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徐沁
Life Science
上海交通大学
上海
Language: 英语, 汉语
分子模拟
蛋白质复合物
催化机制
结构功能关系
调控原理
计算方法
数据分析
分子动力学
蛋白质相互作用
统计建模
Areas of Focus
- 计算结构生物学
- 生物物理学
- 生物统计学
Work Experience
- 2010-2012 田纳西大学/橡树岭国家实验室分子生物物理中心博士后研究
- 2013至今 上海交通大学生命科学技术学院副研究员
- 2018年兼职浙江大学台州研究院材料科学与技术研究所特聘研究员
- 2019年兼职上海交通大学-耶鲁大学生物统计和数据科学联合中心研究员
Academic Background & Achievements
- 2001 北京大学生物学士学位
- 2008 美国田纳西大学生物博士学位
- 2009 美国田纳西大学统计学硕士学位
Publications
- 拟南芥丝氨酸/苏氨酸激酶1（SIK1）的磷酸化通过变构调节机制, 穆俊玺, 周佳丽, 龚青秋, 徐沁, 2022
- SPVec：一种受Word2vec启发的药物-靶点相互作用预测特征表示方法, 张玉芳, 王相庚, Aman Chandra Kaushik, 褚燕怡, 单晓琪, 赵明珠, 徐沁, 魏东青, 2020
- 蛋白酶结构域中Cys22和Cys27之间的二硫键调节凝血因子X的凝血活性, 李芳, 陈长明, 曲思颖, 赵明珠, 谢小玲, 吴曦, 李磊, 王雪峰, 丁秋兰, 徐沁, 魏东青, 吴文满, 2019
- 微生物代谢物的细胞内浓度的理论研究, 杨海峰, 张晓南, 李燕, 张永红, 徐沁, 魏东青, 2017
- 胆固醇与C99多个位点的动态结合：通过粗粒化和全原子模拟揭示, 李成东, 徐沁, 顾若旭, 屈静, 魏东青, 2017
- 单价离子通过分子动力学模拟探索的被动跨膜渗透机制, 张慧媛, 徐沁, 王玉坤, 赵堂镇, 胡丹, 魏东青, 2016
- 通过分子动力学模拟用新药候选物wgx-50破坏阿尔茨海默病Aβ42原纤维的稳定性, 范怀孟, 顾若旭, 王艳静, 皮云龙, 张永红, 徐沁, 魏东青, 2015
- 蛋白质赖氨酸甲基转移酶的QM/MM自由能模拟洞察：写入表观遗传标记的能量三元组, 徐沁, 褚玉卓, 郭浩波, 史杰瑞米, 郭洪, 2009
- 底物辅助催化和特异性中动力学的重要性, 徐沁, 郭浩波, 亚历山大·沃达韦尔, 郭洪, 2006
- 胞嘧啶脱氨酶紧密结合近完美过渡态类似物的起源：对酶催化的启示, 郭浩波, 饶宁, 徐沁, 郭洪, 2005
Awards
- 2017.10 浙江台州市“500精英”人才
