Professor | 陈海峰 | 数字化转型顾问

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Name	陈海峰
Contact Information	haifengchen@sjtu.edu.cn
Language ability	英语, 中文, 法语
Province	上海

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Name

陈海峰

Contact Information

haifengchen@sjtu.edu.cn

Language ability

英语, 中文, 法语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	上海交通大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	本科学位：西安交通大学硕士学位：四川大学博士学位：法国巴黎第七大学博士后研究：加州大学尔湾分校发表超过160篇SCI论文
Work Experience	2013–至今: 副主编, Chemical Biology & Drug Design 2015–至今: 副主编, Frontiers in Molecular Biosciences 2022–至今: 编委, Journal of Chemical Information and Modeling 2022–至今: 编委, International Journal of Molecular Sciences 2023–至今: 委员, 生物信息学会生物分子结构预测与模拟专委会 2024–至今: 理事, 上海市生物信息学会
Awards	2003年: 上海市科学技术进步一等奖 2019年: 上海交通大学教学成果一等奖 2020年: 上海交通大学教书育人三等奖 2022年: 全国大学生生命科学创新创业大赛指导教师一等奖 2023年: 全国大学生生命科学创新创业大赛指导教师一等奖 2023年: 上海市挑战杯指导教师一等奖 2015年, 2022年, 2023年, 2024年: 上海交通大学优异学士学位论文指导老师

University/Lab Affiliation and Title

上海交通大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

本科学位：西安交通大学
硕士学位：四川大学
博士学位：法国巴黎第七大学
博士后研究：加州大学尔湾分校
发表超过160篇SCI论文

Work Experience

2013–至今: 副主编, Chemical Biology & Drug Design
2015–至今: 副主编, Frontiers in Molecular Biosciences
2022–至今: 编委, Journal of Chemical Information and Modeling
2022–至今: 编委, International Journal of Molecular Sciences
2023–至今: 委员, 生物信息学会生物分子结构预测与模拟专委会
2024–至今: 理事, 上海市生物信息学会

Awards

2003年: 上海市科学技术进步一等奖
2019年: 上海交通大学教学成果一等奖
2020年: 上海交通大学教书育人三等奖
2022年: 全国大学生生命科学创新创业大赛指导教师一等奖
2023年: 全国大学生生命科学创新创业大赛指导教师一等奖
2023年: 上海市挑战杯指导教师一等奖
2015年, 2022年, 2023年, 2024年: 上海交通大学优异学士学位论文指导老师

Areas of Focus	天然无规蛋白的精准分子力场基于人工智能的全新蛋白质设计计算机辅助创新药物发现
Publications	Dynamical Important Residue Network (DIRN): Network Inference via Conformational Change, Q. Li, R. Luo, H.F. Chen, 2019 Well-balanced Force Field ff03CMAP for Folded and Disordered Proteins, Y. Zhang, H. Liu, S. Yang, R. Luo, H.F. Chen, 2019 The IDP-Specific Force Field ff14IDPSFF Improves the Conformer Sampling of Intrinsically Disordered Proteins, D. Song, R. Luo, H.F. Chen, 2017 ASD: a comprehensive database of allosteric proteins and modulators, Z. Huang, L. Zhu, Y. Cao, G. Wu, X. Liu, Y. Chen, Q. Wang, T. Shi, Y. Zhao, Y. Wang, W. Li, Y. Li, H.F. Chen, G. Chen, J. Zhang, 2011 Rig-I regulates NF-κB activity through binding to Nf-κb13′-UTR mRNA, H. Zhang, Z. Liu, Y. Sun, J. Zhu, S. Lu, X. Liu, Q. Huang,Y. Xie, H. Zhu, S. Dang, H.F. Chen, G. Zheng, Y. Li, Y. Kuang, J. Fei, S. Chen, Z. Chen, Z.G. Wang, 2013 Binding induced folding in p53-MDM2 complex, H.F. Chen, R. Luo, 2007 PTMint Database of Experimentally Verified PTM Regulation on Protein-Protein Interaction, X. Hong, N. Li, J. Lv, Y. Zhang, J. Li, J. Zhang, H.F. Chen, 2023 Phanto-IDP: Compact Model for Precise Intrinsically Disordered Protein Backbone Generation and Enhanced Sampling, J.J. Zhu, Z. Li, H. Tong, Z. Lu, N. Zhang, T. Wei, H.F. Chen, 2024 Balanced Three-point Water Model OPC3-B for Intrinsically Disordered and Ordered Proteins, Z. Pan, J. Mu, H.F. Chen, 2023 Graphormer Supervised De Novo Protein Design Method and Function Validation, J. Mu, Z. Li, B. Zhang, Q. Zhang, J. Iqbal, A. Wadood, T. Wei, Y. Feng, H.F. Chen, 2024

Areas of Focus

天然无规蛋白的精准分子力场
基于人工智能的全新蛋白质设计
计算机辅助创新药物发现

Publications

Dynamical Important Residue Network (DIRN): Network Inference via Conformational Change, Q. Li, R. Luo*, H.F. Chen*, 2019
Well-balanced Force Field ff03CMAP for Folded and Disordered Proteins, Y. Zhang, H. Liu, S. Yang, R. Luo*, H.F. Chen*, 2019
The IDP-Specific Force Field ff14IDPSFF Improves the Conformer Sampling of Intrinsically Disordered Proteins, D. Song, R. Luo, H.F. Chen*, 2017
ASD: a comprehensive database of allosteric proteins and modulators, Z. Huang, L. Zhu, Y. Cao, G. Wu, X. Liu, Y. Chen, Q. Wang, T. Shi, Y. Zhao, Y. Wang, W. Li, Y. Li, H.F. Chen*, G. Chen, J. Zhang*, 2011
Rig-I regulates NF-κB activity through binding to Nf-κb13′-UTR mRNA, H. Zhang, Z. Liu, Y. Sun, J. Zhu, S. Lu, X. Liu, Q. Huang,Y. Xie, H. Zhu, S. Dang, H.F. Chen, G. Zheng, Y. Li, Y. Kuang, J. Fei, S. Chen, Z. Chen, Z.G. Wang*, 2013
Binding induced folding in p53-MDM2 complex, H.F. Chen, R. Luo*, 2007
PTMint Database of Experimentally Verified PTM Regulation on Protein-Protein Interaction, X. Hong, N. Li, J. Lv, Y. Zhang, J. Li*, J. Zhang*, H.F. Chen*, 2023
Phanto-IDP: Compact Model for Precise Intrinsically Disordered Protein Backbone Generation and Enhanced Sampling, J.J. Zhu, Z. Li, H. Tong, Z. Lu, N. Zhang, T. Wei*, H.F. Chen*, 2024
Balanced Three-point Water Model OPC3-B for Intrinsically Disordered and Ordered Proteins, Z. Pan, J. Mu, H.F. Chen*, 2023
Graphormer Supervised De Novo Protein Design Method and Function Validation, J. Mu, Z. Li, B. Zhang, Q. Zhang, J. Iqbal, A. Wadood, T. Wei*, Y. Feng*, H.F. Chen*, 2024

分子动力学力场无规蛋白蛋白结构高性能计算模拟生物信息学药物设计人工智能疾病研究

刘琦 - 同济大学

啜国晖 - 同济大学

王晓雷 - 上海交通大学

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模拟 | 生物分子 | 蛋白质 | 分子相互作用 | 计算 | 酶 | 催化 | 生化 | 机制 | 人工智能 | 基因组学 | 大数据 | 结构生物学

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