Professor | 丁晓明 | 数字化转型顾问

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Name	丁晓明
Contact Information	xmding74@fudan.edu.cn
Language ability	中文, 英语
Province	上海

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Name

丁晓明

Contact Information

xmding74@fudan.edu.cn

Language ability

中文, 英语

Province

上海

University/Lab Affiliation and Title	复旦大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	1996 - 学士学位: 武汉大学生命科学学院 2001 - 博士学位: 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
Work Experience	2002-2003 - 博士后研究: 诺丁汉大学女王医学中心 2003-2005 - 博士后研究: 阿伯丁大学医学科学研究所 2005-至今 - 讲师、副教授: 复旦大学生命科学学院

University/Lab Affiliation and Title

复旦大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

1996 - 学士学位: 武汉大学生命科学学院
2001 - 博士学位: 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所

Work Experience

2002-2003 - 博士后研究: 诺丁汉大学女王医学中心
2003-2005 - 博士后研究: 阿伯丁大学医学科学研究所
2005-至今 - 讲师、副教授: 复旦大学生命科学学院

Areas of Focus	微生物分子遗传学及代谢调控合成生物学
Publications	异源氧化还原伙伴支持Schlegelella brevitalea中EpoK催化依泊霉素B生物合成的高效催化, Liang J, Wang H, Bian X, Zhang Y, Zhao G, Ding X, 2020 基因簇重组使工程化Schlegelella brevitalea中依泊霉素产量提高, Yu Y, Wang H, Tang B, Liang J, Zhang L, Wang H, Bian X, Li YZ, Zhang Y, Zhao GP, Ding X, 2020 将'Polyangium brachysporum' DSM 7029重新分类为Schlegelella brevitalea sp. nov., Tang B, Yu Y, Liang J, Zhang Y, Bian X, Zhi X, Ding X, 2019 Burkholderiales菌株DSM 7029和Mycobacterium smegmatis mc2 155的高效环状基因敲除系统, Lei X, Fan Q, Huang T, Liu H, Zhao G, Ding X, 2019 通过phiBT1整合酶的attB序列偏好性证明丝氨酸整合酶的位点特异性, Lei X, Wang L, Zhao G, Ding X, 2018 通过基因组挖掘在Streptomyces sp.菌株fd1-xmd中鉴定链霉菌素和调节霉素生物合成基因簇, Yu Y, Tang B, Dai R, Zhang B, Chen L, Yang H, Zhao G, Ding X, 2018 通过亚抑制浓度的抗生素对Streptomyces coelicolor M145的形态工程, Wang H, Zhao G, Ding X, 2017 Burkholderiales菌株DSM 7029中依泊霉素的异源生产和产量提高, Bian X, Tang B, Yu Y, Tu Q, Gross F, Wang H, Li A, Fu J, Shen Y, Li YZ, Stewart AF, Zhao G, Ding X, Müller R, Zhang Y, 2017 RifZ (AMED_0655) 是Amycolatopsis mediterranei中利福霉素生物合成的途径特异性调节因子, Li C, Liu X, Lei C, Yan H, Shao Z, Wang Y, Zhao G, Wang J, Ding X, 2017 Bxb1整合酶作为快速代谢途径组装中的高效DNA重组酶, Wang X, Tang B, Ye Y, Mao Y, Lei X, Zhao G, Ding X, 2017 Streptomyces yangpuensis sp. nov., 从土壤中分离, Tang B, Yu Y, Zhi X, Yang L, Cen X, Zhao G, Ding X, 2016 依泊霉素生产菌株[Polyangium] brachysporum DSM 7029的全基因组序列, Tang B, Yu Y, Zhang Y, Zhao G, Ding X, 2015 NGSmirPlant: 植物小RNA转录组的全面表征, Bai J, Dan C, Zhang Y, Zhao G, Ding X, 2015 链霉菌噬菌体φBT1整合酶介导的位点特异性重组中的方向性控制, Zhang L, Zhu B, Dai R, Zhao G, Ding X, 2013 通过位点特异性重组进行S. coelicolor无标记突变的高效程序以提高次级代谢产物的过量生产, Zhang B, Zhang L, Dai R, Yu M, Zhao G, Ding X, 2013 通过体外位点特异性重组串联组装依泊霉素生物合成基因簇, Zhang L, Zhao G, Ding X, 2011 链霉菌噬菌体phiBT1整合酶介导的位点特异性重组过程中DNA切割与联会无关, Zhang L, Wang L, Wang J, Ou X, Zhao G, Ding X, 2010 利福霉素SV生产菌株Amycolatopsis mediterranei U32的全基因组序列揭示其在系统发育和代谢中的遗传特征, Zhao W, Zhong Y, Yuan H, Wang J, Zheng H, Wang Y, Cen X, Xu F, Bai J, Han X, Lu G, Zhu Y, Shao Z, Yan H, Li C, Peng N, Zhang Z, Zhang Y, Lin W, Fan Y, Qin Z, Hu Y, Zhu B, Wang S, Ding X, Zhao G, 2010

