Professor | 周源 | 数字化转型顾问

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Name	周源
Contact Information	zhouyuanbioinfo@hsc.pku.edu.cn
Language ability	中文, 英语
Province	北京

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Name

周源

Contact Information

zhouyuanbioinfo@hsc.pku.edu.cn

Language ability

中文, 英语

Province

北京

University/Lab Affiliation and Title	北京大学
Faculty	Basic Medical Sciences
Academic Background & Achievements	2006-2010 生物科学理学学士：首都师范大学 2010-2015 生物信息学理学博士：中国农业大学开发多个生物信息学工具并建立有影响力的数据库
Work Experience	2015-07 - 2017-09 北京大学医学部基础医学院医学信息学系博士后 2017-09 - 至今北京大学医学部基础医学院医学生物信息学系历任副研究员、研究员
Awards	2023-2025: 国家自然科学基金优秀青年项目

University/Lab Affiliation and Title

北京大学

Faculty

Basic Medical Sciences

Academic Background & Achievements

Work Experience

Awards

Areas of Focus	RNA调控生物信息学
Publications	SRAMP：基于序列特征的哺乳动物N6-甲基腺苷(m6A)位点预测, 周源, 潘增, 李彦辉, 张自定, 崔庆华, 2016 TransmiR v2.0：更新的转录因子-微RNA调控数据库, 童湛, 崔庆华, 王娟, 周源, 2019 HMDD v3.0：实验支持的人类微RNA疾病关联数据库, 黄周, 石江城, 高远旭, 崔春梅, 张珊, 李建伟, 周源, 崔庆华, 2019 NAT10介导的N4-乙酰胞苷mRNA修饰调控人类胚胎干细胞自我更新, 刘如聪, 吴布力卡斯木·自巴古丽, 蔡润泽, 孟凡义, 崔庆华, 周源, 李阳, 2023 GE-Impute：基于图嵌入的单细胞RNA-seq数据插补, 吴小斌, 周源, 2022 AbAgIntPre：基于序列信息预测抗体-抗原相互作用的深度学习方法, 黄岩, 张自定, 周源, 2022 SGPPI：在严格条件下使用图卷积网络预测蛋白质-蛋白质相互作用的结构感知方法, 黄岩, Stefan Wuchty, 周源, 张自定, 2023 种系基因组模式与癌症风险、致癌途径和临床结果相关, 徐雪, 周源, 冯晓文, 李雄, Mohammad Asad, Derek Li, 廖波, 李建强, 崔庆华, Edwin Wang, 2020 预测微RNA疾病关联的计算方法基准测试, 黄周, 刘雷波, 石江城, 崔庆华, 李建伟, 周源, 2019 TAM 2.0：微RNA组分析工具, 李建伟, 韩晓芬, 万艳萍, 张珊, 赵迎树, 范瑞, 崔庆华, 周源, 2018

Areas of Focus

RNA调控生物信息学

Publications

SRAMP：基于序列特征的哺乳动物N6-甲基腺苷(m6A)位点预测, 周源, 潘增, 李彦辉, 张自定, 崔庆华, 2016
TransmiR v2.0：更新的转录因子-微RNA调控数据库, 童湛, 崔庆华, 王娟, 周源, 2019
HMDD v3.0：实验支持的人类微RNA疾病关联数据库, 黄周, 石江城, 高远旭, 崔春梅, 张珊, 李建伟, 周源, 崔庆华, 2019
NAT10介导的N4-乙酰胞苷mRNA修饰调控人类胚胎干细胞自我更新, 刘如聪, 吴布力卡斯木·自巴古丽, 蔡润泽, 孟凡义, 崔庆华, 周源, 李阳, 2023
GE-Impute：基于图嵌入的单细胞RNA-seq数据插补, 吴小斌, 周源, 2022
AbAgIntPre：基于序列信息预测抗体-抗原相互作用的深度学习方法, 黄岩, 张自定, 周源, 2022
SGPPI：在严格条件下使用图卷积网络预测蛋白质-蛋白质相互作用的结构感知方法, 黄岩, Stefan Wuchty, 周源, 张自定, 2023
种系基因组模式与癌症风险、致癌途径和临床结果相关, 徐雪, 周源, 冯晓文, 李雄, Mohammad Asad, Derek Li, 廖波, 李建强, 崔庆华, Edwin Wang, 2020
预测微RNA疾病关联的计算方法基准测试, 黄周, 刘雷波, 石江城, 崔庆华, 李建伟, 周源, 2019
TAM 2.0：微RNA组分析工具, 李建伟, 韩晓芬, 万艳萍, 张珊, 赵迎树, 范瑞, 崔庆华, 周源, 2018

Rna 生物信息学调控数据库工具开发 Mirna 生物医学基因组学甲基化转录

崔庆华 - 北京大学

孙浪 - 中南大学

Area of Focus
食源性 | 致病菌 | 基因组学 | 分子 | 生物学 | 研究 | 食品安全 | 微生物学 | Dna | Rna

潘冬立 - 浙江大学

Area of Focus
细菌 | 病毒 | 细胞培养 | 遗传学 | Dna | Rna | 蛋白质 | 酶 | 基因表达 | 生物信息学

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