Professor | 宿菲 | 数字化转型顾问

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Name	宿菲
Contact Information	sufei0999@ems.hrbmu.edu.cn
Language ability	英语, 中文
Province	黑龙江

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Name

宿菲

Contact Information

sufei0999@ems.hrbmu.edu.cn

Language ability

英语, 中文

Province

黑龙江

University/Lab Affiliation and Title	哈尔滨医科大学
Faculty	College of Bioinformatics Science and Technology
Academic Background & Achievements	2019-2020 博士后：美国西奈山医学院 2014-2017 博士：哈尔滨医科大学，生物医学工程 2005-2008 硕士：哈尔滨医科大学，生物医学工程 1999-2003 学士：哈尔滨理工大学，电子信息工程发表SCI论文30余篇，其中第一作者10余篇
Work Experience	2022-09至今 - 哈尔滨医科大学 - 生物信息学教研室教授 2019-08至2020-08 - 美国西奈山医学院 - 博士后研究员 2016-09至2022-09 - 哈尔滨医科大学 - 生物信息学教研室副教授 2008-09至2016-09 - 哈尔滨医科大学 - 生物信息学教研室讲师 2003-07至2008-09 - 哈尔滨医科大学 - 助教
Awards	2023年：美国大学生数学建模国际二等奖2项 2022年：美国大学生数学建模国际二等奖1项

University/Lab Affiliation and Title

哈尔滨医科大学

Faculty

College of Bioinformatics Science and Technology

Academic Background & Achievements

2019-2020 博士后：美国西奈山医学院
2014-2017 博士：哈尔滨医科大学，生物医学工程
2005-2008 硕士：哈尔滨医科大学，生物医学工程
1999-2003 学士：哈尔滨理工大学，电子信息工程
发表SCI论文30余篇，其中第一作者10余篇

Work Experience

2022-09至今 - 哈尔滨医科大学 - 生物信息学教研室教授
2019-08至2020-08 - 美国西奈山医学院 - 博士后研究员
2016-09至2022-09 - 哈尔滨医科大学 - 生物信息学教研室副教授
2008-09至2016-09 - 哈尔滨医科大学 - 生物信息学教研室讲师
2003-07至2008-09 - 哈尔滨医科大学 - 助教

