Professor | 宋晓元 | 数字化转型顾问

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Name	宋晓元
Contact Information	songxy5@ustc.edu.cn
Language ability	英语, 中文
Province	安徽

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Name

宋晓元

Contact Information

songxy5@ustc.edu.cn

Language ability

英语, 中文

Province

安徽

University/Lab Affiliation and Title	中国科学技术大学
Faculty	Life Sciences
Academic Background & Achievements	1996年 - 生物学学士学位: 北京师范大学 1999年 - 生物学硕士学位: 北京师范大学 2006年 - 分子、细胞和发育生物学博士学位: 美国罗彻斯特大学加州大学圣地亚哥分校博士后研究获得癌症研究所博士后奖学金
Work Experience	2012年至今 - 中国科学技术大学 - 副教授
Awards	癌症研究所博士后奖学金

University/Lab Affiliation and Title

中国科学技术大学

Faculty

Life Sciences

Academic Background & Achievements

1996年 - 生物学学士学位: 北京师范大学
1999年 - 生物学硕士学位: 北京师范大学
2006年 - 分子、细胞和发育生物学博士学位: 美国罗彻斯特大学
加州大学圣地亚哥分校博士后研究
获得癌症研究所博士后奖学金

Work Experience

2012年至今 - 中国科学技术大学 - 副教授

Awards

癌症研究所博士后奖学金

Areas of Focus	三维空间转录调控在脑衰老中的作用 lncRNA和染色质相互作用在减数分裂和精子发生过程中的转录调控作用
Publications	基于机器学习和scRNA-Seq的诊断和预后模型，说明肺腺癌的生存和治疗反应。, Cheng Q., Zhao W., Song X., Jin T., 2024 piR-36249和DHX36通过上调OAS2共同抑制睾丸癌细胞的进展。, Wang Q.#, Chen P.#, Wang X.#, Wu Y., Xia K., Mu X., Xuan Q., Xiao J., He Y., Liu W., Song X., Sun F, 2023 NicE-C高效揭示开放染色质相关的染色体相互作用。, Luo Z.#, Zhang R.#, Hu T.#, Zhu Y., Wu Y., Li W., Zhang Z., Yao X., Liang H., Song X., 2022 长链非编码RNA Synage调节小脑中的突触稳定性和神经元功能。, Wang F.#, Wang Q.#, Liu B.#, Mei L., Ma S., Wang S., Wang R., Zhang Y., Niu C., Xiong Z., Zheng Y., Zhang Z., Shi J., Song X., 2021 RGL2作为年龄依赖性因子调节结肠癌的进展。, Cheng Q., Wu Y, Xia H., Song X., 2021 大核染色体的重排对应于四膜虫微核染色体的TAD样结构。, Luo Z.#, Hu T. , Jiang H., Wang R., Xu Q., Zhang S., Cao J., Song X., 2020 重组的3D基因组结构支持小鼠精子发生中的转录调控。, Luo Z.#, Wang X.#, Jiang H.#, Wang R.#, Chen J., Chen Y., Xu Q., Cao J., Gong X., Wu J., Yang Y., Li W., Han C., Cheng YC., Rosenfeld MG., Sun F., Song X., 2020 体内逆转录转座子元素的时间移动的新见解。, Ghanam AR., Cao J., Ouyang X., and Song X., 2019 基于长链非编码RNA簇的基因组位点维持适当的发育和视觉功能。, Wang F.#, Ren D.#, Liang X.#, Ke S., Zhang B., Hu B., Song X., Wang X., 2019 CYC2在四膜虫减数分裂中的关键作用。, Xu Q.#, Wang R.#, Ghanam AR., Yan G., Miao W., Song X., 2016 转录的三维调控。, Cao J., Luo Z., Cheng Q., Xu Q., Zhang Y., Wang F., Wu Y., Song X., 2015 一种必需的嵌合H2A变体的非组蛋白N端尾调节有丝分裂H3-S10去磷酸化。, Song X., Bowen J., Miao W., Liu Y., and Gorovsky MA., 2012 来自CCND1启动子的启动子相关非编码RNA。, Song X.#, Wang X.#, Arai S. and Kurokawa R., 2012 与冠状动脉疾病相关的9p21 DNA变体损害干扰素-γ信号响应。, Harismendy O.#, Notani D.#, Song X., Rahim NG., Tanasa B., Heintzman N., Ren B., Fu XD., Topol EJ., Rosenfeld MG, and Frazer KA, 2011 长链非编码RNA的长臂：作为传感器调节基因转录程序的角色。, Wang X.# and Song X.#, Glass CK., and Rosenfeld MG, 2011 诱导的ncRNA顺式变构修饰RNA结合蛋白以抑制转录。, Wang X., Arai S.%, Song X.%, Reichart D., Du K., Pascual G., Tempst P., Rosenfeld MG.#, Glass CK.#, and Kurokawa R.#, 2008 SQ H2A.X基序的磷酸化对于四膜虫的适当减数分裂和有丝分裂是必需的。, Song, X.#, Gjoneska E.#, Ren Q.#, Taverna SD., Allis C.D., and Gorovsky MA., 2007 未磷酸化的H1在饥饿期间CDC2下调时富集于启动子的特定区域。, Song X. and Gorovsky MA., 2007 一种强大的可诱导-可抑制启动子极大地促进了四膜虫中同源和异源基因的基因敲除、条件表达和过表达。, Shang Y., Song X., Bowen J., Corstanje R., Gao Y., Gaertig J., and Gorovsky MA.*, 2002

