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郑瑚
Zoology
中国科学院
北京
Language: 英语, 中文
基因组编辑
表观基因组
转录组
三维基因组
基因疗法
Crispr
Rna剪接
合成生物学
计算模型
Dna/Rna结合
Areas of Focus
- 开发基因组、表观基因组和转录组编辑和传感的新方法
- 开发三维基因组结构成像技术
- 研究发育和疾病中的三维基因组、表观基因组和转录组的变化
- 开发新型基因疗法
- 建立人工 DNA/RNA 结合蛋白和引导 RNA 设计的计算模型
Work Experience
- 2014年 - 加入美国杰克逊实验室，成为首批杰克逊学者之一
- 2015年7月 - 在杰克逊实验室及其后于亚利桑那州立大学建立独立实验室
Academic Background & Achievements
- 2014年 - 博士: 麻省理工学院，计算与系统生物学系
- 成就: 将H3K27ac鉴定为活性增强子的标志；分析了癌症转移及红细胞生成中的RNA选择性剪接；构建了CRISPR-on基因激活工具
Publications
- CRISPR RNA scaffold同时多功能转录组工程, Liu, Z., Jillette N., Robson, P., Cheng, A.W., 2023
- CRISPR介导的多重活细胞成像非重复基因组位点，每个位点一个引导RNA, Clow, P.A., Du, M., Jillette, N., Taghbalout, A., Zhu, J.J., Cheng, A.W., 2022
- 活细胞成像显示癌症中染色体外DNA元素的不均匀分离和转录活跃的染色体外DNA中心, Yi, E., Gujar, A.D., Guthrie, M., Kim, H., Zhao, D., Johnson K.C., Amin, S.B., Costa, M.L., Yu, Q., Das, S., Jillette, N., Clow, P.A., Cheng, A.W., Verhaak, R.G.W., 2022
- JACKIE: 快速枚举全基因组单拷贝和多拷贝CRISPR目标位点及其脱靶数量, Zhu, J.J., Cheng, A.W., 2022
- CRISPR人工剪接因子, Du, M., Jillette, N., Zhu, J.J., Li, S., Cheng, A.W., 2020
- C11orf95-RELA在顶盖上室管膜瘤中重编程3D表观基因组, Zhu, J.J., Jillette, N., Li X., Cheng, A.W., Lau C.C., 2020
- 通过Casilio-ME介导的RNA引导的甲基胞嘧啶氧化和DNA修复途径耦合增强CRISPR基于DNA去甲基化, Taghbalout, A., Du, M., Jillette, N., Rosikiewicz, W. Rath, A., Heinen, C., Li, S., Cheng, A.W., 2019
- 分裂可选择标记, Jillette, N., Du, M., Zhu, J.J., Cardoz, P., Cheng, A.W., 2019
- Casilio: 一种用于基因调控和基因组标记的多功能CRISPR-Cas9-Pumilio杂交体, Cheng, A.W., Jillette, N., Lee, P., Plaskon, D., Fujiwara, Y., Wang, W., Taghbalout, A., Wang, H., 2016
- Muscleblind-like 1 (Mbnl1)在终末红细胞生成期间调节pre-mRNA选择性剪接, Cheng, A.W., Shi, J., Wong, P., Luo, K.L., Trepman, P., Wang, E.T., Choi, H., Burge, C.B., Lodish, H.F., 2014
- 通过CRISPR-on，一个RNA引导的转录激活系统的内源基因多重激活, Cheng, A.W., Wang, H., Yang, H, Shi, L., Katz, Y., Theunissen, T.W., Rangarajan, S., Shivalila, C.S., Dadon, D.B., Jaenisch, R., 2013
- 通过CRISPR/Cas介导的基因组工程一步生成携带报告和条件等位基因的小鼠, Yang, H., Wang, H., Shivalila, C.S., Cheng, A.W., Shi, L., Jaenisch, R., 2013
- 通过CRISPR/Cas介导的基因组工程一步生成携带多基因突变的小鼠, Wang, H., Yang, H., Shivalila, C.S., Dawlaty, M.M., Cheng, A.W., Zhang, F., Jaenisch, R., 2013
- 细胞重编程期间的单细胞表达分析揭示了早期随机和晚期分层阶段, Buganim, Y., Faddah D.A., Cheng, A.W., Itskovich, E., Markoulaki, S., Gantz, K., Klemm S.L., van Oudenaarden A., Jaenisch, R., 2012
- 在人类乳腺癌中发生的EMT驱动的选择性剪接程序并调节细胞表型, Shapiro, I.M., Cheng, A.W., Flytzanis, N.C., Balsamo, M., Condeelis, J.S., Oktay, M.H., Burge, C.B., Gertler, F.B., 2011
- 组蛋白H3K27ac将活性增强子与待激活增强子分开并预测发育状态, Creyghton, M.P., Cheng A.W., Welstead, G.G., Kooistra, T., Carey, B.W., Steine, E.J., Hanna, J., Lodato, M.A., Frampton, G.M., Sharp, P.A., Boyer, L.A., Young, R.A., Jaenisch, R., 2010