Awards

2023年：美国大学生数学建模国际二等奖2项
2022年：美国大学生数学建模国际二等奖1项

Areas of Focus	单细胞测序转录调控机制
Publications	基于决策树联合评分算法的恶性胶质母细胞瘤早期诊断分子标志物循环miRNA的识别。, 宿菲, 刘岳阳, 宗永华, 高子瑜, 周桂琴, 邓超, 刘玉玉, 曾悦, 马晓燕, 王永霞, 吴银伟, 徐福生, 关丽丽, 刘宝泉。, 2023 优先选择关键协同循环microRNA用于胆道癌的早期诊断。, 宿菲, 高子瑜, 刘岳阳, 周桂琴, 高伟, 邓超, 刘玉玉, 张一豪, 马晓燕, 王永霞, 关丽丽, 张亚芳, 刘宝泉。, 2022 整合组织和血液miRNA表达谱识别新型生物标志物用于乳腺癌的准确无创诊断：初步结果和未来临床意义。, 宿菲, 高子瑜, 刘岳阳, 周桂琴, 崔颖, 邓超, 刘玉玉, 张一豪, 马晓燕, 王永霞, 关丽丽, 张亚芳, 刘宝泉。, 2022 血清microRNA-21预测接受新辅助化疗联合曲妥珠单抗治疗的HER2阳性乳腺癌患者的治疗结果和生存。, 刘宝泉, 宿菲, 吕晓, 张伟, 尚晓, 张亚。, 2019 共功能子通路由具有共同基序、共同家族或共同的转录因子调控。, 宿菲, 尚德, 徐阳, 冯丽, 杨慧, 刘宝泉, 宿苏, 陈丽, 李晓。, 2015 SCARA5通过失活ERK1/2、STAT3和AKT信号通路在乳腺癌的进展和转移中起关键作用。, 尤凯, 宿菲, 刘丽, 吕晓, 张杰, 张亚, 刘宝泉。, 2017 血清miR-21和miR-125b作为预测II/III期乳腺癌新辅助化疗反应和预后的标志物。, 刘宝泉, 宿菲, 陈明, 李阳, 齐晓, 肖建, 李晓, 刘晓, 梁伟, 张亚, 张杰。, 2017 新辅助化疗期间血清miR34a表达的变化预测II/III期乳腺癌的治疗反应和预后。, 刘宝泉, 宿菲, 李阳, 齐晓, 刘晓, 梁伟, 尤凯, 张亚, 张杰。, 2017 VEGF-D、SMAD和SMAD7的表达及其与结肠癌淋巴管生成和预后的关系。, 宿菲, 李晓, 尤凯, 陈明, 肖建, 张亚, 马建, 刘宝泉。, 2016 VEGF-A、C和D表达与乳腺癌淋巴结受累的关系：一项荟萃分析。, 宿菲, 刘宝泉, 陈明, 肖建, 李晓, 吕晓, 马建, 尤凯, 张杰, 张亚。, 2016 患者特异性子通路活动的推断揭示了与乳腺癌患者预后相关的功能特征。, 韩杰, 刘苏, 姜阳, 徐成, 郑波, 姜明, 杨慧, 宿菲, 李成, 张亚。, 2018 LncRNA连接图：使用LncRNA签名连接小分子、LncRNA和疾病。, 杨海秀, 尚德, 徐艳君, 张春龙, 李峰, 孙泽国, 石新瑞, 张云鹏, 韩俊伟, 宿菲, 李春泉, 李晓。, 2017 BioM2MetDisease：一个手动整理的数据库，用于microRNA、代谢物、小分子和代谢疾病之间的关联。, 徐艳君, 杨海秀, 吴谭, 董群, 孙泽国, 尚德, 李峰, 徐颖琪, 宿菲, 刘思瑶, 张云鹏, 李晓。, 2017 通过整合癌症基因组学数据和蛋白质相互作用组数据识别三阴性乳腺癌患者的新型预后指标。, 张凡, 任春艳, 赵恒强, 杨磊, 宿菲, 周明明, 韩俊伟, Eric A. Sobie, Martin J. Walsh。, 2016 LncRNAs2Pathways：基于全局网络传播方法识别受一组感兴趣的lncRNA影响的通路。, 韩杰, 刘苏, 孙泽, 张亚, 张凡, 张春, 尚德, 杨慧, 宿菲, 徐艳, 李成, 任红, 李晓。, 2017 食管癌亚型的lncRNA参与的功能模块的识别。, 李思, 徐艳, 孙泽, 冯丽, 尚德, 张春, 石新瑞, 韩杰, 宿菲, 杨慧, 赵建, 宋成, 张亚, 李成, 李晓。, 2016 Subpathway-LNCE：通过整合lncRNA-mRNA表达谱和通路拓扑结构识别由lncRNA竞争调控的功能失调子通路。, 石新瑞, 徐艳君, 张春龙, 冯丽, 孙泽国, 韩俊伟, 宿菲, 张云鹏, 李。, 2016 基于通路内效应的全局影响和通路间串扰的新型失调通路识别分析。, 韩杰, 李成, 杨慧, 徐艳, 张春, 马建, 石新瑞, 刘伟, 尚德, 姚琦, 张亚, 宿菲, 冯丽, 李晓。, 2015 ESEA基于边集富集分析发现失调通路。, 韩杰, 石新瑞, 张亚, 徐艳, 姜阳, 张春, 冯丽, 杨慧, 尚德, 孙泽, 宿菲, 李春泉, 李晓。, 2015 基于多组学复合网络的疾病候选代谢物的全球优先排序。, 姚千兰, 徐艳君, 杨海秀, 尚德, 张春龙, 张云鹏, 孙泽国, 石新瑞, 李峰, 韩俊伟, 宿菲, 李春泉, 李晓。, 2015 在匹配的miRNA-mRNA表达数据中识别亚型特异性miRNA-mRNA功能调控模块，以多发性骨髓瘤为例。, 张亚, 刘伟, 徐艳, 李成, 王阳, 杨慧, 张春, 宿菲, 李阳, 李晓。, 2015 Subpathway-GMir通过整合条件特异性基因、microRNA和通路拓扑结构识别miRNA介导的代谢子通路。, 冯丽, 徐艳, 张亚, 孙泽, 韩杰, 张春, 杨慧, 尚德, 宿菲, 石新瑞, 李思, 李成, 李晓。, 2015 lncRNA及其结合蛋白网络的全局视图。, 尚德, 杨慧, 徐艳, 姚琦, 周伟, 石新瑞, 韩杰, 宿菲, 宿宝, 张春, 李成, 李晓。, 2014 MPINet代谢物通路识别通过耦合全球代谢物网络结构和代谢组学谱。, 李峰, 徐艳, 尚德, 杨慧, 刘伟, 韩杰, 孙泽, 姚琦, 张春, 马建, 宿菲, 冯丽, 石新瑞, 张亚, 李建, 顾强, 李晓, 李成。, 2014 基于代谢通路背景下代谢物之间的全球功能关系优先选择候选疾病代谢物。, 尚德, 李成, 姚琦, 杨慧, 徐艳, 韩杰, 李建, 宿菲, 张亚, 张春, 李东, 李晓。, 2014 通过整合样本匹配的miRNA-mRNA谱和通路结构检测由miRNA调控的风险通路。, 李建, 李成, 韩杰, 张春, 尚德, 姚琦, 张亚, 张春, 李东, 李晓。, 2014 分子网络的等位基因特异性行为：理解酵母中小分子药物反应。, 张凡, 高博, 徐磊, 李成, 郝东, 张世, 周明, 宿菲, 陈晓, 支红, 李晓。, 2013 通过定向随机游走拓扑推断风险活性通路以实现精确的癌症分类。, 刘伟, 李成, 徐艳, 杨慧, 姚琦, 韩杰, 尚德, 张春, 宿菲, 李晓, 肖阳, 张凡, 戴明, 李晓。, 2013