Areas of Focus

三维空间转录调控在脑衰老中的作用
lncRNA和染色质相互作用在减数分裂和精子发生过程中的转录调控作用

Publications

基于机器学习和scRNA-Seq的诊断和预后模型，说明肺腺癌的生存和治疗反应。, Cheng Q., Zhao W., Song X.*, Jin T.*, 2024
piR-36249和DHX36通过上调OAS2共同抑制睾丸癌细胞的进展。, Wang Q.#, Chen P.#, Wang X.#, Wu Y., Xia K., Mu X., Xuan Q., Xiao J., He Y., Liu W., Song X.*, Sun F*, 2023
NicE-C高效揭示开放染色质相关的染色体相互作用。, Luo Z.#, Zhang R.#, Hu T.#, Zhu Y., Wu Y., Li W., Zhang Z., Yao X., Liang H., Song X.*, 2022
长链非编码RNA Synage调节小脑中的突触稳定性和神经元功能。, Wang F.#, Wang Q.#, Liu B.#, Mei L., Ma S., Wang S., Wang R., Zhang Y., Niu C., Xiong Z., Zheng Y., Zhang Z., Shi J., Song X.*, 2021
RGL2作为年龄依赖性因子调节结肠癌的进展。, Cheng Q., Wu Y, Xia H.*, Song X.*, 2021
大核染色体的重排对应于四膜虫微核染色体的TAD样结构。, Luo Z.*#, Hu T. *, Jiang H., Wang R., Xu Q., Zhang S., Cao J., Song X.*, 2020
重组的3D基因组结构支持小鼠精子发生中的转录调控。, Luo Z.#, Wang X.#, Jiang H.#, Wang R.#, Chen J., Chen Y., Xu Q., Cao J., Gong X., Wu J., Yang Y., Li W., Han C., Cheng YC., Rosenfeld MG., Sun F.*, Song X.*, 2020
体内逆转录转座子元素的时间移动的新见解。, Ghanam AR., Cao J., Ouyang X., and Song X.*, 2019
基于长链非编码RNA簇的基因组位点维持适当的发育和视觉功能。, Wang F.#, Ren D.#, Liang X.#, Ke S., Zhang B., Hu B.*, Song X.*, Wang X.*, 2019
CYC2在四膜虫减数分裂中的关键作用。, Xu Q.#, Wang R.#, Ghanam AR., Yan G., Miao W., Song X.*, 2016
转录的三维调控。, Cao J., Luo Z., Cheng Q., Xu Q., Zhang Y., Wang F., Wu Y., Song X.*, 2015
一种必需的嵌合H2A变体的非组蛋白N端尾调节有丝分裂H3-S10去磷酸化。, Song X., Bowen J., Miao W., Liu Y., and Gorovsky MA.*, 2012
来自CCND1启动子的启动子相关非编码RNA。, Song X.#, Wang X.#, Arai S. and Kurokawa R.*, 2012
与冠状动脉疾病相关的9p21 DNA变体损害干扰素-γ信号响应。, Harismendy O.#, Notani D.#, Song X., Rahim NG., Tanasa B., Heintzman N., Ren B., Fu XD., Topol EJ., Rosenfeld MG*, and Frazer KA*, 2011
长链非编码RNA的长臂：作为传感器调节基因转录程序的角色。, Wang X.# and Song X.#, Glass CK., and Rosenfeld MG*, 2011
诱导的ncRNA顺式变构修饰RNA结合蛋白以抑制转录。, Wang X., Arai S.%, Song X.%, Reichart D., Du K., Pascual G., Tempst P., Rosenfeld MG.#, Glass CK.#, and Kurokawa R.#, 2008
SQ H2A.X基序的磷酸化对于四膜虫的适当减数分裂和有丝分裂是必需的。, Song, X.#, Gjoneska E.#, Ren Q.#, Taverna SD., Allis C.D., and Gorovsky MA.*, 2007
未磷酸化的H1在饥饿期间CDC2下调时富集于启动子的特定区域。, Song X. and Gorovsky MA.*, 2007
一种强大的可诱导-可抑制启动子极大地促进了四膜虫中同源和异源基因的基因敲除、条件表达和过表达。, Shang Y., Song X., Bowen J., Corstanje R., Gao Y., Gaertig J., and Gorovsky MA.*, 2002

三维基因组转录调控脑衰老 Lncrna 染色质相互作用减数分裂精子发生基因表达表观遗传学神经生物学

李兴旺 - 华中农业大学

李礼 - 华中农业大学

邢宇航 - 中国科学技术大学

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