Professor | 孙晓庆 | 数字化转型顾问

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Name	孙晓庆
Language ability	中文, 英语, 德语
Province	上海

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Name

孙晓庆

Language ability

中文, 英语, 德语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	复旦大学
Faculty	Basic Medical Sciences
Academic Background & Achievements	2005.09-2009.07 本科学位: 扬州大学 2009.09-2012.07 硕士学位: 中国农业科学院
Work Experience	2020.10-至今 - 复旦大学 - 病原诊断高通量测序中心实验师 2014.10-2019.05 - 美国圣路易斯华盛顿大学医学院 - 基因科技与生物信息合成中心科研助理 2012.08-2012.05 - 德国勃林格殷格翰（亚洲）动物研发中心 - 项目科学家
Awards	最佳员工 (2012): 德国勃林格殷格翰（亚洲）动物研发中心

University/Lab Affiliation and Title

复旦大学

Faculty

Basic Medical Sciences

Academic Background & Achievements

2005.09-2009.07 本科学位: 扬州大学
2009.09-2012.07 硕士学位: 中国农业科学院

Work Experience

2020.10-至今 - 复旦大学 - 病原诊断高通量测序中心实验师
2014.10-2019.05 - 美国圣路易斯华盛顿大学医学院 - 基因科技与生物信息合成中心科研助理
2012.08-2012.05 - 德国勃林格殷格翰（亚洲）动物研发中心 - 项目科学家

Awards

最佳员工 (2012): 德国勃林格殷格翰（亚洲）动物研发中心

Areas of Focus	基于二代和三代高通量测序技术平台鉴别诊断临床复杂感染性样品及数据分析
Publications	黑猩猩、大猩猩和人类的微生物组和抗性基因组在宿主生活方式和地理上的差异, Campbell TP, Sun X, Patel VH, Sanz C, Morgan D, Dantas D, 2020 婴儿肠道微生物组和抗性基因组中早期住院和抗生素治疗的持久宏基因组特征, Gasparrini AJ, Wang B, Sun X, Kennedy EA, Hernandez-Leyva A, Ndao IM, Tarr PI, Warner BB & Dantas G, 2019 复方磺胺甲恶唑预防增加了HIV暴露未感染婴儿肠道微生物组中抗性基因的普遍性和α多样性，但减少了β多样性, D'Souza AW, Moodley-Govender E, Berla B, Kelkar T, Wang B, Sun X, Daniels B, Coutsoudis A, Trehan I, Dantas G, 2019 重症监护病房表面多重耐药细菌的时空动态, D'Souza AW, Potter RF, Wallace M, Shupe A, Patel S, Sun X, Gul D, Kwon JH, Andleeb S, Burnham CD, Dantas G, 2019 候选益生菌E. coli Nissle在哺乳动物肠道中的适应策略, Crook N, Ferreiro A, Gasparrini AJ, Pesesky MW, Gibson MK, Wang B, Sun X, Condiotte Z, Dobrowolski S, Peterson D, Dantas G, 2019 阿莫西林-克拉维酸钾后自体粪便微生物移植对粪便微生物组结构和代谢潜力的影响, Bulow C, Langdon A, Hink T, Wallace M, Reske KA, Patel S, Sun X, Seiler S, Jones S, Kwon JH, Burnham CA, Dantas G, Dubberke ER, 2018 体内诱导的精氨基琥珀酸裂解酶在布鲁氏菌RAW264.7细胞复制中的作用, Han X, Sun X, Shan X, Zhang M, Song J, Tian M, Wang S, Tong Y, Ding C, Yu S, 2014 布鲁氏菌苹果酸脱氢酶的酶活性分析和催化必需残基鉴定, Han X, Tong Y, Tian M, Sun X, Wang S, Ding C, Yu S, 2014 布鲁氏菌苹果酸脱氢酶的免疫原性和致病性特征, Han X, Tong Y, Tian M, Sun X, Wang S, Ding C, Yu S, 2014 布鲁氏菌2308株中ABC转运蛋白ATP酶基因的失活减弱了细菌的毒力, Zhang M, Han X, Liu H, Tian M, Ding C, Song J, Sun X, Liu Z, Yu S, 2013

Areas of Focus

基于二代和三代高通量测序技术平台鉴别诊断临床复杂感染性样品及数据分析

Publications

黑猩猩、大猩猩和人类的微生物组和抗性基因组在宿主生活方式和地理上的差异, Campbell TP, Sun X, Patel VH, Sanz C, Morgan D, Dantas D, 2020
婴儿肠道微生物组和抗性基因组中早期住院和抗生素治疗的持久宏基因组特征, Gasparrini AJ, Wang B, Sun X, Kennedy EA, Hernandez-Leyva A, Ndao IM, Tarr PI, Warner BB & Dantas G, 2019
复方磺胺甲恶唑预防增加了HIV暴露未感染婴儿肠道微生物组中抗性基因的普遍性和α多样性，但减少了β多样性, D'Souza AW, Moodley-Govender E, Berla B, Kelkar T, Wang B, Sun X, Daniels B, Coutsoudis A, Trehan I, Dantas G, 2019
重症监护病房表面多重耐药细菌的时空动态, D'Souza AW, Potter RF, Wallace M, Shupe A, Patel S, Sun X, Gul D, Kwon JH, Andleeb S, Burnham CD, Dantas G, 2019
候选益生菌E. coli Nissle在哺乳动物肠道中的适应策略, Crook N, Ferreiro A, Gasparrini AJ, Pesesky MW, Gibson MK, Wang B, Sun X, Condiotte Z, Dobrowolski S, Peterson D, Dantas G, 2019
阿莫西林-克拉维酸钾后自体粪便微生物移植对粪便微生物组结构和代谢潜力的影响, Bulow C, Langdon A, Hink T, Wallace M, Reske KA, Patel S, Sun X, Seiler S, Jones S, Kwon JH, Burnham CA, Dantas G, Dubberke ER, 2018
体内诱导的精氨基琥珀酸裂解酶在布鲁氏菌RAW264.7细胞复制中的作用, Han X, Sun X, Shan X, Zhang M, Song J, Tian M, Wang S, Tong Y, Ding C, Yu S, 2014
布鲁氏菌苹果酸脱氢酶的酶活性分析和催化必需残基鉴定, Han X, Tong Y, Tian M, Sun X, Wang S, Ding C, Yu S, 2014
布鲁氏菌苹果酸脱氢酶的免疫原性和致病性特征, Han X, Tong Y, Tian M, Sun X, Wang S, Ding C, Yu S, 2014
布鲁氏菌2308株中ABC转运蛋白ATP酶基因的失活减弱了细菌的毒力, Zhang M, Han X, Liu H, Tian M, Ding C, Song J, Sun X, Liu Z, Yu S, 2013

高通量测序二代测序三代测序临床样品传染病数据分析病原诊断基因组学生物信息学微生物组

丁世萍 - 浙江大学

牛学锋 - 广州医科大学

Area of Focus
抗体 | 传染病 | 免疫学 | Sars-Cov-2 | 疫苗 | 免疫反应 | 高通量测序 | B细胞 | T细胞 | 生物信息学

周源 - 北京大学

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