Areas of Focus

单细胞测序
转录调控机制

Publications

基于决策树联合评分算法的恶性胶质母细胞瘤早期诊断分子标志物循环miRNA的识别。, 宿菲, 刘岳阳, 宗永华, 高子瑜, 周桂琴, 邓超, 刘玉玉, 曾悦, 马晓燕, 王永霞, 吴银伟, 徐福生, 关丽丽, 刘宝泉。, 2023
优先选择关键协同循环microRNA用于胆道癌的早期诊断。, 宿菲, 高子瑜, 刘岳阳, 周桂琴, 高伟, 邓超, 刘玉玉, 张一豪, 马晓燕, 王永霞, 关丽丽, 张亚芳, 刘宝泉。, 2022
整合组织和血液miRNA表达谱识别新型生物标志物用于乳腺癌的准确无创诊断：初步结果和未来临床意义。, 宿菲, 高子瑜, 刘岳阳, 周桂琴, 崔颖, 邓超, 刘玉玉, 张一豪, 马晓燕, 王永霞, 关丽丽, 张亚芳, 刘宝泉。, 2022
血清microRNA-21预测接受新辅助化疗联合曲妥珠单抗治疗的HER2阳性乳腺癌患者的治疗结果和生存。, 刘宝泉, 宿菲, 吕晓, 张伟, 尚晓, 张亚。, 2019
共功能子通路由具有共同基序、共同家族或共同的转录因子调控。, 宿菲, 尚德, 徐阳, 冯丽, 杨慧, 刘宝泉, 宿苏, 陈丽, 李晓。, 2015
SCARA5通过失活ERK1/2、STAT3和AKT信号通路在乳腺癌的进展和转移中起关键作用。, 尤凯, 宿菲, 刘丽, 吕晓, 张杰, 张亚, 刘宝泉。, 2017
血清miR-21和miR-125b作为预测II/III期乳腺癌新辅助化疗反应和预后的标志物。, 刘宝泉, 宿菲, 陈明, 李阳, 齐晓, 肖建, 李晓, 刘晓, 梁伟, 张亚, 张杰。, 2017
新辅助化疗期间血清miR34a表达的变化预测II/III期乳腺癌的治疗反应和预后。, 刘宝泉, 宿菲, 李阳, 齐晓, 刘晓, 梁伟, 尤凯, 张亚, 张杰。, 2017
VEGF-D、SMAD和SMAD7的表达及其与结肠癌淋巴管生成和预后的关系。, 宿菲, 李晓, 尤凯, 陈明, 肖建, 张亚, 马建, 刘宝泉。, 2016
VEGF-A、C和D表达与乳腺癌淋巴结受累的关系：一项荟萃分析。, 宿菲, 刘宝泉, 陈明, 肖建, 李晓, 吕晓, 马建, 尤凯, 张杰, 张亚。, 2016
患者特异性子通路活动的推断揭示了与乳腺癌患者预后相关的功能特征。, 韩杰, 刘苏, 姜阳, 徐成, 郑波, 姜明, 杨慧, 宿菲, 李成, 张亚。, 2018
LncRNA连接图：使用LncRNA签名连接小分子、LncRNA和疾病。, 杨海秀, 尚德, 徐艳君, 张春龙, 李峰, 孙泽国, 石新瑞, 张云鹏, 韩俊伟, 宿菲, 李春泉, 李晓。, 2017
BioM2MetDisease：一个手动整理的数据库，用于microRNA、代谢物、小分子和代谢疾病之间的关联。, 徐艳君, 杨海秀, 吴谭, 董群, 孙泽国, 尚德, 李峰, 徐颖琪, 宿菲, 刘思瑶, 张云鹏, 李晓。, 2017
通过整合癌症基因组学数据和蛋白质相互作用组数据识别三阴性乳腺癌患者的新型预后指标。, 张凡, 任春艳, 赵恒强, 杨磊, 宿菲, 周明明, 韩俊伟, Eric A. Sobie, Martin J. Walsh。, 2016
LncRNAs2Pathways：基于全局网络传播方法识别受一组感兴趣的lncRNA影响的通路。, 韩杰, 刘苏, 孙泽, 张亚, 张凡, 张春, 尚德, 杨慧, 宿菲, 徐艳, 李成, 任红, 李晓。, 2017
