo#, Kun Qu#, 2021 COVID-19免疫特征通过大规模单细胞转录组图谱揭示, Xianwen Ren, Wen Wen, Xiaoying Fan, Wenhong Hou, Bin Su, Pengfei Cai, Jiesheng Li, Yang Liu, Fei Tang, Fan Zhang, Yu Yang, Jiangping He, Wenji Ma, Jingjing He, Pingping Wang, et al, Peipei Zhang, et al, Penghui Zhou#, Qinghua Jiang#, Zhiwei Huang#, Jin-Xin Bei#, Lai Wei#, Xiu-Wu Bian#, Xindong Liu#, Tao Cheng#, Xiangpan Li#, Pingsen Zhao#, Fu-Sheng Wang#, Hongyang Wang#, Bing Su#, Zheng Zhang#, Kun Qu#, Xiaoqun Wang#, Jiekai Chen#, Ronghua Jin#, Zemin Zhang#, 2021 系统性硬化症皮肤细胞的染色质可及性景观提名树突状细胞在疾病发病机制中的作用, Qian Liu, Lisa C. Zaba, et al, Kun Qu# & Howard Y. Chang#, 2020 两名重症COVID-19患者的单细胞分析揭示了单核细胞相关和托珠单抗响应的细胞因子风暴, Chuang Guo, Bin Li, et al, Tengchuan Jin#, Jun Lin# & Kun Qu#, 2020 染色质可及性分析揭示了人类视网膜和hiPSC衍生视网膜类器官发育的调控动态, Haohuan Xie, Wen Zhang, Mei Zhang#, et al, Kun Qu# & Tian Xue#, 2020 皮肤T细胞淋巴瘤的染色质可及性景观和对HDAC抑制剂的动态反应, Kun Qu, Lisa C. Zaba, et al, Youn H. Kim# and Howard Y. Chang#, 2017 通过GenomeSpace中生物信息学工具的互操作进行综合基因组分析, Kun Qu, Sara Garamszegi, Felix Wu, et al Jill P Mesirov#, 2016 初级人类T细胞中个人调控组的个体性和变异, Kun Qu, Lisa C. Zaba, Paul G. Giresi, et al Howard Y. Chang#, 2015 人类转录组中RNA二级结构的景观和变异, Yue Wan#, Kun Qu, et al Howard Y. Chang#, 2014

Areas of Focus

单细胞和空间组学测序技术与算法开发
应用大数据与人工智能算法研究癌症和自身免疫疾病
研究染色体外环状DNA对肿瘤发生发展的促进机制

Publications

检测染色体外环状DNA的方法比较分析, Xuyuan Gao*, Ke Liu*, Songwen Luo*, et al, Chuang Guo#, Kun Qu#, 2024
单细胞多组学预测和整合算法的基准测试, Yinlei Hu*, Siyuan Wan*, Yuanhanyu Luo*, et al, Falai Chen#, Bin Li#, Kun Qu#, 2024
SPACEL: 基于深度学习的空间转录组结构特征化, Hao Xu*, Shuyan Wang*, et al, Bin Li#, Jun Lin#, Kun Qu#, 2023
单细胞分辨率下有丝分裂染色质可及性书签的动态和调控, Qiaoni Yu*, Xu Liu*, Jingwen Fang*, Huihui Wu*, et al, Zhikai Wang#, Kun Qu#, 2023
空间和单细胞转录组整合方法的基准测试用于转录分布预测和细胞类型解卷积, Bin Li*, Wen Zhang*, Chuang Guo*, et al, Kun Qu#, 2022
COVID-19、败血症和HIV感染的单细胞分析揭示了单核细胞中的高炎症和免疫抑制特征, Nianping Liu*, Chen Jiang*, Pengfei Cai*, et al, Chuang Guo#, Kun Qu#, 2021
COVID-19免疫特征通过大规模单细胞转录组图谱揭示, Xianwen Ren*, Wen Wen*, Xiaoying Fan*, Wenhong Hou*, Bin Su*, Pengfei Cai*, Jiesheng Li*, Yang Liu*, Fei Tang*, Fan Zhang*, Yu Yang*, Jiangping He*, Wenji Ma*, Jingjing He*, Pingping Wang*, et al, Peipei Zhang*, et al, Penghui Zhou#, Qinghua Jiang#, Zhiwei Huang#, Jin-Xin Bei#, Lai Wei#, Xiu-Wu Bian#, Xindong Liu#, Tao Cheng#, Xiangpan Li#, Pingsen Zhao#, Fu-Sheng Wang#, Hongyang Wang#, Bing Su#, Zheng Zhang#, Kun Qu#, Xiaoqun Wang#, Jiekai Chen#, Ronghua Jin#, Zemin Zhang#, 2021
系统性硬化症皮肤细胞的染色质可及性景观提名树突状细胞在疾病发病机制中的作用, Qian Liu*, Lisa C. Zaba*, et al, Kun Qu# & Howard Y. Chang#, 2020
两名重症COVID-19患者的单细胞分析揭示了单核细胞相关和托珠单抗响应的细胞因子风暴, Chuang Guo*, Bin Li*, et al, Tengchuan Jin#, Jun Lin# & Kun Qu#, 2020
染色质可及性分析揭示了人类视网膜和hiPSC衍生视网膜类器官发育的调控动态, Haohuan Xie*, Wen Zhang*, Mei Zhang*#, et al, Kun Qu# & Tian Xue#, 2020
皮肤T细胞淋巴瘤的染色质可及性景观和对HDAC抑制剂的动态反应, Kun Qu*, Lisa C. Zaba*, et al, Youn H. Kim# and Howard Y. Chang#, 2017
通过GenomeSpace中生物信息学工具的互操作进行综合基因组分析, Kun Qu*, Sara Garamszegi*, Felix Wu*, et al Jill P Mesirov#, 2016
初级人类T细胞中个人调控组的个体性和变异, Kun Qu*, Lisa C. Zaba*, Paul G. Giresi, et al Howard Y. Chang#, 2015
人类转录组中RNA二级结构的景观和变异, Yue Wan*#, Kun Qu*, et al Howard Y. Chang#, 2014

单细胞测序空间组学算法开发大数据人工智能癌症研究自身免疫疾病染色体外Dna 肿瘤发生生物信息学

黄忠朝 - 中南大学

徐洁杰 - 复旦大学

Area of Focus
临床 | 计算 | 肿瘤学 | 大数据 | 人工智能 | 肿瘤 | 免疫治疗 | 反应性 | 新靶点 | 研究

林明焰 - 南京医科大学

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