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孙晓庆
Basic Medical Sciences
复旦大学
上海
Language: 中文, 英语, 德语
高通量测序
二代测序
三代测序
临床样品
传染病
数据分析
病原诊断
基因组学
生物信息学
微生物组
Areas of Focus
- 基于二代和三代高通量测序技术平台鉴别诊断临床复杂感染性样品及数据分析
Work Experience
- 2020.10-至今 - 复旦大学 - 病原诊断高通量测序中心实验师
- 2014.10-2019.05 - 美国圣路易斯华盛顿大学医学院 - 基因科技与生物信息合成中心科研助理
- 2012.08-2012.05 - 德国勃林格殷格翰（亚洲）动物研发中心 - 项目科学家
Academic Background & Achievements
- 2005.09-2009.07 本科学位: 扬州大学
- 2009.09-2012.07 硕士学位: 中国农业科学院
Publications
- 黑猩猩、大猩猩和人类的微生物组和抗性基因组在宿主生活方式和地理上的差异, Campbell TP, Sun X, Patel VH, Sanz C, Morgan D, Dantas D, 2020
- 婴儿肠道微生物组和抗性基因组中早期住院和抗生素治疗的持久宏基因组特征, Gasparrini AJ, Wang B, Sun X, Kennedy EA, Hernandez-Leyva A, Ndao IM, Tarr PI, Warner BB & Dantas G, 2019
- 复方磺胺甲恶唑预防增加了HIV暴露未感染婴儿肠道微生物组中抗性基因的普遍性和α多样性，但减少了β多样性, D'Souza AW, Moodley-Govender E, Berla B, Kelkar T, Wang B, Sun X, Daniels B, Coutsoudis A, Trehan I, Dantas G, 2019
- 重症监护病房表面多重耐药细菌的时空动态, D'Souza AW, Potter RF, Wallace M, Shupe A, Patel S, Sun X, Gul D, Kwon JH, Andleeb S, Burnham CD, Dantas G, 2019
- 候选益生菌E. coli Nissle在哺乳动物肠道中的适应策略, Crook N, Ferreiro A, Gasparrini AJ, Pesesky MW, Gibson MK, Wang B, Sun X, Condiotte Z, Dobrowolski S, Peterson D, Dantas G, 2019
- 阿莫西林-克拉维酸钾后自体粪便微生物移植对粪便微生物组结构和代谢潜力的影响, Bulow C, Langdon A, Hink T, Wallace M, Reske KA, Patel S, Sun X, Seiler S, Jones S, Kwon JH, Burnham CA, Dantas G, Dubberke ER, 2018
- 体内诱导的精氨基琥珀酸裂解酶在布鲁氏菌RAW264.7细胞复制中的作用, Han X, Sun X, Shan X, Zhang M, Song J, Tian M, Wang S, Tong Y, Ding C, Yu S, 2014
- 布鲁氏菌苹果酸脱氢酶的酶活性分析和催化必需残基鉴定, Han X, Tong Y, Tian M, Sun X, Wang S, Ding C, Yu S, 2014
- 布鲁氏菌苹果酸脱氢酶的免疫原性和致病性特征, Han X, Tong Y, Tian M, Sun X, Wang S, Ding C, Yu S, 2014
- 布鲁氏菌2308株中ABC转运蛋白ATP酶基因的失活减弱了细菌的毒力, Zhang M, Han X, Liu H, Tian M, Ding C, Song J, Sun X, Liu Z, Yu S, 2013
Awards
- 最佳员工 (2012): 德国勃林格殷格翰（亚洲）动物研发中心