食管癌亚型的lncRNA参与的功能模块的识别。, 李思, 徐艳, 孙泽, 冯丽, 尚德, 张春, 石新瑞, 韩杰, 宿菲, 杨慧, 赵建, 宋成, 张亚, 李成, 李晓。, 2016
Subpathway-LNCE：通过整合lncRNA-mRNA表达谱和通路拓扑结构识别由lncRNA竞争调控的功能失调子通路。, 石新瑞, 徐艳君, 张春龙, 冯丽, 孙泽国, 韩俊伟, 宿菲, 张云鹏, 李。, 2016
基于通路内效应的全局影响和通路间串扰的新型失调通路识别分析。, 韩杰, 李成, 杨慧, 徐艳, 张春, 马建, 石新瑞, 刘伟, 尚德, 姚琦, 张亚, 宿菲, 冯丽, 李晓。, 2015
ESEA基于边集富集分析发现失调通路。, 韩杰, 石新瑞, 张亚, 徐艳, 姜阳, 张春, 冯丽, 杨慧, 尚德, 孙泽, 宿菲, 李春泉, 李晓。, 2015
基于多组学复合网络的疾病候选代谢物的全球优先排序。, 姚千兰, 徐艳君, 杨海秀, 尚德, 张春龙, 张云鹏, 孙泽国, 石新瑞, 李峰, 韩俊伟, 宿菲, 李春泉, 李晓。, 2015
在匹配的miRNA-mRNA表达数据中识别亚型特异性miRNA-mRNA功能调控模块，以多发性骨髓瘤为例。, 张亚, 刘伟, 徐艳, 李成, 王阳, 杨慧, 张春, 宿菲, 李阳, 李晓。, 2015
Subpathway-GMir通过整合条件特异性基因、microRNA和通路拓扑结构识别miRNA介导的代谢子通路。, 冯丽, 徐艳, 张亚, 孙泽, 韩杰, 张春, 杨慧, 尚德, 宿菲, 石新瑞, 李思, 李成, 李晓。, 2015
lncRNA及其结合蛋白网络的全局视图。, 尚德, 杨慧, 徐艳, 姚琦, 周伟, 石新瑞, 韩杰, 宿菲, 宿宝, 张春, 李成, 李晓。, 2014
MPINet代谢物通路识别通过耦合全球代谢物网络结构和代谢组学谱。, 李峰, 徐艳, 尚德, 杨慧, 刘伟, 韩杰, 孙泽, 姚琦, 张春, 马建, 宿菲, 冯丽, 石新瑞, 张亚, 李建, 顾强, 李晓, 李成。, 2014
基于代谢通路背景下代谢物之间的全球功能关系优先选择候选疾病代谢物。, 尚德, 李成, 姚琦, 杨慧, 徐艳, 韩杰, 李建, 宿菲, 张亚, 张春, 李东, 李晓。, 2014
通过整合样本匹配的miRNA-mRNA谱和通路结构检测由miRNA调控的风险通路。, 李建, 李成, 韩杰, 张春, 尚德, 姚琦, 张亚, 张春, 李东, 李晓。, 2014
分子网络的等位基因特异性行为：理解酵母中小分子药物反应。, 张凡, 高博, 徐磊, 李成, 郝东, 张世, 周明, 宿菲, 陈晓, 支红, 李晓。, 2013
通过定向随机游走拓扑推断风险活性通路以实现精确的癌症分类。, 刘伟, 李成, 徐艳, 杨慧, 姚琦, 韩杰, 尚德, 张春, 宿菲, 李晓, 肖阳, 张凡, 戴明, 李晓。, 2013

单细胞测序转录调控机制生物信息学癌症 Microrna Lncrna 诊断

白静 - 哈尔滨医科大学

许艳军 - 哈尔滨医科大学

Area of Focus
非编码Rna | 癌症 | 调控 | 功能 | 肿瘤 | 耐药 | 单细胞 | 数据分析 | 生物信息学 | 基因组学

鲁健平 - 哈尔滨医科大学

Area of Focus
生物信息学 | 多组学 | 数据整合 | 染色质 | 表观遗传学 | 调控 | 单细胞 | 免疫细胞 | 生物学机制 | 分析

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