Areas of Focus

微生物分子遗传学及代谢调控
合成生物学

Publications

异源氧化还原伙伴支持Schlegelella brevitalea中EpoK催化依泊霉素B生物合成的高效催化, Liang J, Wang H, Bian X, Zhang Y, Zhao G, Ding X*, 2020
基因簇重组使工程化Schlegelella brevitalea中依泊霉素产量提高, Yu Y, Wang H, Tang B, Liang J, Zhang L, Wang H, Bian X, Li YZ, Zhang Y, Zhao GP*, Ding X*, 2020
将'Polyangium brachysporum' DSM 7029重新分类为Schlegelella brevitalea sp. nov., Tang B, Yu Y, Liang J, Zhang Y, Bian X, Zhi X*, Ding X*, 2019
Burkholderiales菌株DSM 7029和Mycobacterium smegmatis mc2 155的高效环状基因敲除系统, Lei X, Fan Q, Huang T, Liu H, Zhao G, Ding X*, 2019
通过phiBT1整合酶的attB序列偏好性证明丝氨酸整合酶的位点特异性, Lei X, Wang L, Zhao G, Ding X*, 2018
通过基因组挖掘在Streptomyces sp.菌株fd1-xmd中鉴定链霉菌素和调节霉素生物合成基因簇, Yu Y, Tang B, Dai R, Zhang B, Chen L, Yang H, Zhao G*, Ding X*, 2018
通过亚抑制浓度的抗生素对Streptomyces coelicolor M145的形态工程, Wang H, Zhao G*, Ding X*, 2017
Burkholderiales菌株DSM 7029中依泊霉素的异源生产和产量提高, Bian X, Tang B, Yu Y, Tu Q, Gross F, Wang H, Li A, Fu J, Shen Y, Li YZ, Stewart AF, Zhao G, Ding X*, Müller R*, Zhang Y*, 2017
RifZ (AMED_0655) 是Amycolatopsis mediterranei中利福霉素生物合成的途径特异性调节因子, Li C, Liu X, Lei C, Yan H, Shao Z, Wang Y, Zhao G, Wang J*, Ding X*, 2017
Bxb1整合酶作为快速代谢途径组装中的高效DNA重组酶, Wang X, Tang B, Ye Y, Mao Y, Lei X, Zhao G*, Ding X*, 2017
Streptomyces yangpuensis sp. nov., 从土壤中分离, Tang B, Yu Y, Zhi X, Yang L, Cen X, Zhao G*, Ding X*, 2016
依泊霉素生产菌株[Polyangium] brachysporum DSM 7029的全基因组序列, Tang B, Yu Y, Zhang Y*, Zhao G*, Ding X*, 2015
NGSmirPlant: 植物小RNA转录组的全面表征, Bai J, Dan C, Zhang Y, Zhao G*, Ding X*, 2015
链霉菌噬菌体φBT1整合酶介导的位点特异性重组中的方向性控制, Zhang L, Zhu B, Dai R, Zhao G*, Ding X*, 2013
通过位点特异性重组进行S. coelicolor无标记突变的高效程序以提高次级代谢产物的过量生产, Zhang B, Zhang L, Dai R, Yu M, Zhao G*, Ding X*, 2013
通过体外位点特异性重组串联组装依泊霉素生物合成基因簇, Zhang L, Zhao G*, Ding X*, 2011
链霉菌噬菌体phiBT1整合酶介导的位点特异性重组过程中DNA切割与联会无关, Zhang L, Wang L, Wang J, Ou X, Zhao G*, Ding X*, 2010
利福霉素SV生产菌株Amycolatopsis mediterranei U32的全基因组序列揭示其在系统发育和代谢中的遗传特征, Zhao W, Zhong Y, Yuan H, Wang J, Zheng H, Wang Y, Cen X, Xu F, Bai J, Han X, Lu G, Zhu Y, Shao Z, Yan H, Li C, Peng N, Zhang Z, Zhang Y, Lin W, Fan Y, Qin Z, Hu Y, Zhu B, Wang S*, Ding X*, Zhao G*, 2010

微生物遗传学代谢调控合成生物学依泊霉素生物合成基因簇链霉菌伯克霍尔德菌目 Dna重组基因组挖掘次级代谢产物

陶美凤 - 上海交通大学

杨敏 - 华中科技大学

黄雪年 - 中国科学院大学

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