Professor | 张竹青 | 数字化转型顾问

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Name	张竹青
Contact Information	zhuqingzhang@ucas.ac.cn
Language ability	中文, 英语
Province	北京

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Name

张竹青

Contact Information

zhuqingzhang@ucas.ac.cn

Language ability

中文, 英语

Province

北京

University/Lab Affiliation and Title	中国科学院大学
Faculty	Life Sciences
Work Experience	2005-2007 - 北京大学，化学与分子工程学院，理论生物中心 - 博士后 2008-2011 - 多伦多大学，医学院生物化学系 - 博士后 2011.6-现在 - 中国科学院大学，生命科学学院 - 副教授、教授

University/Lab Affiliation and Title

中国科学院大学

Faculty

Life Sciences

Work Experience

2005-2007 - 北京大学，化学与分子工程学院，理论生物中心 - 博士后
2008-2011 - 多伦多大学，医学院生物化学系 - 博士后
2011.6-现在 - 中国科学院大学，生命科学学院 - 副教授、教授

Areas of Focus	生物大分子构象变化相关的模拟及计算工作蛋白质折叠和别构机制固有无序蛋白质的结构特征和功能关系蛋白质体系相分离的机制
Publications	基于序列的相分离蛋白预测器的评估, 廖少锋, 张玉军, 齐一飞, 张竹青, 2023 使用机器学习预测液-液相分离蛋白, 楚晓泉†, 孙坦林†, 李倩, 徐友军, 张竹青, 赖陆华, 裴建峰, 2022 LLPSDB v2.0: 体外液-液相分离蛋白的更新数据库, 王曦†, 周翔†, 闫庆林†, 廖少锋, 唐文钦, 徐培宇, 高阳振宇, 李倩, 窦志辉, 杨伟山, 黄北方, 李金红, 张竹青, 2022 LLPSDB: 体外液-液相分离蛋白数据库, 李倩†, 彭晓军†, 李元庆, 唐文钦, 朱家安, 黄静, 齐一飞, 张竹青, 2020 钙离子结合如何诱导钙调蛋白N端结构域的构象转变-原子水平表征, 赵立坤, 赖陆华, 张竹青, 2019 通过不同力场的分子动力学模拟表征p53 TAD2的结构集合, 欧阳艳华, 赵立坤, 张竹青, 2018 粗粒度结构基础方法和蛋白质折叠的原子模型的关键比较, 胡杰, 陈涛, 王默耶, 陈晖, 张竹青, 2017 异质本地接触能量和多体相互作用对蛋白质折叠机制预测的影响, 张竹青, 欧阳艳华, 陈涛, 2016 蛋白质折叠的过渡路径、扩散过程和预平衡, 张竹青, 陈晖, 2012 本地-非本地耦合和非本地相互作用: 从粗粒度模型中提取的蛋白质折叠原理, 陈晖, 张竹青, 斯特凡·沃林, 刘志荣, 2011 天然拓扑结构和非天然相互作用在天然和设计蛋白质的简单和复杂折叠动力学中的竞争, 张竹青, 陈晖, 2010 基于结构和残基统计势的淀粉样纤维形成片段的识别, 张竹青, 陈浩, 赖陆华, 2007 酵母朊病毒Sup35的GNNQQNY肽的寡聚体形成过程的分子动力学模拟, 张竹青, 陈浩, 白宏军, 赖陆华, 2007

Areas of Focus

生物大分子构象变化相关的模拟及计算工作
蛋白质折叠和别构机制
固有无序蛋白质的结构特征和功能关系
蛋白质体系相分离的机制

Publications

基于序列的相分离蛋白预测器的评估, 廖少锋, 张玉军, 齐一飞*, 张竹青*, 2023
使用机器学习预测液-液相分离蛋白, 楚晓泉†, 孙坦林†, 李倩, 徐友军, 张竹青*, 赖陆华*, 裴建峰*, 2022
LLPSDB v2.0: 体外液-液相分离蛋白的更新数据库, 王曦†, 周翔†, 闫庆林†, 廖少锋, 唐文钦, 徐培宇, 高阳振宇, 李倩, 窦志辉, 杨伟山, 黄北方, 李金红, 张竹青*, 2022
LLPSDB: 体外液-液相分离蛋白数据库, 李倩†, 彭晓军†, 李元庆, 唐文钦, 朱家安, 黄静, 齐一飞, 张竹青*, 2020
钙离子结合如何诱导钙调蛋白N端结构域的构象转变-原子水平表征, 赵立坤, 赖陆华*, 张竹青*, 2019
通过不同力场的分子动力学模拟表征p53 TAD2的结构集合, 欧阳艳华, 赵立坤, 张竹青*, 2018
粗粒度结构基础方法和蛋白质折叠的原子模型的关键比较, 胡杰, 陈涛, 王默耶, 陈晖*, 张竹青*, 2017
异质本地接触能量和多体相互作用对蛋白质折叠机制预测的影响, 张竹青*, 欧阳艳华, 陈涛, 2016
蛋白质折叠的过渡路径、扩散过程和预平衡, 张竹青, 陈晖*, 2012
本地-非本地耦合和非本地相互作用: 从粗粒度模型中提取的蛋白质折叠原理, 陈晖*, 张竹青, 斯特凡·沃林, 刘志荣, 2011
天然拓扑结构和非天然相互作用在天然和设计蛋白质的简单和复杂折叠动力学中的竞争, 张竹青, 陈晖*, 2010
基于结构和残基统计势的淀粉样纤维形成片段的识别, 张竹青, 陈浩, 赖陆华*, 2007
酵母朊病毒Sup35的GNNQQNY肽的寡聚体形成过程的分子动力学模拟, 张竹青, 陈浩, 白宏军, 赖陆华*, 2007

模拟计算构象变化生物大分子蛋白质折叠别构机制固有无序蛋白质结构特征功能关系相分离

张竹青 - 中国科学院大学

谢伟 - 中山大学

龚海鹏 - 清华大学

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